Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Yebra (2010)
Title HIV-1 non-B subtypes: high transmitted NNRTI-resistance in Spain and impaired genotypic resistance interpretation due to variability.
Citation Antiviral Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 218
NumPts 218
Subtype B, CRF02_AG, G, F, C, CRF12_BF, CRF20_BG, A, CRF24_BG, CRF11_cpx, CRF06_cpx


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 218 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
104570 01SP104570 None None   V35I, T69TA, R83K, I135T, K166R, P170PS, I202V, R211K, A272P, K277R, T286TA, Q334H K20*R, E29EQ, K49KEIV, V60IM, K103KI, Y146YC 
106255 03SP0106255 None None   V35T, R83K, D123E, I178L, A272P, K277R, E297AV  
107620 03SP00107620 None None   V35T, E40D, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, Q197E, T200A, I202V, Q207E  
123337 03SP00123337 None None   K20R, V60I, K104R, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
132768 03SP00132768 None None   P4S, V35T, D121Y, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, Q207E  
137365 03SP0137365 None None   P4S, V35T, K43R, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, R211K, V245E, A272P, K277R, V292I, E297K, V317A  
138408 03SP00138408 None None   M16V, K20R, V35T, S68G, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K  
138416 03SP00138416 None None   V35T, V60I, K104R, D121H, K122E, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207A, R211K  
138418 03SP00138418 None None   V35T, E40G, D121H, K122E, D123E, I135T, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211K, F214L L34F, H96T 
13844 03SP0013844 None None   P4S, I31L, V35T, K43R, V60I, A98S, K122E, D123S  
154686 04SP154686 None None  K103N K20R, V90I, V118I, D123E, R211RK, F214L, A272P, I293V, K311KR  
164375 04SP164375 None None  V179VF K11R, K20R, S162C, T200I, I257IV, A272P, K277R, R284RK, T286A, A288AS, K311KT, V314VA, A327AS, I329IV Y146YC, P150PA, R172RI, W229WS, K263KPQT, A267AS, S268SR, Y318YC, K323KN, Q330QL 
171194 04SP171194 None None   K122KE, G196E, T200TA, Q207H, R211K, K277KR, L283I, T286TP, I293V, T296TS, E297K, K311R, L325I  
172935 04SP172935 None None   E28EA, Q174QE, G196GE, T200E, R211G, T286A, T296S, E297K, S322A, A327V K32KNRS 
173815 04SP0173815 None None   V35T, T39TS, E40ED, V60I, K103KR, K122E, I135T, I142V, F214L, A272P, T286TA, E297K  
173816 04SP0173816 None None  K103N V35T, T39I, I135V, K166R, T200K, F214L, A272P, V276I, K281R, T286A, E297K, S322T, I329L  
173817 04SP0173817 None None   V35T, K49R, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, V179I, Q207E, R211K, V245E, S251N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297V, I329V  
173823 04SP0173823 None None   K20R, K49R, I50V, V60I, T107S, D123E, K166R, D177G, T200E, Q207N, R211K, V245Q, A272P, A288T, I293V, E297A, I329L  
173824 04SP0173824 None None   V60I, K102Q, D123DE, I142V, K166R, V245Q, A272P, T286A  
173825 04SP0173825 None None   S68G, V90I, K122KE, S162A, T200A, R211K, V245EK, K277R, V292I, I293V, Q334E  
173826 04SP0173826 None None   K122E, I142V, S162H, K166KQR, T200I, E204Q, Q207E, R211K, A272G, R284K, E297A, K311R  
173827 04SP0173827 None None   S68G, K122I, I135R, Q174K, R211RG, A272P, K277R, T286A, E297K, A304E, I326V, A327V, Q334Y  
173828 04SP0173828 None None   K20R, V106I, D123E, S162C, R172RK, P176T, D177N, I178L, F214L, V245I, A272P, K277Q, T286A, I293V, I326V, I329V, Q334R  
173829 04SP0173829 None None   E6EG, V60I, I142V, S162A, Q207E, K277R, T286A, I293V, I326M  
173830 04SP0173830 None None   I135T, I195T, R211T, F214L, E248D, A272P, K277R, K281R, T286A, E297K, Q334H  
175676 04SP175676 None None   V60I, A98S, I135V, E169D, A272P  
