<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Dumans (2009)
Title Distinct resistance mutation and polymorphism acquisition in HIV-1 protease of subtypes B and F1 from children and adult patients under virological failure.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 96
NumPts 96
Subtype B, F, U, CRF12_BF

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
108PR 108PR AZT, 3TC, D4T, Unknown Unknown V75M, M184V  K122E, D123E, D177E, Q207E, R211K, A272P, K281R, E297K, K311R, P313T, G333E  
117PR 117PR AZT, 3TC, D4T, DDI None  K103N K20R, K122E, Q174H, D177N, Q197E, I202V D256A 
126_05 126_05 None None   K102Q, S162C  
12SP040714 12SP040714 Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, T215F, K219Q  V35T, T39L, K43R, I135V, I142V, S162Y, E169D, K173A, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V, E297A, E312G, S322A, G333E, Q334H  
12SP040760 12SP040760 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, D177E, Q207E, A272P, I293V  
12SP040792 12SP040792 None None   D86E, K173R, I202V, R211K, A272P, I293V, E297K, Q334E  
139_05 139_05 Unknown Unknown M41L, M184V, T215Y V106A K49R, S68G, K101Q, K122E, D123N, I135T, T165V, I178L, V179I, T200A, Q207E, H208Y, R211K  
141_05 141_05 None None   V35I, K122E, D123N, I142V, A158S, I202V  
148_05 148_05 None None  Y181C I94L, I135T, S162C, E169D, I180L, Q197L, R199T, T200I, Q207H Q91L, H96P, N175T 
14_05 14_05 None None   K122E, K166R, D177G, V179I, I195T, T200A, I202V Q23R 
161_05 161_05 None None   K49R, I50V, S68G, K102R, K122E, D123N, I135T, I142R, A158S, R211Q, Q242P, V245Q  
167_05 167_05 Unknown Unknown K219Q  V35M, T39A, K122E, I135T, K173E, F214L  
186_05 186_05 None None   S48T, K122E, D123N, I135V, T165I, I202V, E204D, R211K, V245I  
187_05 187_05 None None   K49R, K122V, I142V, K166R, D177E, T200A, V245K  
192 192 AZT, DDI, DDC, Unknown, D4T, 3TC Unknown, EFV M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N, V108I E44D, L109LP, V118I, K122E, D123E, I135L, I142T, E169D, K173A, Q174K, V179I, T200A, Q207E, H208Y, R211K, L228H, V245Q, E248D, A272P, I293V, E297A  
192_05 192_05 None None   V35I, K49R, A98S, E248D  
197 197 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV D67N, K70R, T215Y, K219EQ K103N, G190S K20R, V35VL, I135T, R211K, E248D, A272P, I293V, V314X Q145Q* 
202_05 202_05 None None M184V  K20R, K122E, I135T, T200R, R211K, V245K R199S 
213_05 213_05 None None   K102Q, S162C  
226_05 226_05 None None   I142V, E169D, V245M, E248N  
22_05 22_05 None None   P4S, K32R, V118I, R211K, F214L  
232_05 232_05 None None   I142V, E169D, V245M, E248N  
23_05 23_05 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, D177E  
34_05 34_05 None None   I135V, D177E, T200A, R211K, P243S, V245K  
350_05 350_05 None None   V35I, V118I, D123E, I135T, T165I, R211K, F214L  
35_05 35_05 None None   K49R, K173N, Q174K, I202V, L205V L187V 
376_05 376_05 None None   K122E, I135T, E169D, T200I, I202V, R211K  
39_05 39_05 None None   K32R, V35T, K166R, R211K  
419_05 419_05 None None   K122E, I135T, E169D, T200I, I202V, R211K P225L 
421_05 421_05 Unknown Unknown M184V K103N, V179E K102Q, I135T, E138A, I142M, Q174R, T200A, F214L  
422_05 422_05 None None M41L  D123E, K166R, D177E, I202V, E204Q  
431_05 431_05 None None   K20R, V35L, D123E, D177E, T200A, I202V  
440_05 440_05 None None   E36D, V118I, K122E, D123N, I135R, G196E, T200A, F214L, E248D, D250E  
448_05 448_05 None None   V35L, V118I, D123E, I135T, A158S, F171Y, I202V, L210M, R211K, F214L, P243L, V245M, E248D  
53_05 53_05 None None   I135V, S162C  
