<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Azijn (2010)
Title TMC278, a next-generation NNRTI, active against wild-type and NNRTI-resistant HIV-1.
Citation AAC
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedType Lab
NumIsolates 82
Lab Parent Strain HXB2


Lab RT Isolates (including Susceptibility Data)


IsolateNRTIDRMsNNRTIDRMsMethodDrugFold Res.
100I+101E  L100I, K101E Antivirogram EFV 49 
     Antivirogram ETR 0.9 
     Antivirogram NVP 18 
     Antivirogram RPV 2.1 
100I+103N  L100I, K103N Antivirogram EFV >576 
     Antivirogram ETR 4.0 
     Antivirogram NVP >42 
     Antivirogram RPV 7.0 
100I+103N+138G  L100I, K103N Antivirogram EFV 1,695 
     Antivirogram ETR 21 
     Antivirogram NVP >58 
     Antivirogram RPV 33 
100I+103N+179L  L100I, K103N Antivirogram EFV 5,661 
     Antivirogram ETR 13 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 46 
100I+103N+181C  L100I, K103N, Y181C Antivirogram EFV 1,812 
     Antivirogram ETR 58 
     Antivirogram NVP 468 
     Antivirogram RPV 81 
100I+179I+181C  L100I, Y181C Antivirogram EFV 17 
     Antivirogram ETR 34 
     Antivirogram NVP >205 
     Antivirogram RPV 15 
101E+103N  K101E, K103N Antivirogram EFV 56 
     Antivirogram ETR 1.8 
     Antivirogram NVP >42 
     Antivirogram RPV 2.0 
101P+103N+108I  K101P, K103N, V108I Antivirogram EFV 12,931 
     Antivirogram ETR 18 
     Antivirogram NVP >52 
     Antivirogram RPV >162 
103N+108I  K103N, V108I Antivirogram EFV 96 
     Antivirogram ETR 0.7 
     Antivirogram NVP >205 
     Antivirogram RPV 0.5 
103N+179I+181C  K103N, Y181C Antivirogram EFV 17 
     Antivirogram ETR 14 
     Antivirogram NVP >430 
     Antivirogram RPV 10 
103N+181C  K103N, Y181C Antivirogram EFV 36 
     Antivirogram ETR 4.1 
     Antivirogram NVP >42 
     Antivirogram RPV 3.5 
103N+181I  K103N, Y181I Antivirogram EFV 6.4 
     Antivirogram ETR 16 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 95 
103N+227L  K103N, F227L Antivirogram EFV 8.9 
     Antivirogram ETR 0.5 
     Antivirogram NVP 141 
     Antivirogram RPV 0.5 
138K+230L  E138K, M230L Antivirogram EFV 19 
     Antivirogram ETR 19 
     Antivirogram NVP >64 
     Antivirogram RPV 23 
179D+181C  V179D, Y181C Antivirogram EFV 9.3 
     Antivirogram ETR 11 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 6.0 
179E+181C  V179E, Y181C Antivirogram EFV 13 
     Antivirogram ETR 31 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 6.8 
179F+181C  V179F, Y181C Antivirogram EFV 4.6 
     Antivirogram ETR 159 
     Antivirogram NVP >358 
     Antivirogram RPV 8.7 
179F+181C+227C  V179F, Y181C, F227C Antivirogram EFV 26 
     Antivirogram ETR 639 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 554 
179F+181I  V179F, Y181I Antivirogram EFV 1.0 
     Antivirogram ETR 123 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 11 
179I+181C  Y181C Antivirogram EFV 1.3 
     Antivirogram ETR 4.6 
     Antivirogram NVP 140 
     Antivirogram RPV 3.7 
181C+188L  Y181C, Y188L Antivirogram EFV 238 
     Antivirogram ETR 6.0 
     Antivirogram NVP >158 
     Antivirogram RPV 30 
181C+190S  Y181C, G190S Antivirogram EFV 486 
     Antivirogram ETR 20 
     Antivirogram NVP >72 
     Antivirogram RPV 3.4 
181C+227C  Y181C, F227C Antivirogram EFV 12 
     Antivirogram ETR 25 
     Antivirogram NVP >77 
     Antivirogram RPV 24 
E138A   Antivirogram EFV 1.6 
