Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Brumme (2009)
Title HLA-associated immune escape pathways in HIV-1 subtype B gag, pol and nef proteins.
Citation PLoS Med
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 683
NumPts 683
Subtype B, CRF02_AG, CRF01_AE, D, A, C, CRF12_BF, J, H


  Page 1 of 7    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 683 Clinical PR Isolates

A0526 A0526 None    E35D, I62V, L63P, V77I, I93L  
A0575 A0575 None    G16GE, Q18QL, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
A1519 A1519 None    L10I, I62V, L63P, G68E, A71T, I93L  
A1541 A1541 None    N37S, R41K, I62V, L63S, H69Q, V77I  
A2508 A2508 None    I13V, Q18L, M36I, I62V, L63P, A71V, I93L  
A2520 A2520 None    T12A, E35D, M36I, I62V, I64V  
A2572 A2572 None    R57K, I62V, L63S, A71T, I72V, V77I, I93L  
A3504 A3504 None    T12K, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, E65D, T74TA  
A3515 A3515 None    T12A, L63S, I64V  
A3533 A3533 None    K43R, L63P, V77I, Q92QE, I93IL  
A3546 A3546 None    K14R, L19I, E35D, N37D, K43R, R57K, Q61E, L63P, A71T, I72T, V77I, I93L  
A4500 A4500 None    E35D, R57K, L63P, V77I, I93L  
A4521 A4521 None    T12S, L63P, I93L  
A4532 A4532 None    I13V, L19V, I64V, I72V, V77I A22AS 
A5511 A5511 None    L10LI, N37D, L63S, A71T, I72IV, V77I, I93L  
A6513 A6513 None    L10LI, Q18H, R41K, L63PT, A71T, I72V  
A7512 A7512 None    I62V, L63Q, V77VI R8R*G 
A7531 A7531 None    L10V, I13V, I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, L63C, H69K, L89M  
A7540 A7540 None    L19I, R41K  
A8507 A8507 None    V11A, T12P, L19I, N37S, I62V, L63P, C67W, I72V, V77I Q58QL 
A8524 A8524 None    N37S, P39S, R57RK, L63P, A71V, I93L  
A8536 A8536 None    P39PS, D60E, Q61E, L63P, H69Q, V77I, T96TA  
A8573 A8573 None    I13V, K14R, N37S, I64V, V77I  
A8595 A8595 None    T12S, I15V, L19T, L63P, H69Y, I72T, V77I  
B0519 B0519 None    K14R, L63P, V77I  
B0541 B0541 None    L10I, L63S, I64M, I72T  
B1501 B1501 None    I13V, G16E, P39S, D60E, I64V, I72V, V77I  
B1518 B1518 None    I15V, L19I, E35D, N37D, R41K, R57RK, L63P, I72IT, V77VI, I93L  
B1539 B1539 None    K14R, E35D, N37D, D60E, L63P, E65D  
B1542 B1542 None    I15V, N37H, R41K  
B3506 B3506 None  M46L  I13V, I15V, L63T  
B3535 B3535 None    L10V, I13V, R41K, R57K, D60E, L63P  
B3577 B3577 None    E35D, N37H, R41EK, D60E, Q61E, L63P, H69Q, V77I  
B4522 B4522 None    I15V, E35D, M36I, L63P, H69C  
B4578 B4578 None    I15V, M36MI, R41K  
B5512 B5512 None    I13AV, I15V, K20I, M36I, R41K, L63HR, H69K, A71AV, L89M T26TA, V75VA 
B5531 B5531 None    E35D, N37D, I62V, L63C, A71T, V77I, I93L  
B5599 B5599 None  G48GA K43KT, I50IF I15V, G16E, P39S, D60E, L63P  
B6504 B6504 None    N37S, R41K, L63Q  
B6515 B6515 None    M36I, R57K, L63P, H69Q  
B6533 B6533 None   I47IM K14GR, I15V, L19I, M36MV, N37D, I62IV, L63Q, I64L, V77I, I93IL  
B7500 B7500 None    L33V, W42Y, L63P, I64V, H69Y, I72V  
B7521 B7521 None    N37D, L63P, E65D, I72V, V77VI  
B7532 B7532 None   L24LI E35D, L63P A22AS 
B7579 B7579 None    L10V, I15V, M36I, R41K, R57K, D60E, L63P, I64V  
B8526 B8526 None    I15V, G16E, I62V, L63H, I64V  
