<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Bellocchi (2005)
Title Subtype analysis and mutations to antiviral drugs in HIV-1-infected patients from Mozambique before initiation of antiretroviral therapy: results from the DREAM programme.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 59
NumPts 58
Subtype C, G

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
002 MC002 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123NS, E138A, T139V, Q145C, S162Y, K173I, Q174K, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, K275R, K277R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V, V317G  
003 MC003 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123DGNS, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, S251D, A272P, T286A, V292I, I293V, V314VI E291AT 
005 MC005 None None   V35Q, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, E138A, K173M, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, D250DG, A272P, K275R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V  
045 MC045 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, S251I, A272P, I274V, T286A, E291D, V292I, I293V, E297EAKT  
052 MC052 None None   V60I, D121Y, K122E, S162CY, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248DN, D250E, S251I, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
057 MC057 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, K122A, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286TA, E291D, V292I, I293V, V317A  
060 MC060 None None   K20R, V35T, E36EA, T39X, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245EQ, D250E, S251D, A272P, T286A, V292I, I293V E291AT 
068 MC068 None None  V179E V21VI, V35T, E36A, T39E, S48ST, E53D, K102Q, V118VA, K122E, D123DGNS, E169EG, R172RK, K173T, Q174QR, I178IM, T200A, I202V, Q207K, R211RK, V245Q, A272P, K277KR, E291D, V292I, I293V N136NT, D177DY 
078 MC078 None None   V35AT, E36A, T39DE, V60I, D121Y, K122E, E138D, K173T, T200A, I202V, E204K, Q207E, F214L, V245K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A K263N 
093 MC093 None None   V35T, E36A, T39DN, S48T, K122E, D123N, S162H, K173A, D177E, Q207E, V245Q, A272K, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
096 MC096 None None   V35T, T39E, A98AS, K122E, D123DGNS, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272AT, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V  
102 MC102 None None   K22R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S163T, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, Q278N, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1067 MT001067 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122KE, D123NST, A158S, K173A, D177E, G196M, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245L, D250E, A272P, K277KR, Q278N, L279I, T286A, E291D, V292I, I293V  
1137 MT001137 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104KR, D121HY, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207ADE, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V G273GR 
1229 MT001229 None None   V35T, E36EA, T39E, S48ST, V60VI, K122E, D123S, I135V, A158S, K173A, Q174QK, D177E, G196K, T200A, R211K, V245K, E248D, D250E, A272P, K277R, L279LM, T286A, E291D, I293V  
1254 MT001254 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, T200R, Q207E, R211K, V245Q, D250S, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1264 1264 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, F171Y, K173A, D177E, T200A, Q207AE, R211RK, V245Q, E248DN, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V D250H 
1284 MT1284 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123NS, I135V, I142IT, K173A, D177G, Q207G, V245K, A272P, I274V, E291D, V292I, I293V  
1311 MT1311 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123DG, K166KR, T200A, Q207DEKN, R211K, F214FL, V245Q, D250E, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
1320 MT001320 None None   P4H, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123X, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
133 MC133 None None   V35KT, E36A, T39DE, S48T, V60I, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
134 MC134 None None   V35T, E36A, T39E, S48ST, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, L310I  
1346 MT001346 None None   K11Q, V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I142V, K166R, K173A, Q174K, D177DE, T200A, Q207AG, R211K, V245Q, D250E, S251C, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
135 MC135 None None   K20R, K22R, V35T, S48T, K122E, D123N, T165I, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E, S251N, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
141 MC141 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, W88C, K122E, D123N, I135T, K166KR, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245X, E248EDKN, D250DE, A272P, K275R, K277KR, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, L301I, K311KR  
146 MC146 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250T, A272P, T286A, V292I, I293V, E297A  
147 MC147 None None   V21I, T39E, S48T, V60I, K122KE, I135T, K173T, I178IM, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245HQ, E248ED, A272P, E291D, V292I, I293V Y146YC 
148 MC148 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48ST, E53D, K122KE, D123N, K173A, Q174K, G196T, T200A, Q207E, R211K, V245I, A272P, K277R, L283LI, E291D, V292I, I293V  
