<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ferreira (2008)
Title Molecular characterisation of newly identified HIV-1 infections in Curitiba, Brazil: preponderance of clade C among males with recent infections.
Citation Mem Ins Oswaldo Cruz
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 49
NumPts 49
Subtype B, C, F

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
211 BR02PR211 None None   V35T, S68G, K102Q, K122E, D123N, I135T, E138A, T165I, K166Q, T200A, D250E, A272S, K277R, V292I, I293V, K311R  
212 BR02PR212 None None   K64R, A98S, E138A, K166R, Q197E, T200A, I202V, V245K, A272G, K277R, A288S, I293V, P294T, K311R  
36 BR06PR36 None None   A98S, I135T, I202V, R211K, V245E  
37 BR06PR37 None None   D121H, K122E, D123E, I135T, P176T, T200A, V245M  
38 BR06PR38 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, A158S, K173A, P176S, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
39 BR06PR39 None None   D121H, K122E, D123E, I135T, T200A, P243H  
40 BR06PR40 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, D177E, R211Q, V245Q  
41 BR06PR41 None None   K20R, V60I, T69S, D86E, W88C, A98S, I135T, E138A, K173E, I202V, R211A, F214L, V245E  
412 BR05PR412 None None  K103N V60I, D123E, I135R, S162C, D177E, R211K, D250T, A272P, K277R, I293V, E297K  
413 BR05PR413 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, I135T, K173A, T200A, Q207E, R211K, P243T  
42 BR06PR42 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K64R, I142V, P176S, T200A, Q207E, R211K, E224X  
427 BR05PR427 None None   K20R, D121H, K122E, S162D, K166R, D177E, Q207E, R211K, P243T Q197S 
428 BR05PR428 None None   K32R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207G, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D  
429 BR05PR429 None None   K49R, S68G, K102Q, K122E, I135T, P243T, V245M  
43 BR06PR43 None None   P4S, V35T, T39K, S48T, V118I, K122E, I135R, A158S, K173T, Q174K, D177E, V179A, T200A, I202V, Q207G, R211K, F214L, V245Q, A272P, V276T, T286A, A288S, E291D, V292I, I293V, G335D  
430 BR05PR430 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
431 BR05PR431 None None   I135A, K173E, N175H, T200A, Q207E, R211K, L228I  
432 BR05PR432 None None   K20R, K122E, I135T, S162A, V179I, T200A, I202V, F214L, V245K  
433 BR05PR433 None None   K32R, V35L, D121Y, K122E, I178M, T200A, Q207E, L210M, I293V, T296S, E297K, V317S  
434 BR06PR434 None None  E138K K20R, I178M, Q197L, T200Q, I202V, E204G  
435 BR05PR435 None None   K49R, I135T, T165I, E169D, T200I, P243T  
436 BR05PR436 None None   K122E, D123N, I142M, Q174R, I195L, G196E, T200I, I202V, R211K  
437 BR05PR437 None None   V35I, R83K, K122E, I135T, I202V, Q207L, R211K, P243H  
44 BR06PR44 None None  V108I K20R, D123E, I135T, D177E, R211K, V245M  
448 BR05PR448 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, S162T, K166R, F171Y, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, P243H  
45 BR06PR45 None None   K166R, K173Q, I178M, Q207E, R211K  
46 BR06PR46 None None   V35M, S48T, A98S, D123E, I135T, S162C, T200A, Q207N, L210F, R211K, L228H  
47 BR06PR47 None None   D123N, I178M, Q207E, R211K  
48 BR06PR48 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, I135T, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
49 BR06PR49 None None   E6A, K122E, D123E, I142V, K166R, E169D, D177E, R211S  
50 BR06PR50 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123S, I135T, E138A, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250X  
51 BR06PR51 None None K70R, M184V, K219Q  A98S, I135T, Q197L, I202V, R211K, F214L  
52 BR06PR52 None None   K173E, N175H, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293V, E297D, G335D  
53 BR06PR53 None None   K122E, I135T, G196E, T200A, Q207E, V245M  
622 BR06PR622 None None A62V  E6R, I50V, K122E, I135T, I178L, R211K, T240R M230I 
623 BR06PR623 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K, M230R, T240R  
626 BR06PR626 None None   V35T, T39E, S48T, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, T240S V241R 
627 BR06PR627 None None   D123E, I135T, Q207H  
63 BR04PR63 None None   V35T, E36T, T39D, S48T, D121H, K122E, D123E, S162A, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I326V, Q334E, G335D  
631 BR06PR631 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D121H, K122E, T139A, K173V, D177E, Q207E, R211K, T240R  
632 BR06PR632 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, M230R, T240R  
634 BR06PR634 None None   D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, R211K  
635 BR06PR635 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177G, T200A, I202V, Q207K, R211K, M230R, T240R D17Y 
64 BR04PR64 None None   K11N, T27S, V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, D121H, K122E, D123S, I135T, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, V314A P150A, K275I 
821 BR06PR821 None None  K103N E6Q, K20R, K49R, K122E, I135T, I142L, Q174H, Q207E, R211K, V245M  
822 BR06PR822 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
823 BR06PR823 None None   K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207N, R211K, F227Y  
824 BR06PR824 None None   A98S, I135T, N175Y, I202V, R211K, T240A  
826 BR06PR826 None None  V179D K32E, V35T, E36A, T39K, K43E, D121Y, K122E, I135K, S162C, E169K, K173E, D177E, T200A, Q207E, R211K, T240A M230K 

Database

Resources

Team