<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ayouba (2009)
Title Low prevalence of HIV type 1 drug resistance mutations in untreated, recently infected patients from Burkina Faso, Cote d'Ivoire, Senegal, Thailand, and Vietnam: The ANRS 12134 study.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 267
NumPts 267
Subtype CRF01_AE, CRF02_AG, CRF06_cpx, A, B, C, CRF11_cpx, K, D, G, CRF09_cpx


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Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 267 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
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0.406 0.406-MRT None None   V35T, T39L, V60I, V106I, K122E, D123N, K173T, Q174K, I178M, E194K, T200A, Q207E, R211K  
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0.428 0.428-FRT None None   K11E, V35T, T39L, V60I, D121H, K122E, D123S, I135K, S162H, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K E233T 
0.603 0.603-TRT None None   V35I, E36D, I135V, I142V, S162A, K173S, D177E, V179I, Q207A  
0.606 0.606-CRT None None   V21I, V35T, V60I, K122V, D123N, K173Q, Q174R, D177E, T200G, Q207E, R211K  
0.607 0.607-FRT None None   V35I, E36D, D123E, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
0.610 0.610-VRT None None   K102Q, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N  
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0.614 0.614-MRT None None   V35T, T39M, V60I, S68G, I135V, A158S, S162A, T165I, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E  
0.615 0.615-SRT None None   V35T, E36D, E40D, K49R, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174R, D177E, D192N, G196E, T200A, Q207E, R211K  
0.618 0.618-ERT None None   V35T, E36D, V60I, K122E, D123N, R125K, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A  
0.621 0.621-MRT None None   E6G, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E V8C 
0.623 0.623-YRT None None   E6D, K20R, V21I, V35T, T39L, V60I, S162C, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211K  
0.624 0.624-DRT None None   T39S, K122Q, I142V, K173S, Q174K, D177E, I195L, T200V, R211K  
0.625 0.625-JRT None None   V35R, S162A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211Q  
0.626 0.626-PRT None None   V35T, E36D, S48T, K49R, V60I, I135V, T139A, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
0.635 0.635-BRT None None   L34I, V35T, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K D177T 
0.637 0.637-PRT None None   V35T, V60I, K122E, D123N, I135V, I142V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, K201T, Q207D, F214L  
0.640 0.640-FRT None None   V21I, K32I, V35T, T39A, K49R, V60I, D123S, I135K, S162A, Q174R, N175A, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K  
0.649 0.649-ZRT None None   V35T, E36D, K102Q, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A  
0.651 0.651-BRT None None   V35K, V60I, S68G, I135T, S162A, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
0.653 0.653-URT None None   V35T, V60I, K122E, D123N, I135L, I142V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E  
0.658 0.658-MRT None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162H  
0.660 0.660-ERT None None   K32R, V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, Q174K, N175Y, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
0.663 0.663-JRT None None   V35T, T39A, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174T, D177E, T200A, Q207E  
0.665 0.665-DRT None None   V35T, E36D, T39R, V90I, K104N, D123E, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
0.666 0.666-NRT None None   V35T, T39I, V60I, K122E, D123N, I135K, S162Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, T240S, P243H, V245Q E233T 
0.672 0.672-NRT None None   V35T, T39L, K122E, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207E, F214L  
208 208-DRT None None   V35T, T39L, K122E, D123N, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
2658 2658HALDRT None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123AS, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245EQ, D250E  
RES002 RES002-9RT None None   D121H, K122E, I135L, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178L, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
RES008 RES008-9RT None None   T39A, E40D, V60I, V106I, D123E, I135V, I142V, S162A, K173A, D177E, V179I, I195L, T200S, I202V, Q207A, R211K, V245M  
RES012 RES012-9RT None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207D, V245Q, D250E  
RES020 RES020-1RT None None   V35T, T39A, K49R, I135V, S162D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211T, V245Q, E248N  
RES023 RES023-1RT None None   V35T, E36D, T39M, V60I, K122E, D123S, I135V, Q145H, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
RES024 RES024-1RT None None   V35T, E36D, T39K, K49R, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E H235R 
RES027 RES027-1RT None None   V35T, V90I, V118I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211G, F214L  
RES028 RES028-1RT None None K70N  V35T, E36D, T39K, D121H, K122E, A158S, S162A, K173T, Q174K, P176S, D177E, T200A, Q207G, R211K  
RES029 RES029-2RT None None   V35T, E36A, T39E, E42K, K122P, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177EK, T200A, Q207E, R211K R78RK, R143RK 
RES034 RES034-1RT None None   T39L, K122Q, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
RES038 RES038-1RT None None   G45E, V60I, K102R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RES042 RES042-1RT None None   V35T, T39A, K122E, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, E224D, V245Q  
RES059 RES059-2RT None None   D121Y, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RES208 RES208-8RT None None   K43R, V60I, F87L, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
RES225 RES225-8RT None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162C, T165I, K173N, D177E, V179I, Q207A, P243T, V245Q, E248D  
RES226 RES226-8RT None None   T39S, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
RES229 RES229-8RT None None   V35T, D86E, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, E224K  
RES231 RES231-8RT None None   V35T, T39L, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200V, Q207D, R211K, V245Q  
RES243 RES243-8RT None None   T39M, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E  
RES245 RES245-8RT None None   I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245E  
RES250 RES250-8RT None None   E40D, I135V, E138A, S162A, K173I, Q174K, D177G, T200A, Q207G, R211K, V245T  
RES601 RES601RT None None   K102R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, P243H, V245Q  
RES603 RES603RT None None   E42X, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207D, F214L, V245Q, E248D  
RES604 RES604RT None None   K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
RES605 RES605RT None None   T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, S162H, E169K, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q, K249Q  
RES607 RES607RT None None   T39K, V60I, D121H, K122E, I132V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
RES609 RES609RT None None  V179E E42X, V60I, K102E, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174E, D177E, I178M, V189I, T200A, I202V, E204K, Q207G, R211K, V245Q  
RES610 RES610RT None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135V, A158S, S162D, T165I, Q174K, D177E, T200V, I202V, Q207E, V245Q, E248N, D250E  
RES613 RES613RT None None   D123E, I135V, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
RES617 RES617RT None None   K49R, V60I, I135T, S162C, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207T, R211K, L228F, V245Q, E248D  
RES619 RES619RT None None   V90I, K122P, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q A129S 
RES620 RES620RT None None   T39L, W88C, R125RK, I135T, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, F214L, V245Q  
RES621 RES621RT None None   T39A, I50T, K122A, I135V, S162A, E169D, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
RES622 RES622RT None None   T39I, S68G, K122E, D123N, S162A, K166R, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245T, D250E  
RES628 RES628RT None None   D121H, I135L, S162A, T165I, K173I, Q174K, D177E, T200E, Q207E, E248D  
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RES632 RES632RT None None   K102R, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RES634 RES634RT None None   T39A, E40D, K122E, D123N, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245E, E248D  
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RES642 RES642RT None None   G45E, V60I, R83K, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
RES647 RES647RT None None   V35T, E36D, T39M, K122E, D123N, I135L, S162A, K166R, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q, E248N F130V, I132T 
RES649 RES649RT None None   E40D, K122P, D123E, S162A, K173R, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245T  
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TE10030 TE10030RT None None   T39A, E40D, K104R, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
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TE10100 TE10100RT None None   E36D, K49R, K122E, I135V, S162A, E169D, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211T, P243T, V245Q, E248D  
TE10150 TE10150RT None None   V35T, E36A, K49R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
TE10180 TE10180RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207N, R211K, V245Q G231GE