57_05 57_05 None None  V179D K20R, K122E, I135T  
59PR 59PR AZT, DDI, Unknown, D4T, 3TC Unknown M41L, D67N, L210W, T215Y K103N V35T, T39I, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K, V245T, S251D, A272S, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, H315Y  
73_05 73_05 None None   V35T, E40D, K49R, S162C, K173A  
75PR 75PR AZT, 3TC None M41L, D67N, L74I, L210W, T215F, K219W  P4S, V35T, T39M, K43Q, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, I202V, Q207E, H208Y, R211K, K223Q, L228R  
84_05 84_05 None None M184V K103N I135T, K173R  
97_05 97_05 None None   K173E  
99_05 99_05 None None   K102Q  
RENA101 RENA101 AZT, 3TC None M184V V179D S48T, E79D, K102R, K122E, T139M, F214L, P243S, V245K, A272P, K281R, T286A, E297K, D324E, Q334E  
RENA133 RENA133 AZT, 3TC, D4T, DDI EFV M41L, L210W, T215Y K103N, G190S V35T, T39R, K43E, T58TS, W88C, V118I, D123E, I135L, S162Y, E169D, K173A, Q174K, T200A, R211S, V245K, A272P, K281R, E297R P97PS, P226PS 
RENA140 RENA140 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215FY, K219E  E28K, V35T, K122Q, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, T200A, I202V, Q207A, R211Q, V245Q, E248D, A272P, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, I329L  
RENA162 RENA162 AZT, 3TC, D4T, DDI EFV M41ML, T69D, T215F K103N, Y181C, G190A K20R, V35T, V90I, S162H, E169D, K173A, Q174K, V179I, G196E, R211K, L228R, A272P, K281R, T286V, I293V, E297K, Q334L  
RENA166 RENA166 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV, NVP T215F K103N, V106M K20R, I135V, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286V, E291D, V292I, I293V, E297P, V317A, D324E, Q332H  
RENA181 RENA181 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV M41ML, T215Y L100LI, K101E, K103N K20R, V35T, K49R, V106I, K122E, I135V, E138A, S162C, E169D, Q174K, D177Q, I178L, V179I, Q207D, R211K, L228LR, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A  
RENA191 RENA191 D4T, 3TC None   E28A, V35T, T39L, E40EQ, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, Q278H, T286A, V292I, I293V, E297A, K311R  
RENA244 RENA244 AZT, DDI, D4T, 3TC, Unknown NVP, EFV, Unknown M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, T215F, K219Q K103N, G190A E6D, V35T, V60I, V90I, K102N, S117A, D121H, K122E, I135T, S162Y, E169D, P170L, F171Y, Q174K, D177E, G196E, T200A, E203D, Q207E, L228H, V245Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A  
RENA248 RENA248 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP, EFV M184V K103N E6D, K20R, K122E, I142A, S162Y, T165K, E169D, K173A, Q174K, T200I, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V, E297T, V317A, D324E  
RENA251 RENA251 D4T, DDI, 3TC None M184V  W88C, D123E, V179I, R211K, F214L, S251SI, S268C, A272P, V276T, E297K, S322A  
RENA254 RENA254 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown NVP, Unknown D67N, T69D, K219Q  E6D, K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, K101Q, K122E, S162H, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A  
RENA272 RENA272 AZT, DDI, Unknown, 3TC, D4T Unknown, EFV   V35T, T39A, E40D, K49R, K82R, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200TI, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, S322A, I329L  
RENA276 RENA276 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown Unknown M184V  V35T, V118I, I135V, E169D, K173A, Q174K, T200I, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, V276T, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, V317A  
