Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Gatanaga (2007)
Title Drug-resistant HIV-1 prevalence in patients newly diagnosed with HIV/AIDS in Japan
Citation Antiviral Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 473
NumPts 473
Subtype B, CRF01_AE, C, A, G, CRF02_AG, F, CRF33_01B


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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 473 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A03-201001-1 A03-201001-1 None None   K11KN, I135T, M164MI, T200I  
A03-201002-1 A03-201002-1 None None   T7TA, V8VI, V35VI, I135T, R172RG, T200I  
A03-201003-1 A03-201003-1 None None   E6D, V60I, I135T, I142V, A158AS, S162SC, T165TI, T200V, Q207E, L210M, R211K, A272S  
A03-201004-1 A03-201004-1 None None   V35I, R83K, K102R, K173KE, T200A, Q207AD  
A03-201005-1 A03-201005-1 None None   V60I, I135T, I178M, Q207E, R211RK  
A03-201006-1 A03-201006-1 None None  V179E E6D, K20R, V35I, K102R, D123E, D177E, E204EA, R211RK, D237N  
A03-201007-1 A03-201007-1 None None   T39N, K49R, V60I, D123E, I135T, D177E, V245M  
A03-201008-1 A03-201008-1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245KQ, D250E  
A03-201009-1 A03-201009-1 None None  V108I E6D, V35I, K122KR, D123E, I135IV, I178L, K277R  
A03-201010-1 A03-201010-1 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123T, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P  
A03-201011-1 A03-201011-1 None None   E6D, V35I, K102KR, D123E, I135L, S162C, G196E, R211K, A272P, V276I, K277R  
A04-201003-1 A04-201003-1 None None   E6D, V35VL, I50IV, V60I, I135T, I142V, S162SC, T165TI, T200V, Q207E, L210M, R211K, A272S M41MR, W71WG 
A04-201008-1 A04-201008-1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
A04-201012-1 A04-201012-1 None None   E6D, V60I, I135T, Q197K, T200TI, R211K, V245Q  
A04-201013-1 A04-201013-1 None None  V106VA V35I, S105SA, K122E, I135L, A158AS, G196E, D218DN, V245E, A272P  
A04-201014-1 A04-201014-1 None None   I135T, T200I, R211K, V245I  
A04-201015-1 A04-201015-1 None None   I135T, T200I, R211K, V245I  
A04-201016-1 A04-201016-1 None None  V179D I5IV, K20R, D123E, I135T, K166R, G196E, I202V, L210F, R211K, V245M, A272P  
A04-201017-1 A04-201017-1 None None   A98AS, K102R, K122E, I135T, K173N, T200I  
A04-201018-1 A04-201018-1 None None   V35T, T39D, S48T, D121HY, K122E, D123DG, E138A, T165I, K173A, D177G, G196E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R  
A04-201019-1 A04-201019-1 None None   E6D, K20R, V35IT, T39TK, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, G196A, T200A, Q207A, R211K, V245E, K249Q  
A04-201020-1 A04-201020-1 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, K173R, D177E, G196E, R211K, A272P, V276I, K277R  
A04-201021-1 A04-201021-1 None None   E6D, R211T, V245K  
B03-511003-1 B03-511003-1 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135M, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
B03-511004-1 B03-511004-1 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S  
B03-511006-1 B03-511006-1 None None   V35T, K49R, K122E, E169D, Q207A, R211K, K238R  
B03-511007-1 B03-511007-1 None None   V35I, K122T, I135L, S162C, D177E, D192N, I195L, G196E, T200I E194M 
B04-511002-1 B04-511002-1 None None   V21I, I135T, G196E, I202V, R211G, V245M  
B04-511003-1 B04-511003-1 None None   K103R, G196K, R211K, F214L  
