Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Jayaraman (2006)
Title A population-based approach to determine the prevalence of transmitted drug-resistant HIV among recent versus established HIV infections: results from the Canadian HIV strain and drug resistance surveillance program.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 403
NumPts 403
Subtype B, C, A, CRF01_AE, D, CRF02_AG, Unknown, CRF09_cpx


  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 403 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1-00-0002 1-00-0002 None None   V35I, T69N, R83K, Q207E, R211K P247R 
1-00-0003 1-00-0003 None None K70Q  E40A, S162C, R211K L26F 
1-00-0006 1-00-0006 None None   K122E, K173T, D177E, T200A, Q207G, R211K, E248ED  
1-00-0007 1-00-0007 None None   D17DV, S162C, E203G, R211K L26LF, G99GV, Y232YC 
1-00-0008 1-00-0008 None None   D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, V189I, S251SR  
1-00-0009 1-00-0009 None None   I50V, R83K, S162C, R211K, K249N P25PLR, L26F, F87FY, K220KR 
1-00-0010 1-00-0010 None None  A98G E6D, D17G, A62P, T200E, Q207E, R211K, F214FIV D186E 
1-00-0011 1-00-0011 None None T215TS  K64R, I135T, T200A, F214L E53EDHQ, D113Y 
1-00-0012 1-00-0012 None None   V35I, R83K, G99X, K102Q, D121H, K122E, I135R, K154E, S162Y, Q174LR, R211G, V241L, D250E L26LF, I37IM, Y115C, R199I, Q222QH, K223KI, W229L 
1-00-0013 1-00-0013 None None   V35VI, R211K, E248EK P247P*QS 
1-00-0015 1-00-0015 None None   V60I, D67X, K102Q, D123E, E138A, I142T, S162C, K173T, G196E, E248D L26LF 
1-00-0016 1-00-0016 None None   R83K, K122E, D123N, I135T, K173R, Q174K, I178M, R211K L26LF, T27TK 
1-00-0020 1-00-0020 None None   P14T, V35I, E138A, I142T, S162C, R211K E248EG, K249K* 
1-00-0021 1-00-0021 None None   I5V, V35T, T39K, V60I, S162C, R211K, D250DE P217PQ 
1-00-0023 1-00-0023 None None   I5V, V35T, T39K, E53Q, V60I, I135V, D177E, E204K, Q207E, V245I, D250E, S251N  
1-00-0024 1-00-0024 None None   D17DV, V35I, E40EK, E44D, K49R, A62T, D123E, T165I, E169D, I178L, I202V L26F, R83N, D113Y 
1-00-0025 1-00-0025 None None   P14T, V35I, I142N, S162C, T200I, Q207P, V245E, D250E L26F, L246W, P247R 
1-00-0026 1-00-0026 None None K70KQ  K122E, I135T, S162C, T200A, E248D E233EA 
1-00-0027rc 1-00-0027rc None None M184V  V35T, E36A, T39E, K43R, G45X, K122E, D123G, A158S, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, K249Q W24C 
1-00-0028 1-00-0028 None None  V108I, V179E, Y181S, Y188S, P236PHLR V35T, E53Q, V60I, D121Y, K122E, D123E, S134G, I135R, Q145*, I159V, S162G, S163G, K166I, L168*, F171X, R172RG, D177E, L193LF, I195V, Q197PR, I202IM, Q207G, R211K, F214X, L228X, V245E, E248ED P119T, K126T, I132M, N136DE, N137G, N147D, P150PLQR, Q161AEGV, M164V, I167IFLV, L187W, S191SC, E194EAGV, R199GS, P217PLQR, E233EAGV, T240TIKR 
1-00-0028-1 1-00-0028-1 None None  V108I, V179E V35T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135RT, D177E, Q207E, R211K, V245E  
1-00-0029 1-00-0029 None None   P14T, V35E, K49R, R83K, I142T, Q207R, V245K  
1-00-0030 1-00-0030 None None K70Q  P4S, V35T, E36A, T39E, E42D, K43T, E53Q, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243A, V245Q L26F, T27K 
