<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Iqbal (2009)
Title Primary HIV-1 drug resistance and polymorphic patterns among injecting drug users (IDUs) in Chennai, southern India.
Citation J Int Assoc Physicians AIDS Care (Chic)
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 54
NumPts 54
Subtype C


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
100011 100011 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100014 100014 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162Y, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G  
100020 100020 None None   T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, I135T, K173A, Q174QK, D177DE, Q197QR, T200TA, Q207E, W212WG  
100021 100021 None None   V60I, W88C, K101Q, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177DG, T200A, I202V, Q207E, W212WG W71WG 
100025 100025 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173T, D177E, I178IM, T200A  
100027 100027 None None   S48T, V60I, D121Y, K122KE, T131TP, I135IV, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207E L149LF 
100030 100030 None None   S48T, K49R, V60I, K122E, D123E, I135V, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207QEGR, W212WG W71WG 
100031 100031 None None   S48T, K49R, V60I, V90VI, V111I, D121H, K122E, I135T, K166R, K173A, Q174QK, D177EK, V189I, I195IL, T200A, Q207E, W212WG W71WG 
100032 100032 None None M41ML  S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, T165I, K173A, D177E, V189I, T200A, I202V, Q207E, R211RK, W212WG W71WG 
100033 100033 None None   S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, I135T, E138EG, K173AT, D177E, T200A, Q207E, W212WG W71WG 
100037 100037 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207E  
100038 100038 None None   V60I, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100040 100040 None None   S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K166R, K173A, D177E, V189I, T200A, I202IV, Q207E, L210S  
100045 100045 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, Q174QR, D177E, E194EG, T200A  
100048 100048 None None M184MR  S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, V189I, I195IM, R199RG, T200A D185DE, L187LW 
100058 100058 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173AT, D177E, V189I, T200A, Q207E  
100060 100060 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207E  
100061 100061 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E  
100068 100068 None None   S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100075 100075 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K102KR, D121Y, K122E, E169K, K173A, D177E, V189I, T200V, Q207E  
100076 100076 None None   V35M, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A  
100079 100079 None None   T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, V148VG, T165I, K173A, D177E, V189VI, T200A, Q207E  
100084 100084 None None   T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, T131TP, S162SN, E169K, K173AE, D177E, T200E, Q207E  
100085 100085 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100089 100089 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207R, R211Q  
100097 100097 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165I, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207A, R211K Y115YH 
100098 100098 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166KR, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207E L149LF 
100108 100108 None None   V35T, T39N, E42EK, G45GE, S48T, K49KR, V60I, D86DN, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, V179I, V189I, T200V, Q207E  
100110 100110 None None   V35MT, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166KR, K173AT, D177DE, V189VI, Q197H, T200A, Q207E  
100113 100113 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, T200A, Q207E, R211K  
100127 100127 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, T200A, Q207E  
100138 100138 None None   S48T, K49KR, V60I, W88WG, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, N175NH, D177E, T200A, Q207DE W71WG 
100141 100141 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211RG, W212WG  
100142 100142 None None   S48T, V60I, K102R, K104R, K122E, I135R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
100163 100163 None None K65KN  S48T, V60I, T69TI, K122E, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E T58TI, H96HR, A98AE 
100165 100165 None None   S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, I178IV, T200A, Q207E, R211K, F214FL  
100169 100169 None None   T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165TI, K173A, D177E, T200A, I202IV, Q207AG  
100185 100185 None None   T39N, S48T, K49R, V60I, D121DY, K122E, K166R, K173A, D177E, V179I, V189I, T200V, Q207E  
100186 100186 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123DG, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100188 100188 None None   V35P, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100189 100189 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, Q174QR, D177E, E194EG, T200A  
100192 100192 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E  
100205 100205 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, S162SAGT, K173A, T200A I135GR 
100212 100212 None None   K32N, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135L, S162D, K173A, D177E, T200A, E204KQ, Q207E  
100245 100245 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T165I, K173A, D177E, V189I, T200V, Q207E  
100251 100251 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, K102KR, D121H, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100261 100261 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207A, L210F, R211K  
100263 100263 None None   S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, V189I, Q197R, T200A, Q207E  
100294 100294 None None   K32N, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, T131TP, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100302 100302 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, T131TP, I159IV, E169D, K173AT, Q174K, D177E, T200A  
100309 100309 None None   T39D, S48T, K49KR, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
100321 100321 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207G  
100438 100438 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E P226PL 
100874 100874 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, T165I, K173A, D177E, V189I, T200A, I202V, Q207E