    Antivirogram ETR 2.9 
    Antivirogram NVP 2.3 
    Antivirogram RPV 2.5 
E138G   Antivirogram EFV 0.9 
    Antivirogram ETR 2.4 
    Antivirogram NVP 2.8 
    Antivirogram RPV 1.6 
E138K  E138K Antivirogram EFV 2.0 
     Antivirogram ETR 2.6 
     Antivirogram NVP 1.1 
     Antivirogram RPV 2.8 
E138Q   Antivirogram EFV 3.4 
    Antivirogram ETR 3.0 
    Antivirogram NVP 5.1 
    Antivirogram RPV 2.7 
E138R   Antivirogram EFV 2.2 
    Antivirogram ETR 3.6 
    Antivirogram NVP 4.4 
    Antivirogram RPV 3.3 
E138S   Antivirogram EFV 1.4 
    Antivirogram ETR 2.8 
    Antivirogram NVP 3.8 
    Antivirogram RPV 2.7 
G190A  G190A Antivirogram EFV 8.1 
     Antivirogram ETR 1.1 
     Antivirogram NVP >87 
     Antivirogram RPV 1.1 
G190S  G190S Antivirogram EFV 95 
     Antivirogram ETR 0.2 
     Antivirogram NVP 97 
     Antivirogram RPV 0.2 
H221Y   Antivirogram EFV 1.6 
    Antivirogram ETR 1.6 
    Antivirogram NVP 4.3 
    Antivirogram RPV 1.8 
IIIB-1  E138K, G190E Antivirogram EFV 12,346 
  K219N L100I, E138K, G190E Antivirogram EFV >15,924 
   E138K, G190E Antivirogram ETR 18 
     Antivirogram ETR 787 
  K219N L100I, E138K, G190E Antivirogram ETR >3,906 
   E138K, G190E Antivirogram RPV 12 
     Antivirogram RPV 114 
  K219N L100I, E138K, G190E Antivirogram RPV >1,830 
IIIB-2  K101E, Y181C Antivirogram EFV 20 
   L100I, K101E, Y181C, F227C Antivirogram EFV 3,895 
   L100I, K101E, V179F, Y181C, F227C Antivirogram EFV >21,241 
   K101E, Y181C Antivirogram ETR 45 
   L100I, K101E, V179F, Y181C, F227C Antivirogram ETR 4,878 
   K101E, Y181C Antivirogram RPV 35 
   L100I, K101E, Y181C, F227C Antivirogram RPV 5,491 
   L100I, K101E, V179F, Y181C, F227C Antivirogram RPV 13,921 
IIIB-3  V179F, Y181C, F227C Antivirogram EFV 174 
     Antivirogram EFV 546 
     Antivirogram ETR 286 
     Antivirogram ETR 7,382 
     Antivirogram RPV 100 
     Antivirogram RPV 7,716 
IIIB-4  Y181C Antivirogram EFV 5.4 
   V179F, Y181C, F227C Antivirogram EFV 428 
   Y181C, F227C Antivirogram EFV 784 
   Y181C Antivirogram ETR 5.7 
   V179F, Y181C, F227C Antivirogram ETR 1,722 
   Y181C, F227C Antivirogram ETR 245 
   Y181C Antivirogram RPV 5.0 
   V179F, Y181C, F227C Antivirogram RPV 315 
   Y181C, F227C Antivirogram RPV 627 
IIIB-5  K101E, V108I, Y181C Antivirogram EFV 31 
  K219E   Antivirogram EFV 403 
   K101E, V108I, Y181C, F227C Antivirogram EFV 1,688 
   K101E, V108I, Y181C Antivirogram ETR 27 
  K219E   Antivirogram ETR 117 
   K101E, V108I, Y181C, F227C Antivirogram ETR 2,566 
   K101E, V108I, Y181C Antivirogram RPV 24 
  K219E   Antivirogram RPV 144 
   K101E, V108I, Y181C, F227C Antivirogram RPV 2,155 
IIIB-6  L100I, K101E, Y181C, F227C Antivirogram EFV 1,025 
     Antivirogram ETR 112 
     Antivirogram RPV 2,023 
IIIB-WT   Antivirogram EFV 1.1 
    Antivirogram ETR 0.9 
    Antivirogram RPV 1.0 
K101E  K101E Antivirogram EFV 3.8 
     Antivirogram ETR 2.7 
     Antivirogram RPV 2.4 
K101P  K101P Antivirogram EFV 72 
     Antivirogram ETR 5.3 
     Antivirogram NVP >166 
     Antivirogram RPV 52 
K101Q   Antivirogram EFV 2.4 
    Antivirogram ETR 1.4 
    Antivirogram NVP 2.5 
    Antivirogram RPV 1.6 
K103N  K103N Antivirogram EFV 32 
     Antivirogram ETR 0.9 
     Antivirogram NVP >42 
     Antivirogram RPV 0.9 
K103S  K103S Antivirogram EFV 4.8 
     Antivirogram ETR 0.8 
     Antivirogram NVP 59 