B04-511005-1 B04-511005-1 None None   V21I, V35I, R83K, I135R, K173E, T200A, E204K, Q207E  
B04-511006-1 B04-511006-1 None None   K20R, D123E, I135T, I178L, I202V, R211K, V245M  
B04-511007-1 B04-511007-1 None None   V35I, K49E, K104R, D123E, I135L, S162C, E169K, R172K, D177K, G196E, E204D, R211K Q182H 
B04-511008-1 B04-511008-1 None None   V35L, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, Q207R, R211K  
B04-511009-1 B04-511009-1 None None   V35L, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, R211K  
B04-511010-1 B04-511010-1 None None T215D  K64R, D123E, I135T, I142T, S162C, I178L, V179I, Q207E  
C03-51110001-1 C03-51110001-1 None None T215D F227L K64R, D123E, I135T, S162C, P176S, V179I  
C03-51110002-1 C03-51110002-1 None None   V35T, V60I, I142V, T200A, R211K  
C03-51110003-1 C03-51110003-1 None None   K122E, I135T, I178L, F214L  
C03-51110004-1 C03-51110004-1 None None   V35I, I135L, S162C, G196E  
C03-51110005-1 C03-51110005-1 None None   V35I, I135V, S162C, Q207K  
C03-51110006-1 C03-51110006-1 None None   V35I, R83K, I178V, Q207E  
C03-51110007-1 C03-51110007-1 None None T215TA V179E K20R, K102R, D123E, D177E, G196E, Q207E, R211K  
C03-51110008-1 C03-51110008-1 None None  V179D D123E, I135T, D177E, T200I  
C03-51110009-1 C03-51110009-1 None None   E6D, T7A, V35I, V60I, I135T, I142V, T200S, Q207E, L210I, R211K  
C03-51110010-1 C03-51110010-1 None None   V35I, S68G, V106I, K122E, E169D, I178L, Q207R, R211K  
C03-51110011-1 C03-51110011-1 None None   V35I, K122P, I135L, S162C, G196E, Q207R Q23H, W24G 
C03-51110012-1 C03-51110012-1 None None   D123E, I135T, D177E, R211K  
C03-51110013-1 C03-51110013-1 None None   S68G, I142L, G196E, R211G  
C03-51110014-1 C03-51110014-1 None None   E6D, V8X, P9X, V10X, K11X, L12X, K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, L210M, R211S, H221L, E224D H198P 
C03-51110015-1 C03-51110015-1 None None   V35R, T39A, I135V, S162C, G196E, R211G  
C03-51110016-1 C03-51110016-1 None None   D123E, E169K, I178M, V189I, Q207E  
C03-51110017-1 C03-51110017-1 None None   V35I, I135V, S162C L205LMV 
C03-51110018-1 C03-51110018-1 None None   E28G, V35I, A98S, I135V, S162C, L210E, R211K  
C03-51110019-1 C03-51110019-1 None None   K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, K20R, R211K  
C03-51110020-1 C03-51110020-1 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
C03-51110021-1 C03-51110021-1 None None   K11T, I31T, V35T, T39M, K104N, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K  
C03-51110022-1 C03-51110022-1 None None   V35I, D123N, I135L, S162C, G196E  
C03-51110023-1 C03-51110023-1 None None   V35I, D123N, I135L, S162C, P176Q, G196E  
C03-51110024-1 C03-51110024-1 None None   V35I, I135L, I159V, T200I, R211G, T240S  
C03-51110025-1 C03-51110025-1 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
C03-51110026-1 C03-51110026-1 None None   V35L, R83K, K102N, D123E, S162Y, D177E, V189I, G196E, Q207E  
C03-51110027-1 C03-51110027-1 None None   V35I, I135L, S162C, K166R, K173E, T200A, R211K  
C03-51110028-1 C03-51110028-1 None None   E6D, V35I, S105A, I135L, S162C, G196E  
C03-51110029-1 C03-51110029-1 None None   K122E, I142V, S162H, T200A  
C03-51110030-1 C03-51110030-1 None None   V8G, V35I, I135V, S162C, T200I, Q207E, R211K P4R 
