<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Galluzzo (2007)
Title Antiretroviral resistance mutations in untreated pregnant women with HIV infection in Uganda and Rwanda.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 72
NumPts 72
Subtype A, D, C, CRF01_AE, CRF10_CD

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
21830 RW_21830 None None   K122E, D123N, I135IT, A158AS, K173S, V179VI, Q207A, R211S, F214FL, V245Q  
21860 RW_21860 None None   T39TI, K43KR, K49KR, V60I, K122E, D123S, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
21870 RW_21870 None None   K101Q, K122E, D123N, I135T, I142T, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245M  
22010 RW_22010 None None M41L  T39S, E44D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
22080 RW_22080 None None   K49KR, V60I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200K, Q207A, R211S, Q242E S48S*AE, V241AS 
22100 RW_22100 None None   T39TI, K122E, D123G, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
22180 RW_22180 None None   V60I, D121Y, K122E, D123G, S162HY, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S, P243T, V245Q  
23010 RW_23010 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
23030 RW_23030 None None   T39R, K122E, D123G, A158S, S162A, K173S, Q174QK, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245QR  
23070 RW_23070 None None   T39TA, E40ED, K122E, D123N, I135IT, S162A, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, V245Q  
23170 RW_23170 None None   K49R, V60I, K104R, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, V245E  
23290 RW_23290 None None   S48T, K102KR, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, V189VI, T200M, E203D, Q207A, R211Q, P243S, V245Q  
23330 RW_23330 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, I142V, A158S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
23340 RW_23340 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q197E, T200A, Q207A, R211RS, T240TS S162SI, W239WL 
23610 RW_23610 None None   T39E, E40D, E53D, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200E, Q207A, R211S, F214L, L228M, V245E  
23910 RW_23910 None None   T39TK, K49R, I135T, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, Q242QP, V245EK  
23970 RW_23970 None None   K122E, K173A, D177E, V179VI, Q207A, R211S, F214FL, V245Q  
24010 RW_24010 None None   T39E, S48E, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
24060 RW_24060 None None  A98AG T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173AT, D177E, I178LM, T200A, Q207EK, R211K, V245Q  
24080 RW_24080 None None   T39TI, V60I, D121H, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, I202IV, Q207A, R211NS, V245IK  
24130 RW_24130 None None   E40D, K49R, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, I195IT, Q207A, R211S, V245Q  
24150 RW_24150 None None   T39E, G45GE, K122E, D123N, I135T, S162H, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
24210 RW_24210 None None   K49KR, V60I, K104KR, D121DH, K122KE, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207AD, R211S, V245Q  
24260 RW_24260 None None   E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135IT, I142V, K173A, D177E, V179I, Q197QK, T200A, Q207A, V245K  
24270 RW_24270 None None   T39TIM, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, V245Q W229WR, W239WLS 
24320 RW_24320 None None   K49Q, V60I, S68G, I135T, E138A, S162A, K173S, Q174K, D177G, V179I, T200K, Q207A, R211S  
24350 RW_24350 None None   T39TIM, E40ED, K49R, V60I, K122E, D123DGNS, I135T, I142IT, E169D, K173S, T200A, Q207A, R211S, V245T  
M20010 UG_M20010 None None  V108I V60I, S105A, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E  
M20170 UG_M20170 None None   T39LM, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S, F214FL, V245Q  
M20230 UG_M20230 None None   T39L, E40D, V60I, W88C, D121Y, K122E, D123E, I135T, D177E, T200I, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
M20240 UG_M20240 None None   T69S, D121Y, K122E, S162A, D177E, I178M, G196R, T200I, Q207E, R211K, V245K  
M20310 UG_M20310 None None   T39R, E40ED, K122E, D123S, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
M20320 UG_M20320 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, N175H, D177E, I178M, T200V, I202V, Q207N, F214L, V245E  
M20340 UG_M20340 None None   T39E, K122E, D123S, K166KR, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245K  
M20370 UG_M20370 None None   T39R, V60I, K122KE, D123GS, S162N, K173S, D177EG, T200A, Q207A, R211S, V245K  
M20400 UG_M20400 None None   T39L, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, Y144F, D177E, I178M, T200I, Q207EG, R211K, P243PS, V245T  