1-00-0030a 1-00-0030a None None K70KN, K219KN Y188YF, F227FL P4PS, V35T, E36A, T39E, E42D, K43T, E53EQ, K122E, K126KR, S134SR, E138ED, Q145QH, N147NY, A158APS, K173KRT, D177E, I180IV, Q207QEK, F214FLV, V245VLM, D250DE L26LF, T27K, D110DV, S117SL, F130FL, Y146Y*, K154K*R, Q161QH, R172RS, Q174QPR, N175NK, Y183Y*, L205LV, Y232YD, W239W*, E248EAPQ, W252WC 
1-00-0031 1-00-0031 None None   T69S, S162C, R211K, S251T  
1-00-0032 1-00-0032 None None   V179I, T200A, R211K D250Y 
1-00-0032a 1-00-0032a None None   V179I, T200TA, R211K D250Y 
1-00-0033 1-00-0033 None None   I142T, T165I, I202V, E204D  
1-00-0034 1-00-0034 None None K70E  E6D, T165I, T200A, I202V, S251I L26LF, E53EKQ, G99A 
1-00-0035 1-00-0035 None None   K64R, I135T, T200A, F214L, E248D L26F 
1-00-0036 1-00-0036 None None  A98G V35I, R83K, I135T, K166KR, I202V, R211K, V245Q, D250E  
1-00-0037 1-00-0037 None None   E28G, V35I, R83K, K122E, I135T, S162C, E194D, G196GE, T200A, Q207E, R211K D113H 
1-00-0038 1-00-0038 None None   R83K, K122E, D123N, I135T, K173R, Q174K, I178M, R211K, V245I  
1-00-0038a 1-00-0038a None None   R83K, K122E, D123N, I135T, K173R, Q174K, I178M, R211K, V245VI  
1-00-0039 1-00-0039 None None   K20R, G99X, D123E, K166R, V245K, D250E  
1-00-0039A 1-00-0039A None None   K20R, D123E, K166R, V245K, D250E  
1-00-0040 1-00-0040 None None   K122E, R211K  
1-00-0041 1-00-0041 None None   D121Y, K122E, S162C E53H 
1-00-0041A 1-00-0041A None None   D121Y, K122E, S162C E53DH 
1-00-0042 1-00-0042 None None   K20R, K32KR, V35I, V60I, R83K, I135T, I195L, V245E, K249Q  
1-00-0042A 1-00-0042A None None   K20KR, V35VI, V60I, R83K, I135T, I195L, V245VE, K249KQ  
1-00-0043 1-00-0043 None None   S162C, I178M, R211N L26LF, D113DN 
1-00-0044 1-00-0044 None None   K122E, G196E, E204KR, Q207E, V245E  
1-00-0044A 1-00-0044A None None   K122E, G196E, E204EK, Q207E, V245E  
1-00-0045 1-00-0045 None None D67N  K32Q, T139I, Q182*, V189I, G196K, Q207E, R211S, P243L, P247L, E248D K22P, Q23P, D113H, W153C, K154K*EQ, I180M, P217Q, K223I 
1-00-0045A 1-00-0045A None None D67DN  K22X, K32KQ, T139I, V189I, G196K, Q207E, R211S, P243L, P247PL, E248D Q23QHP, D113H, W153WC, I180M, P217Q, K223KI 
1-00-0046 1-00-0046 None None   R83K, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, I178M, T200I, R211K  
1-00-0046A 1-00-0046A None None   R83K, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, I178M, T200I, R211K  
1-00-0049 1-00-0049 None None   E6D, D86E, K122P, D123E, S162Y, Q207E L26F, N57K, D113Y 
1-00-0049A 1-00-0049A None None   E6D, D86E, K122P, D123E, S162Y, Q207E L26F, N57K, D113Y 
1-00-0050 1-00-0050 None None   E53*, S162C, T200A, V245E D113Y 
1-00-0051 1-00-0051 None None   K64R, K122V, I135V, T165I D113Y 
1-00-0051A 1-00-0051A None None   K64R, K122V, I135V, T165I D113Y 
1-00-0052 1-00-0052 None None   I178M, R211K, V245K, S251N D113N, D192DHNY 
1-00-0052A 1-00-0052A None None   I178M, R211K, V245K, S251SN D113N 
1-00-0053 1-00-0053 None None   R211K  
1-00-0053A 1-00-0053A None None   R211K  
1-00-0054 1-00-0054 None None   K102Q, I135T, S162C, R211K, V245M  
1-00-0055 1-00-0055 None None L210W  V60I, I135T, Q207R, R211K, V245M L26LF 
