<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Arora (2008)
Title Drug resistance-associated genotypic alterations in the pol gene of HIV type 1 isolates in ART-naive individuals in North India.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype C

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1 RT-1 None None   K122E, D123N, I135R, K166R, K173E, D177E, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211K  
10 RT-10 None None   K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, R211K  
11 RT-11 None None   D121Y, K122E, S162C, K173E, Q174R, D177E, T200S, Q207K, R211K S163N, K220R, W229F 
12 RT-12 None None   K122E, D123N, I135R, S162H, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207G, R211K, F214L  
13 RT-13 None None   D121Y, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
14 RT-14 None None   K122E, D123S, K166R, K173A, D177Q, Q197K, T200A, I202V, Q207E, R211K  
15 RT-15 None None   K101R, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K  
16 RT-16 None None   F87L, D121H, K122E, I135V, K173V, D177E, I178V, T200A, Q207R  
17 RT-17 None None   K122E, D123G, I135T, S162A, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207D  
18 RT-18 None None   D121H, K122E, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K W229F 
19 RT-19 None None   D121Y, K122E, I135K, I142L, S162A, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K  
2 RT-2 None None   K102Q, D121Y, K122E, S162A, K173T, T200A, Q207E, R211K W229F 
20 RT-20 None None   K102Q, K104R, K122E, D123S, I135T, S162A, K173A, D177G, T200A, Q207E  
21 RT-21 None None   A98S, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E  
23 RT-23 None None   D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, M230D  
24 RT-24 None None   D121H, K122E, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
25 RT-25 None None   K122E, D123S, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
26 RT-26 None None   K73X, V118I, D121Y, K122E, I135R, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L  
28 RT-28 None None   V90X, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200X, Q207E, R211K  
29 RT-29 None None   D123E, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, M230D  
3 RT-3 None None   K101R, D121Y, K122E, D123E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
39 RT-39 None None   D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, I195L, T200A, Q207E  
4 RT-4 None None   D121Y, K122E, D123E, I135R, S162A, K166R, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
40 RT-40 None None K219R Y181F, Y188V V90X, G99X, K122E, D123N, T131P, S134R, S162R, S163R, T165K, D177E, T200E, E203G, Q207E, K220X, H221X, E224D V111G, D113E, Y127N, V189G, Q222S, P225L 
41 RT-41 None None   K122E, D123S, K173E, D177E, T200A, R211K  
42 RT-42 None None   K73X, D121H, K122E, D123E, I135T, K166R, D177E, T200A, Q207E  
43 RT-43 None None V75L  D121Y, K122E, D123G, I135R, K166R, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E  
44 RT-44 None None   D121Y, K122E, D123E, I135T, S162A, K173T, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, M230D  
46 RT-46 None None   D121Y, K122E, D123E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E D86F, M230N 
47 RT-47 None None   K122E, D123E, I135T, I142V, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
49 RT-49 None None   D121Y, K122E, D123G, I135R, K173A, D177E, T200E, Q207E, R211K  
5 RT-5 None None   K103R, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, E203K, Q207N, R211K  
51 RT-51 None None   G99X, K122E, D123N, I135R, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, D218E, M230D V111G 
52 RT-52 None None   V90X, G99X, D121H, K122E, I135R, S162A, D177E, I178L, L187W, T200E, I202L, E203G, R206*, Q207N, H208L, R211K, W212R K173P, D185V, S191P, L205S, G213R 
53 RT-53 None None   D121H, K122E, I135T, E169D, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A W229F 
55 RT-55 None None   K122E, D123E, I135R, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E  
6 RT-6 None None   K122E, D123G, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E  
7 RT-7 None None   K104R, K122E, K166R, K173A, Q174R, T200A, Q207E, R211K, M230D  
8 RT-8 None None   D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, D177Q, T200A, Q207A, R211K  
9 RT-9 None None  G190V D86E, D121Y, K122E, S134R, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, K223T  

Database

Resources

Team