M20490 UG_M20490 None None   K49R, V60I, D121Y, K122E, D123DE, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K  
M20520 UG_M20520 None None   T39A, V60I, K64KR, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207S, R211S, F214L, V245M  
M20610 UG_M20610 None None   T39M, K49R, V60I, D121Y, K122E, E138A, I142V, S162C, D177E, I178V, G196E, T200I, Q207G, R211K, V245T  
M20620 UG_M20620 None None   K122E, D123N, I142IF, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214I, K238KR, P243S, V245Q N147NI 
M20690 UG_M20690 None None   T39KR, K122E, D123N, I159IV, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207AT, R211S, V245KQ  
M20740 UG_M20740 None None M41L  T39E, K43R, E44D, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, T139E, I142K, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207G, V245K  
M20750 UG_M20750 None None   T39R, V60I, D121H, K122E, D123S, T165I, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
M20810 UG_M20810 None None   E40D, K49R, V60I, V90I, D177EG, I178IM, T200R, Q207E, R211K, V245K I135I*LR, V179VGIS 
M20830 UG_M20830 None None   S48ST, K49KR, I50IV, V60I, K122E, D123N, E138A, D177DE, I178MV, E194D, T200I, Q207G, R211K, V245Q  
M21120 UG_M21120 None None   T39R, D123N, I142T, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
M21130 UG_M21130 None None   E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, T139A, E169ED, D177E, I178MV, V179I, T200I, Q207E, R211K, V245Q L120L* 
M21170 UG_M21170 None None   K49R, V60I, D121H, I135T, I142T, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245K  
M21190 UG_M21190 None None   V60I, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207G, R211K, F214L, V245E  
M21200 UG_M21200 None None   E40D, K43R, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, I202IV, Q207A, R211S, F214L, K238KI, V245Q  
M21210 UG_M21210 None None   T39KR, V60I, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, K238KI, V245Q  
M21270 UG_M21270 None None   E40D, K49R, V60I, K122E, D123GS, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, V245K  
M21400 UG_M21400 None None   K49R, V60I, K102Q, D121Y, K122E, I159V, D177E, T200A, I202IV, Q207N, R211K, I244V, V245IT  
M21430 UG_M21430 None None   K49R, V60I, V118VI, D121Y, K122E, R125K, I135T, S162C, E169ED, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245KT  
M21740 UG_M21740 None None   V60I, D121Y, K122E, R125RK, I142V, D177E, Q207G, R211K, V245T K49KN 
M22260 UG_M22260 None None   K43KR, S48T, V60I, K122E, K166KR, K173ALSV, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245KT L168L* 
M22300 UG_M22300 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, S162Y, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245E  
M22310 UG_M22310 None None   E40D, V60I, D121Y, K122E, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200R, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
M22480 UG_M22480 None None   K122E, D123N, I135T, I142V, K173AS, D177E, V179VI, T200I, Q207A, R211S, V245I  
M22490 UG_M22490 None None   K49R, V60I, D121C, K122E, E169D, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245Q  
M22500 UG_M22500 None None   T39A, E40D, K49R, V60I, K82R, V90I, D121Y, K122E, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, K238R, I244V, V245K  
M22550 UG_M22550 None None   T39K, K122E, D123G, I142V, K173S, V189I, G196K, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
M22600 UG_M22600 None None   K49R, V60I, T69A, K102Q, D121Y, K122E, S162C, D177E, I178M, T200IKM, K201R, Q207E, R211K, I244IV, V245IMT K166K* 
M22620 UG_M22620 None None M41L  T39A, E40ED, K43R, K49R, V60I, V90VI, D121HY, K122E, R125RK, R172RK, K173KQ, D177DE, I178IM, T200TI, Q207G, R211K, V245K  
M22700 UG_M22700 None None   E40D, K49R, V60I, K64KR, D121H, K122E, D177E, I178IM, T200I, Q207E, R211K, V245K  
M22720 UG_M22720 None None   K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, K238KR, V245E  
M22790 UG_M22790 None None   T39A, V60I, K122E, D123N, I135T, I142T, K173S, V179I, Q207A, R211RS, V245Q R72T 
M22840 UG_M22840 None None   V60I, D121C, K122E, D123S, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245E  
M22860 UG_M22860 None None   K49R, V60I, K173T, D177E, I178IMV, V189I, T200I, Q207G, R211K, V245K K166K* 
M22880 UG_M22880 None None   T39R, V60I, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
M22900 UG_M22900 None None   V60I, D121H, K122E, D177E, I178M, T200KR, E204D, Q207G, R211K, K238KR, V245KT  
M22940 UG_M22940 None None  K103N T39R, K43E, V60I, D121H, K122E, D123S, T165I, K173L, Q174N, D177E, V179I, D192N, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q  

Database

Resources

Team