157 MC157 None None  V179VD V35T, E36A, T39E, S48ST, K122E, A158AS, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207QAEP, R211K, V245K, A272P, L279M, T286A, E291D, V292I, I293IV, E297A, V317VA  
159 MC159 None None   V8I, V35T, T39E, S48T, V60VIL, D121H, K122E, I135IT, T139TA, I142IV, K173AT, Q174K, D177E, I178L, V179VI, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K275R, Q278H, T286A, E291D, V292VI, I293V V118VL 
164 MC164 None None   V35T, E36AV, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248V, D250DE, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V G273R 
1705 MT001705 None None   E6A, V35T, E36A, T39E, E40ED, S48T, K122E, D123GS, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V  
219 MT000219 None None   P4S, V8I, V21VI, V35T, T39K, S48T, K122E, D123S, T165I, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, R284K, E291D, V292I, I293V  
278 MT000278 None None   V35T, T39EK, S48T, K49KR, K122E, D123G, I135T, T165I, D177G, T200A, Q207E, R211K, F214L, A272P, K275KQ, T286A, E291D, V292I, I293V  
313 MT000313 None None   E6K, V35T, T39E, S48T, K122E, D123E, S162D, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200AV, Q207E, V245H, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
318 MT000318 None None   V8I, V35K, E36A, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123G, S162T, K173T, Q174K, T200A, Q207K, R211AE, V245EK, D250E, T286A, E291D, V292I  
337 MT000337 None None   M16MT, K20KR, V35T, T39E, V118I, K122E, D123S, I135T, T165I, K166R, K173T, Q174R, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248DN, A272P, K275R, K277R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V  
339 MT000339 None None   K20R, E28D, V35T, T39K, S48T, K122E, D123S, S162C, K173A, D177G, T200A, Q207A, V245Q, A272P, I274V, E291D, V292I, I293V  
370 MT000370 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D86DN, W88C, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
  MT000360 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D86DN, W88WC, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I E248E* 
388 MT000388 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, E169D, K173A, D177E, I178IM, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272S, E291D, V292I, I293V  
390 MT000390 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, Q207E, L210LF, R211RK, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
416 MT000416 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294Q  
438 MT000438 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243PH, V245Q, E248D, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, E297D  
500 MT000500 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162A, K173T, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, K277R, Q278N, T286A, V292I, I293V  
518 MT000518 None None   V35A, E36A, T39E, S48T, A98S, K122E, D123N, K166R, K173E, D177E, I178IL, G196X, T200A, E204K, Q207D, R211K, V245Q, S251N, A272P, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V  
543 MT000543 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, I135V, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211RK, V245Q, L260LI, A272P, K275Q, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V  
571 MT000571 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, Q174K, T200A, I202IV, Q207E, V245Q, A272P, K275R, K277R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V  
577 MT000577 None None   V35T, E36A, T39E, E44EK, S48T, V60I, K122E, D123GS, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293IV  
589 MT000589 None None   T27A, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K166R, K173A, D177E, T200E, Q207EG, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
599 MT000599 None None   E6D, V35T, E36I, T39E, S48T, K101KR, K122E, D123S, I135M, S162C, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211RI, V245EK, K249R, D250E, S251SN, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V  
649 MT000649 None None   V8I, V35K, E36EA, T39E, S48T, V60I, K122KE, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245EK, A272P, E291D, V292VI, I293IV  
654 MT000654 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, E138A, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, V317A  
727 MT000727 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123NS, K173A, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, D250E, S251DN, A272P, K275Q, Q278QH, T286A, E291D, V292I, I293V  
751 MT000751 None None   K20KR, V35T, E36A, T39E, E40ED, S48T, V60I, K102KQ, S105SA, D121Y, K122E, D123G, I135IV, K173A, Q174KR, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, V276VI, K277KR, K281R, T286A, E291D, I293V G273GR 
779 MT000779 None None   V8I, V35T, T39A, E40D, S48T, K122AE, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, A272P, K275Q, V276T, Q278K, T286A, E291D, V292VI, I293V, K311R  
859 MT000859 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250N, A272Q, K277R, E291D, V292I, I293V V118VG 
879 MT000879 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123GS, K166T, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207D, R211K, V245Q, D250NS, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
896 MT000896 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, H208HY, R211RK, V245K, E248D, D250E, A272K, K277R, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V  

Database

Resources

Team