RENA304 RENA304 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV M41L, D67N, L210W, T215Y K103KN, Y188L E28K, K32E, V35K, T39L, E44D, V118VI, D121DN, D123E, I135T, I142V, S162C, K173A, Q174K, V179L, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I326V  
RENA313 RENA313 AZT, 3TC, D4T, DDI EFV   V35T, I135T, I142T, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, Q334L  
RENA332 RENA332 AZT, 3TC, D4T, DDI None D67N, K70R, M184V, K219EQ V179D, Y181C K20R, V90I, K102Q, K103R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A  
RENA361 RENA361 AZT, DDI, Unknown, D4T, 3TC Unknown, EFV M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y K101P, K103N K49R, I50V, I94L, D123E, G196E, R211K, A272P, I293V, P294T, E297K, I329L  
RENA362 RENA362 AZT, 3TC, D4T NVP   V35T, T39A, E40D, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207T, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, S322T, Q334L P236PS 
RENA384 RENA384 Unknown Unknown M41L, D67N, T215Y V108I, Y181C V35T, S48T, V60I, V90I, K122E, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K, H221Y, A272P, Q278Y, K281R, T286A, A288G, I293V, P294S, E297K, L310I, E312A, V317A  
RENA389 RENA389 AZT, 3TC, D4T EFV, NVP M184V K103N, P225H K20R, K122E, D123E, I178M, Q207E, R211K, A272P, K281R, E297K, V317A, D324E, I329V  
RENA390 RENA390 AZT, DDI, 3TC None K70R, M184V  V35T, T39N, K122E, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
RENA395 RENA395 AZT, 3TC None M184V  K20R, K49R, I135T, V179I, F214L, K277R, I293V  
RENA409 RENA409 AZT, 3TC, D4T, DDI EFV D67N, K70R, K219Q K103N, V108I E28K, K32E, V35M, T107S, D123E, S163C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K, H221Y, I244V, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297P  
RENA410 RENA410 AZT, 3TC, Unknown Unknown   E6N, K20R, V35T, K122E, I135V, S162Y, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, A327V, I329IL  
RENA426 RENA426 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown NVP, Unknown M184V  V35T, V118VI, I135V, S162C, K173T, Q174K, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
RENA430 RENA430 DDC, AZT, Unknown, 3TC, D4T Unknown M184V  V35T, T39I, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, E248D, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I329L  
RENA432 RENA432 AZT, DDI, D4T, 3TC, ABC NVP M184V  V35RT, R83K, K122E, D123E, I135T, D177E, T200I, R211K, A272P, K281R, P294T, E297R  
RENA446 RENA446 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown, ABC Unknown, EFV D67N, K70R, L74I, V75T, T215F, K219E Y181C V35T, T39S, K101Q, D121H, K122E, S162C, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, D218DE, L228LH, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, Q334N  
RENA456 RENA456 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC None   E6N, K20R, V35M, T39A, I132V, I135V, S162Y, E169D, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297A, G333E  
RENA463 RENA463 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, T215F  V35T, V118I, K173T, Q174K, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250S, K281R, T286A, I293V, E297K  
RENA483 RENA483 AZT, 3TC None   V35I, I135T, K173T, Q174K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250S, A272P, K281R, A288S, I293V, E297K, K311R  
RENA502 RENA502 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI EFV D67N, K70S, L74V, M184V, T215Y L100I, K103N E6D, K20R, V35M, K49R, K122E, D123E, I135T, E169A, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A P97PS, A129AV, P150PS 