175705 04SP00175705 None None   V35T, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211S, E224D  
175959 04SP175959 None None   I135L, V179A, R211K, A272P, T286A, I293V, E297A, Q334L  
176984 04SP176984 None None   V35I, R83K, D123E, D177E, G196E, E204Q, Q207A, L283I, I293V, E297A, S322T  
182986 04SP00182986 None None   P4X, I5X, E6X, T7X, V8X, P9X, V10X, K11X, L12X, K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, P19X, K20X, V21X, K22X, Q23X, W24X, V35T, T39L, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200E, Q207G, R211K  
184104 07SP0184104 None None   V35T, T39A, E40D, K122R, D123E, I135L, S162SADY, K173IT, Q174K, I195L, T200E, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275KR, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I326IT  
188360 04SP0188360 None None   V35T, V60I, I135V, I142V, L210LF, R211RK, V245M, A272P, K277R, K281R, T286A, E297K, D324DE, Q334QH  
19425 00SP19425 None None   K11R, K32KT, K64R, Q207H, R211K, Q278QH, T286A, V317A, S322T  
201993 04SP201993 None None   V35I, I135M, S162C, R211K, A272S, V276VI, K277KR, V292I, I293V, E312EK, K323KQ  
207855 04SP0207855 None None   A98S, I135L, S162C, D177K, T200A, R211K, L228H, D250E, A272S, K277R, T286A, E297T, I329V, Q334E  
207856 04SP0207856 None None   V35T, K43KR, V60VI, K64KR, A98S, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, T200AE, Q207K, R211S, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297AT, L301LM, D320E, D324E, I329V K73KN 
224124 04SP0224124 None None   V21I, V35T, D123E, Q174H, D177E, Q197P, I202V, A272P, L301LI, G333E, Q334L  
224125 04SP0224125 None None   V60I, S68G, V90I, I135T, Q207T, R211K, T286A, I326V, Q334L  
224127 04SP0224127 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102R, K122E, D123DN, A158S, K173AT, Q174QR, D177DE, T200A, Q207V, R211K, V245HQ, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I329L Q161QP, I167IT 
224128 04SP0224128 None None   E36EA, K49R, I50V, D123E, K166T, S251SR, V254I, T286A, I293V, P294T  
224129 04SP0224129 None None   V35I, R83K, I135T, G196E, T200K, V245M, A272P, K277R, P294S Q151G 
224130 04SP0224130 None None   D121Y, K122E, I135T, I202V, R211K, F214L, V245M, A272P, I293V, I329L  
224131 04SP0224131 None None   K49R, I135T, E169D, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, K277R, T286A, I329L  
224132 04SP0224132 None None   V35I, K43KR, S48E, D123E, E138A, Q174K, I202V, R211K, F214L, V245E, A272P, K277R, I293V, E297AV  
224133 04SP0224133 None None   V35T, T39K, V60I, K122E, I135V, I142V, G196E, A272P, K281R, T286TA, P294T, E297R, Q334E  
224135 04SP0224135 None None   A98S, D123E, E169D, I178V, R211K, V245E, K277R, I293IV, E297K, Q334L  
224136 04SP0224136 None None   A98S, D123DE, A158S, S162A, E169D, R211K, K277R, T286A, E297K, G333E, Q334L  
224137 04SP0224137 None None   V35VI, I135V, E169D, G196E, Q197K, L210LF, V245M, A272P, K281KR, T286A, K311R, I329L  
224145 04SP0224145 None None   K20R, V35T, T39K, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, I142IT, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, Q278H, K281R, T286A, A288S, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, L301M, P321S, I329V  
224148 05SP0224148 None None   V35I, E36D, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211N, V245Q, K277R, T286AP, E291D, V292VI, I293V, P294IV, V314VI, S322A, I326V  
237390 05SP0237390 None None   V35I, K102Q, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177G, G196E, Q197K, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, V276I, K277R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, S322T  