B8575 B8575 None    L63P  
B9517 B9517 None    K14R, R41K, L63P, I72V, V77I, I93L  
B9543 B9543 None    I13V, R57K, L63P, H69Y, I93L  
D1543 D1543 None    T12E, E35ED, N37S, L63PT, I72V  
D2526 D2526 None    I13V, N37A, R41K, K43KR, L63P, I64V, Q92K  
D2575 D2575 None    G16E, I62V, L63T, I64V, E65D, V77I  
D3500 D3500 None    R41K, I64V  
D3521 D3521 None   V11I L10V, K14I, G16E, K20I, M36I, R41K, L63C, H69K, K70R, L89M I13GV, G52GR 
D3532 D3532 None    Q7QH, I62V, L63P, Q92E, I93L, C95CS  
D3579 D3579 None    K14R, I15V, L19LQ, K20M, N37NK, I62V, L63P M36GV 
D4506 D4506 None    T12S, I15V, L19I, E35D, N37D, R57K, L63P, H69Q  
D4523 D4523 None    P39PS, L63P, I64V, V77I  
D4535 D4535 None    L10I, I13V, L63T, A71T, V77I, I93L  
D4577 D4577 None    I13V, K14R, E35D, I62V, L63P  
D5513 D5513 None    I13V, L19I, M36I, K43KR, I62V, L63P  
D6512 D6512 None    M36I, N37D, I64V  
D6531 D6531 None    I15V, E35D, M36I, N37E, R41RK, L63P, I93L  
D7504 D7504 None    N37Q, L63D, I64V, K70R  
D7515 D7515 None    K43R, I62V, L63P, I72IM, V77I, I93L  
D7533 D7533 None    K14R, I15V, E35D, N37D, L63P, I64V, V82VI  
D8508 D8508 None    I15V, M36I, I62IV, L63A, I93IL  
D8520 D8520 None    I13V, E35D, L63P  
D8572 D8572 None    K14R, E35D, N37S, R41K, A71V, I72T, I93L I64EV 
D9519 D9519 None    K14R, N37S, R41K, L63P, V77I, I93L  
E0510 E0510 None    T12A, R41K, L63P, I93L  
E0549 E0549 None    T12V, I15V, G16E, E35D, M36I, I62V, L63S, I64V  
E1509 E1509 None    E35D, N37D, L63P, K70R, A71T, V77I, I93L  
E1530 E1530 None    E35D, R57K, L63P, H69Q  
E1548 E1548 None    L63S, V77VI  
E1571 E1571 None    L63P, H69Q  
E2514 E2514 None    L19I, L33LV, N37T, P39S, K43KE, L63Q, I64V  
E3505 E3505 None    I15V, R41K, I64V, K70R, I72V, V77I  
E3527 E3527 None    I15V, M36MI, N37S, R57K, L63P  
E3576 E3576 None    K14KR, E35D, M36I, R41K, L63P, E65D L23LPS, Q61Q* 
E4528 E4528 None    K14R, R41K, D60E, Q61E, I62V, L63P, V77I, I93L  
E5501 E5501 None    E35D, I93L A22AP 
E5518 E5518 None  I84IV I50IS, L89LV I15IM, K20KR, M36L, N37NS, Q58QR, Q61QEGR, I62V, L63P, I66IMV, I72IM, Q92QE K70KEGR, V77VG, P81PR, I85IS 
E5539 E5539 None    I15V, K20R, E35D, M36I, R41K, L63AV, H69K, L89M, I93L P1PS 
E5590 E5590 None    K14KR, Q18QE, I62V, L63A, V77I, I93L  
E6503 E6503 None    E35D, M36MI, N37S, I64V, V77I  
E6537 E6537 None    E35D, N37A, R57RK, L63P  
E6574 E6574 None    L33V, N37Y, I62V, L63P, I64L, H69Q  
E7529 E7529 None    I13V, N37A, R41K, L63P, H69Y  
E7538 E7538 None    I15V, K20R, N37S, R41K, I64V T91TP 
E7570 E7570 None    G16E, K20KR, P39S, D60E, I62V, L63T, I72V, V77I A22AS, I93IS 
PRRT_4030 PRRT_4030 None    I64V, V82VI  
PRRT_4031 PRRT_4031 None    Q18H, P39S, L63P, I64L, A71V, V77I, I93L  
PRRT_4032 PRRT_4032 None    E35D, I64V  
PRRT_4033 PRRT_4033 None    N37S, V77I, I93L  
PRRT_4034 PRRT_4034 None    I13V, M36I, L63S, I72T  
PRRT_4035 PRRT_4035 None    T12S, R41K, L63P, I93L  
PRRT_4036 PRRT_4036 None    I13V, I15V, N37NS, L38LM, R57K, I62IV, L63P  
PRRT_4037 PRRT_4037 None    I13V, K14R, N37D, L63H, I64V, E65D  
PRRT_4038 PRRT_4038 None    N37NS, P39PS, L63S, I72V, V77I