     Antivirogram RPV 1.6 
L100I  L100I Antivirogram EFV 20 
     Antivirogram ETR 1.3 
     Antivirogram NVP 7.3 
     Antivirogram RPV 0.9 
M230I   Antivirogram EFV 5.0 
    Antivirogram ETR 3.5 
    Antivirogram NVP 14 
    Antivirogram RPV 2.7 
M230L  M230L Antivirogram EFV 5.9 
     Antivirogram ETR 3.6 
     Antivirogram NVP 20 
     Antivirogram RPV 3.4 
M230V   Antivirogram EFV 1.1 
    Antivirogram ETR 0.8 
    Antivirogram NVP 1.4 
    Antivirogram RPV 2.1 
M236L  P236L Antivirogram EFV 1.0 
     Antivirogram ETR 1.2 
     Antivirogram NVP 3.4 
     Antivirogram RPV 1.1 
SDM020001  Y181C Antivirogram EFV 1.8 
  N348I V108I, E138K, Y181C Antivirogram EFV 131 
   Y181C Antivirogram ETR 9.1 
  N348I V108I, E138K, Y181C Antivirogram ETR 1,674 
   Y181C Antivirogram RPV 3.1 
  N348I V108I, E138K, Y181C Antivirogram RPV 970 
SDM020059  V179F, Y181C Antivirogram EFV 4.5 
  N348I L100I, V108I, V179F, Y181C Antivirogram EFV >24,630 
   V179F, Y181C Antivirogram ETR 184 
  N348I L100I, V108I, V179F, Y181C Antivirogram ETR >3,041 
   V179F, Y181C Antivirogram RPV 8.0 
  N348I L100I, V108I, V179F, Y181C Antivirogram RPV >2,784 
SM041  E138K Antivirogram EFV 1.5 
    Antivirogram EFV 6.4 
   L100I Antivirogram EFV 28 
   L100I, V108I Antivirogram EFV 160 
   E138K Antivirogram ETR 2.0 
    Antivirogram ETR 3.1 
   L100I Antivirogram ETR 61 
   L100I, V108I Antivirogram ETR >41 
   E138K Antivirogram RPV 3.1 
    Antivirogram RPV 13 
   L100I Antivirogram RPV 186 
   L100I, V108I Antivirogram RPV >3,005 
SM051  L100I, K103N Antivirogram EFV 17,097 
     Antivirogram EFV >15,923 
     Antivirogram ETR 6.1 
     Antivirogram ETR 333 
     Antivirogram RPV 0.7 
     Antivirogram RPV >1,830 
SM052  L100I, K103N Antivirogram EFV 348 
  K219R K101E, K103N, V108I, Y181C Antivirogram EFV 4,238 
   L100I, K103N Antivirogram ETR 1.7 
  K219R K101E, K103N, V108I, Y181C Antivirogram ETR 269 
   L100I, K103N Antivirogram RPV 3.2 
  K219R K101E, K103N, V108I, Y181C Antivirogram RPV >1,947 
V090I   Antivirogram EFV 1.6 
    Antivirogram ETR 1.5 
    Antivirogram NVP 4.4 
    Antivirogram RPV 1.7 
V106A  V106A Antivirogram EFV 2.0 
     Antivirogram ETR 0.5 
     Antivirogram NVP 49 
     Antivirogram RPV 0.6 
V106M  V106M Antivirogram EFV 2.6 
     Antivirogram ETR 0.9 
     Antivirogram NVP 6.3 
     Antivirogram RPV 0.9 
V108I  V108I Antivirogram EFV 1.5 
     Antivirogram ETR 0.7 
     Antivirogram NVP 3.1 
     Antivirogram RPV 0.7 
V179D  V179D Antivirogram EFV 2.7 
     Antivirogram ETR 1.9 
     Antivirogram NVP 4.6 
     Antivirogram RPV 1.7 
V179E  V179E Antivirogram EFV 5.7 
     Antivirogram ETR 1.3 
     Antivirogram NVP 2.1 
     Antivirogram RPV 1.2 
V179F  V179F Antivirogram EFV <0.4 
     Antivirogram ETR <0.2 
     Antivirogram NVP 0.6 
     Antivirogram RPV <0.1 
V179T   Antivirogram EFV 1.0 
    Antivirogram ETR 0.7 
    Antivirogram NVP 0.8 
    Antivirogram RPV 1.5 
Y181C  Y181C Antivirogram EFV 2.1 
     Antivirogram ETR 4.0 
     Antivirogram NVP >43 
     Antivirogram RPV 2.7 
Y181I  Y181I Antivirogram EFV 1.6 
     Antivirogram ETR 12 
     Antivirogram NVP >66 
     Antivirogram RPV 15 
Y181V  Y181V Antivirogram EFV 3.0 
     Antivirogram ETR 15 
     Antivirogram NVP 2,156 
     Antivirogram RPV 12 
Y188L  Y188L Antivirogram EFV 43 
     Antivirogram ETR 1.1 
     Antivirogram NVP >42 
     Antivirogram RPV 2.8