243934 05SP0243934 None None   K101R, K122P, I135R, S162C, D177DE, I178IM, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, I293V, E297T  
249436 05SP0249436 None None   K101R, K122P, I135R, S162C, D177E, R211RK, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, I293V, E297T  
256088 05SP0256088 None None   T27S, V35T, V60I, K122V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, K277R, K281R, T286A, I293V, P294T, S322T, I326V  
256091 05SP0256091 None None   V35T, T39N, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, S162SC, E203D, R211K, A272P, K281R, P294A, E297R, K311R, Q334E  
256092 05SP0256092 None None   T27S, V35T, T39TK, V60I, K122V, I135IV, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248NS, S251SI, K277R, K281KR, T286A, I293V, P294T, S322T, I326V  
256094 05SP0256094 None None   T27S, V35T, T39K, V60I, K122V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, K277R, K281R, T286A, I293V, P294T, S322T, I326V  
259573 00SP259573 None None  K103N, K238T V35I, K101KR, V118I, D123E, I135T, K173Q, T200A, Q207E, R211K, F214L, V276I, I293V, P294PT, E297K, K311KR, I329L  
269666 00SP269666 None None   R83K, K173KE, T200TS, R211RK, V245E, I293V, D324E  
2697843 05SP02697843 None None   V35IT, E36ED, V60VI, D123E, I135L, S162A, E169EAKT, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245K, A272P, T286A, V292I, I293V, P294A, S322A, I326IV  
269791 05SP0269791 None None  K103N V60I, F87L, D123E, I135V, I142V, A272P, T286P, I293V, E297R, Q334E  
269792 05SP0269792 None None   V35T, E44ED, D123E, I135L, S162A, K173R, Q174T, D177E, Q207E, R211K, V245Q, K259KR, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294A, S322EV, I326V  
269900 04SP269900 None None   K64KR, K104R, D123E, S162C, D177DE, Q207DN, V245K, T286A, I293V, I329L  
280907 01SP280907 None None   K20R, E36D, V60I, K104R, D123E, I135IT, D177N, I178M, Q207E, R211K, F214L, A272P, T286A, E291D, E297R, L301I, K311R  
296425 06SP0296425 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
296581 06SP0296581 None None   T39A, E40D, K104R, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174K, T200A, E204EK, Q207A, R211EK, V245Q  
296594 06SP0296594 None None   D123E, I142T, Q197H, E248D, A272P, K281R, V292I, I293V, E297K, G333E, Q334H  
302050 06SP302050 None None   V35T, E36D, T39S, K43R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, I202IV, Q207E, F214L, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322G, I326V  
303027 06SP0303027 None None   K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, D121Y, K122E, D123G, I135T, K173IL, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245Q, A272S, Q278QR, K281R, E291D, V292I, I293V T128TA 
303103 06SP0303103 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, D177E, T200A, E204Q, Q207E, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, I293V  
311022 06SP0311022 None None   K11T, V35T, E36D, T39R, L100F, K122E, D123NS, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245KM, E248D, A272P, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294T, I326V  
315063 06SP0315063 None None   K101R, K122P, I135R, S162C, D177E, R211K, V245Q  
319598 01SP319598 None None   K43KN, S48ST, K49KR, K122E, D123N, I135T, R211Q, V245K  
321489 00SP0321489 None None   T39L, V106I, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177N, Q207E, R211K, V245Q  
337802 06SP337802 None None   V35I, V60I, K64KR, I135L, A272P, K281R, V292I, I293IV, E297K, Q334Y  
337803 06SP337803 None None   K20R, V35I, V60I, D123E, I135V, I142V, Q174K, D177E, I178V, G196E, Q197K, R211S, F214L, E248D, A272P, K277R, T286A, P294T, E297R, V317A, Q334L  
337805 06SP337805 None None   V35T, T39TK, V60I, I135V, I142V, D177DE, I178V, G196E, T200I, E203D, A272P, K281R, T286A, P294T, E297R, Q334E  
