<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Iweriebor (2012)
Title Molecular epidemiology of HIV in two highly endemic areas of northeastern South Africa.
Citation Arch Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype C

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
07B10ZA 07B10ZA None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q, L246I, P247A, E248D, E291D, V292I, I293V  
07B13ZA 07B13ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
07B158ZA 07B158ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121G, K122E, D123G, K173A, D177G, T200A, Q207E, V245Q, D250E, K281R, E291D, V292I, I293V, P294T V254A, T286G 
07B159ZA 07B159ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, A98S, K122E, K173A, Q174K, D177G, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, P243T, V245Q, A272S, T286A, E291D, I293V  
07B15ZA 07B15ZA None None   V35T, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E, S251D, A272P, K281R, V292I, I293V  
07B16ZA 07B16ZA None None   V35T, E36A, T39E, V90I, K122V, D123N, K173D, Q174R, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07B18ZA 07B18ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07B1ZA 07B1ZA None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K166R, K173A, D177E, I195T, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07B2ZA 07B2ZA None None   P4H, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K166R, K173T, T200A, I202V, Q207I, R211K, V245L, A272P, K277R, E291D, I293V  
07B4ZA 07B4ZA None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, D123E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, A272P, V276T, T286A, E291D, V292I  
07B50ZA 07B50ZA None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, V261I, V292I, I293V  
07B53ZA 07B53ZA None None   I5V, K20R, V35T, E36A, T39E, K43A, V60I, D121Y, K122E, I135V, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, V292I, I293V  
07B54ZA 07B54ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162C, K173V, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07B61ZA 07B61ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207D, V245T, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
07M13ZA 07M13ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251D, A272P, I293V  
07M15ZA 07M15ZA None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K166R, K173E, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V Q145L, Y146I 
07M18ZA 07M18ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173E, D177E, T200A, E204K, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, L283I, T286V, E291D, V292I, I293V  
07M19ZA 07M19ZA None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
07M20ZA 07M20ZA None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, T139M, K173A, Q174K, I202V, Q207K, R211K, V245Q, E248N, A272P, Q278Y, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07M22ZA 07M22ZA None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135V, K173T, D177E, T200A, Q207N, V245Q, A272K, K275Q, K277R, E291D, V292I, I293V  
07M23ZA 07M23ZA None None   V35T, T39K, S48T, V60I, D121H, K122E, D123E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, V276T, T286A, E291D, V292I, I293V Q278G 
07M26ZA 07M26ZA None None   V35T, E36A, T39A, S48T, W88S, V118I, K122E, D123N, E138A, A158S, K173T, Q174S, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, P247A, A272P, K275R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V S191T 
07M27ZA 07M27ZA None None   P4S, E28A, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207D, V245Q, A272S, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V  
07M45ZA 07M45ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173E, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, I274L, K275R, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07M5ZA 07M5ZA None None  K103N V35T, E36A, T39D, K122E, D123N, K166R, K173E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243A, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07M8ZA 07M8ZA None None   V35T, T39A, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248T, A272P, K277R, E291D, I293V, T296N  
07SH16ZA 07SH16ZA None None   V35R, T39E, S48T, A98S, K122E, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211Q, V245Q, A272P, K277R, L283I, I293V  
07V10ZA 07V10ZA None None   V35T, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123N, E138A, K173A, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245L, A272P, K275R, K277R, Q278N, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
07V11ZA 07V11ZA None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I195L, G196K, T200A, Q207E, R211K, V241I, V245Q, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07V12ZA 07V12ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173N, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
07V13ZA 07V13ZA None None   E6D, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K82R, K122E, E138A, K173A, D177E, T200A, Q207T, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
07V1ZA 07V1ZA None None  V179D E6D, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, D123N, E138A, K173M, Q174K, Q197L, T200A, E203N, Q207D, F214L, V245Q, E248D, S251V, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
07V29ZA 07V29ZA None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207A, V245K, E248D, K277R, T286A, E291D, V292I, L295I, T296N I293G 
07V2ZA 07V2ZA None None  K103N V35T, T39E, V90I, K122E, D123S, S162C, K173A, D177E, I178L, G196E, Q197K, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V  
07V31ZA 07V31ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251D, A272P, I293V  
07V32ZA 07V32ZA None None   P4S, V35T, T39E, S48T, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, V276T, K277R, Q278H, K281R, E291D, V292I, I293V  
07V5ZA 07V5ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
07V7ZA 07V7ZA None None   E6A, V35T, T39K, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211K, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
07V8ZA 07V8ZA None None   E6A, E28K, V35T, T39K, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
0VV33ZA 0VV33ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, I135K, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, S251D, A272P, L283I, V292I, I293V  

Database

Resources

Team