1-00-0056 1-00-0056 None None   K20R, E28K, V35I, R83K, I135T, V245E, D250DE  
1-00-0056A 1-00-0056A None None   K20R, E28K, V35I, R83K, I135T, V245VE  
1-00-0058 1-00-0058 None None   D123E, S162C, K173R, D177E, G196E, Q207S, R211K  
1-00-0059 1-00-0059 None None   K20R, V35I, V60I, R83K, I135T, I195L, V245E  
1-00-0060 1-00-0060 None None   K20R, A98S, D123E, T165I, E169D, Q174K, G196E, T200A, I202V, R211K, F214L  
1-00-0061 1-00-0061 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243S, V245Q  
1-00-0062 1-00-0062 None None   T69S, S162C, R211K  
1-00-0063 1-00-0063 None None   D123E, I135T, S162C  
1-00-0064 1-00-0064 None None   K64R, I135T, T200A, F214L, E248D  
1-00-0067 1-00-0067 None None   Q23X, K122E, R211K, F214L, E248D  
1-00-0068 1-00-0068 None None   E6D, I135T, S162C  
1-00-0070 1-00-0070 None None   V179I, T200A, R211K  
1-00-0071 1-00-0071 None None   V35T, A98S, K122E, I135T, R211K  
1-00-0072 1-00-0072 None None   S162C, T200A, E203G, V245E  
1-00-0073 1-00-0073 None None   I135T, S162C, V245K  
1-00-0075 1-00-0075 None None   V35I, R83K, I135T, S162HN, K166R, I202V, R211K, V245Q W24C, L26S, T27K 
1-00-0077 1-00-0077 None None   T69S, G196K, Q207A, F214L I47M 
1-00-0080 1-00-0080 None None   D123E, S162C, K173R, G196E, Q207A, R211K  
1-00-0081 1-00-0081 None None   K102Q, D121Y, K122E, I135T, S162C, R211K, V245I  
1-00-0082 1-00-0082 None None   V35T, E36A, T39E, I50IM, A98S, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1-00-0084 1-00-0084 None None   K64R, I135T, T200A, F214L, E248D  
1-00-0085 1-00-0085 None None   E53D, D121Y, K122E, S162C  
1-00-0086 1-00-0086 None None   P14T, V35I, K102KM, I142N, S162C, T200I, V245VEKM  
1-00-0087 1-00-0087 None None   I5IV, E6EK, V35Q, T39K, A98S, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q Q23R 
1-00-0088 1-00-0088 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207N, R211S, K238R, V245E L26LF 
1-00-0089 1-00-0089 None None   E28G, V35I, E53D, L100*, K122E, I135T, S162C, E194D, G196E, T200A, Q207E, R211K  
1-00-0090 1-00-0090 None None   K122E, R211K  
1-00-0091 1-00-0091 None None   E53D, D121Y, K122E, S162C  
1-00-0092 1-00-0092 None None   R211K, E248D  
1-00-0094 1-00-0094 None None   V35I, R83K, K101R, D123E, I135T, S162C, T200I D186N 
1-00-0096 1-00-0096 None None   W24*, S162C, I178M, R211N L26I 
1-00-0097 1-00-0097 None None   V35VI, K122P, I135T, S162C, T200TA, Q207E, F214L  
1-00-0098 1-00-0098 None None   E6D, V8I, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, I135T, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E  
1-00-0099 1-00-0099 None None   K102Q, I135T, S162C, R211K, V245M Q197Y 
1-00-0101 1-00-0101 None None   K122E, D123E, I132V, D177E, T200A, R211G P19A 
1-00-0102 1-00-0102 None None  L234I I135T, S162C, R211G, E233D L34LIV 
1-00-0103 1-00-0103 None None   S162C, T200A, V245E  
1-00-0104 1-00-0104 None None   K102R, S162C, K173E, I178M, Q207DH, R211K  
1-00-0106 1-00-0106 None None   V90I, F171Y, Q174K, R211K, V245M  
1-00-0107 1-00-0107 None None   K49KR, K64R, V106I, I135T, R211K, F214L  
1-00-0108 1-00-0108 None None   K122E, D123N, I135T, E169D, Q174K, G196E, T200A, I202IV, E203D, Q207E, F214L