337809 06SP337809 None None   V60I, D123E, I135X, I142IV, Q174K, D177E, I178V, G196E, Q197K, R211S, F214L  
355145 01SP355145 None None   Q174K, I178M  
361717 00SP361717 None None   K122E, E169D, D177E, I178V, T200A, F214L, V245M  
369426 07SP369426 None None K219KE  V106I, K122P, D123E, S162C, D177E, I178L, T200E, Q207QK, R211K, D237E, V245Q D113DN 
369443 07SP369443 None None   V35T, V60I, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207KR, R211T, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294V, E312Q, S322P, I326V  
375981 06SP375981 None None   K64R, A98S, K104KR, K122E, D123N, I132IL, I135T, E138A, K173KE, V179VI, R211RK, F214L, V245M, A272AG, T286A, I293V, E297K T131N 
385167 07SP385167 None None   T39L, K122E, D123N, K126KR, S162A, K173E, Q174D, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
398963 07SP398963 None None   K20R, V35T, T39N, K49R, I50V, V60I, D123EK, E169D, T200TAIV, I202IV, R211K, A272P, T286A, I293IV, E297R, I326IV, I329V  
398971 07SP398971 None None   E6D, V35T, K122E, D123N, K166R, K173T, D177E, I178L, T200E, I202V, E204A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A, I329V  
398972 07SP398972 None None   V8I, K32R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, A98S, K122E, D123N, E138A, T200A, Q207E, V245H, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E300Q, K311R, D324E  
400288 07SP400288 None None   S3R, V35T, T39L, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T, D250E, S251SN, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322AT, I326IV  
400723 07SP400723 None None   V21I, V35T, E40D, V60I, K122P, I135V, S162A, K173E, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, I293V, P294L, E297A, A327T  
401340 07SP401340 None None F77FL  K49R, E53ED, K103KQ, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, V245Q E40DN, E79EA, K220N 
401347 07SP401347 None None   T39E, S48ST, K122E, D123S, A158S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207QK, R211K, V245Q G51GW 
401351 07SP401351 None None   V35T, E36D, T39A, K49R, V106I, K122E, D123E, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, I195M, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A, Q334K  
401362 06SP401362 None None   V35T, K104R, D123E, S162T, K173T, Q174E, D177E, I178LM, V189I, Q197E, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211RS, V245Q, K275Q, K277R, T286A, E291D, I293V, P294V, E312Q, S322T, D324E, I326V  
401375 07SP401375 None None   V35T, E40D, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207EK, R211K, V245T, D250E, S251N, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322T  
401385 07SP401385 None None   V35T, E36D, T39L, D123E, I132V, I135IT, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211RK, V245Q, E248ED, D250DE, A272P, K275R, V276I, Q278N, L283I, T286A, E291ED, I293V, E297A, A304AE, P321S, D324E T131TS 
401387 07SP401387 None None   S3R, K20R, V21I, K32R, V35T, V60I, K122E, D123T  
401397 07SP401397 None None   V35T, T39A, V60VI, K102KQ, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174A, T200A, Q207T, R211K, V245Q, E248DN, A272P, K277R, L283LI, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I329IV  
4369443 07SP4369443 None None   V35T, V60I, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207KR, R211T, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294V, E312Q, S322P, I326V  
44758 02SP0044758 None None V75VA  S68SG, K122E, K166R, I202V, R211K, I257IV, K277R, T286A, P294A, E297K, K311R, V317A, P321PS, A327AV, I329L P59T, Y146YC, W239WR, Y318YC 
93850 02SP00093850 None None   E28K, K32E, S162C, F214L, V241VG, A272P, E291D, K311R