C03-51110031-1 C03-51110031-1 None None   V35T, T39A, K102R, D123E, I135T, S162Y, K173Q, Q207E I37M 
C03-51110032-1 C03-51110032-1 None None  V179D E6D, K11T, V60I, A98S, K102R, I142V, T200S, Q207E, L210M, R211K  
C03-51110033-1 C03-51110033-1 None None   K20R, V35I, D123E, I135T, D177E, R211K  
C03-51110034-1 C03-51110034-1 None None   V8I, K20R, K122E, D123E, I135T, D177E, R211K  
C03-51110035-1 C03-51110035-1 None None   K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, P19X, V35I, I135L, S162C, P170S, G196E, Q207R, D218E L12LF, K20K*EQ, E29D 
C03-51110036-1 C03-51110036-1 None None   R83K, T139A, K238S T69L 
C03-51110037-1 C03-51110037-1 None None   I142V, P176S, G196E, R211K  
C03-51110038-1 C03-51110038-1 None None   E6D, V60I, I135T, Q207E, L210M, R211K  
C03-51110039-1 C03-51110039-1 None None   E6K, K20R, V35I, K122E, D123E, I135R, I202V, Q207E  
C03-51110040-1 C03-51110040-1 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, F214L, K238R  
C03-51110041-1 C03-51110041-1 None None   E6D, V35I, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, Q207A, R211I, K238R  
C03-51110042-1 C03-51110042-1 None None   K20R, K122E, D123E, I135V, S162C  
C03-51110043-1 C03-51110043-1 None None   K20R, D123E, I135T, I178L, I202V, R211K  
C03-51110044-1 C03-51110044-1 None None   I5V, V35L, R83K, K102R, D123E, S163T, N175H, D177E, I178M, G196E, E204K, Q207E  
C03-51110045-1 C03-51110045-1 None None   S68N, V90I, D123E, Q207E  
C03-51110046-1 C03-51110046-1 None None T215S  V35I, K102Q, K103R, I135T, I178M, T200A, R211K  
C03-51110047-1 C03-51110047-1 None None   K20R, V60I, A98S, I135T, E169D, T200I  
C03-51110048-1 C03-51110048-1 None None   I135T, A158S, K166R, G196E, T200I, I202V, R211G  
C03-51110049-1 C03-51110049-1 None None V75VL  E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
C03-51110050-1 C03-51110050-1 None None   E6D, I31T, V35T, T39K, K43E, D121Y, K122E, D123G, K173I, Q174K, D177E, Q207A, L210S, R211S, K238R  
C03-51110051-1 C03-51110051-1 None None   V60I, K122E, G196E  
C03-51110052-1 C03-51110052-1 None None   E6D, V35I, T39A, I135L, S162C, D177E, G196E, Q207H, R211K E233A 
C03-51110053-1 C03-51110053-1 None None   V35M, S162C, T200I, Q207E  
C03-51110054-1 C03-51110054-1 None None  V179E V35T, T39K, V60I, S68G, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
C03-51110055-1 C03-51110055-1 None None   D123E, I135T, S162C, E169D, V179I, G196E, I202V, R211Q  
C03-51110056-1 C03-51110056-1 None None   K22E, V35I, K122E, I135L, S162C, G196E, L210M  
C03-51110057-1 C03-51110057-1 None None   I5V, E6D, V35I, I135L, S162C, G196E  
C03-51110058-1 C03-51110058-1 None None   V35I, D123E, I135T  
C03-51110059-1 C03-51110059-1 None None   V60I, I135T, I142V, T200S, Q207E, L210M, R211K  
C03-51110060-1 C03-51110060-1 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, S68N, D123A, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, L228H  
C03-51110061-1 C03-51110061-1 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, P176T, G196E  
C03-51110062-1 C03-51110062-1 None None   E6D, V60I, I142V, T200S, Q207E, L210M, R211K  
C03-51110063-1 C03-51110063-1 None None   I31T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
C03-51110064-1 C03-51110064-1 None None   K122E, I135T, F171Y, K173E, I178L, T200A  
C03-51110065-1 C03-51110065-1 None None   A98S, K122E, E169D