RENA511 RENA511 AZT, DDI, DDC, 3TC, Unknown Unknown T215Y K101P, K103N E6D, K20R, E28K, K32E, V35M, T39A, I132V, I135V, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, G333E  
RENA555 RENA555 AZT, DDI, D4T, 3TC, Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, L210W, T215Y, K219E  V35T, T39M, V60I, K122E, I135T, S162Y, E169D, K173A, Q174K, V179I, Q207R, H208Y, R211K, K223Q, L228H, Q242H, A272P, K277R, K281R, I293V, E297K  
RENA569 RENA569 AZT, DDI, Unknown, 3TC, D4T Unknown, EFV  K103N, P225H E28K, K32E, V35T, T39L, E40ED, K49R, D123E, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A  
RENA576 RENA576 D4T, 3TC, ABC, AZT EFV M184V K101P, K103N V35T, K49R, V60I, D123E, I135V, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V, E297A  
RENA578 RENA578 AZT, 3TC, D4T, DDI, ABC EFV M41L, M184V, L210W, T215Y  E28Q, K32EQ, V35T, T39A, V118I, K122E, I135T, D177N, Q207E, R211K, I293V, E297K, I326V  
RENA596 RENA596 D4T, 3TC, Unknown, AZT Unknown K70R, M184V  V35T, T39M, K49R, I135T, E169D, K173A, Q174K, T200A, R211K, A272P, K281R, V292I, E297K  
RENA624 RENA624 DDC, AZT, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q K101E, Y188L V35T, V60I, V106I, K122Q, F214L, L228H, A272P, T286A, P294T, E297K, D320DE  
RENA626 RENA626 AZT, 3TC, D4T, ABC, DDI NVP, DLV M41L, D67N, K70R, L74I, V75S, L210W, T215Y, K219E A98G, K103N, V108I E6K, K20R, K32R, V35T, T39A, E44D, V118I, K122E, E138G, S162Y, E169D, K173A, Q174K, T200A, E203K, Q207E, H208Y, W212M, K223E, F227FY, L228H, Q242H, V245Q, E248D, A272P, K277R, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, D324E, Q334E  
RENA636 RENA636 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  E28A, V35T, T39A, V118I, D123E, I135T, I142M, F214L, A272P, K277R, T286A, I293V, E297R Q334T 
RENA651 RENA651 AZT, 3TC, DDI, D4T None M184V  V35T, T39M, I135V, S162C, E169A, K173A, Q174K, Q207E, R211K, T216TS, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V, E297A  
RENA654 RENA654 AZT, DDI, 3TC, D4T EFV M41L, T215F L100I, K103N V35T, K43N, I135V, E169D, K173A, Q174K, I178L, G196E, Q207A, R211K, L228R, P243S, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
RENA686 RENA686 AZT, 3TC None D67G, K70R, M184V, T215F, K219E K103N K20R, V35M, S68G, R83K, D123E, V245K, A272P, K281R, E297R, Q334D  
RENA701 RENA701 D4T, 3TC, Unknown, AZT, DDI Unknown, EFV, NVP   K32I, V35T, D123E, I142V, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A, S322T, Q334H  
RENA780 RENA780 AZT, 3TC None M184V  V35T, K122P, I135L, S162C, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207K, R211T, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V, P294T, E297A  
RES165_03 RES165_03 DDC, AZT, D4T, 3TC EFV M41L, M184I  K20R, V35I, K43E, E44A, L228F  
RES207_03 RES207_03 D4T, 3TC EFV M184V  D123E, I135T, I202V  
RES273_03 RES273_03 AZT, 3TC None M184V  V35T, V90I, D123E, I135L, K173T, Q174K, I180V, R211K  
RES299_03 RES299_03 AZT, DDI, 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E K103S, G190A K101R, K122E, D123N, I135T, V245K  
RES303_03 RES303_03 DDC, AZT, Unknown, D4T, 3TC Unknown, NVP K70R, M184V, T215V, K219Q K101H, G190A E28G, K122E, S162C, K166R, E169D, Q197K, T200A  
RES327_03 RES327_03 AZT, 3TC, D4T, DDI None   S48T, K104R, V118I, D123E, D177N, R211K, F214L, V245L  
RES334_03 RES334_03 Unknown Unknown M184V, T215Y A98G, K103N, M230L E6D, K20R, V35I, T39TA, K49R, K122E, I135L, S162SC, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N  
tvSP21 tvSP21 AZT, DDI, D4T, 3TC None M184V  V35I, K49R, K122E, D123E, I135L, S162C, K173T, Q174K, D177N, V245L, A272P, K281R, I293V, E297R  

Database

Resources

Team