Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Cardoso (2009)
Title HIV-1 pol phylogenetic diversity and antiretroviral resistance mutations in treatment naive patients from central west Brazil.
Citation J Clin Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 97
NumPts 97
Subtype B, F, C


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRGO3001 BRGO3001 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K166R, T200A, Q207N  
BRGO3002 BRGO3002 None None   V21I, V35VI, D177E, R211K  
BRGO3003 BRGO3003 None None   K20R, D121H, K122E, D123E, I135T, T139A, T165I, I178L, G196E, F214L  
BRGO3004 BRGO3004 None None   K20R, K49R, K64KR, I135T, S162A, E169D, Q207E, R211K  
BRGO3005 BRGO3005 None None   K173N, F214L  
BRGO3007 BRGO3007 None None   V35T, E36EA, T39D, I135T, A158S, K173A, D177E, T200A, E204Q, Q207EG, R211K, V245Q  
BRGO3008 BRGO3008 None None   E6K, D121H, K122E, I135T, K173E, D177E, R211Q  
BRGO3009 BRGO3009 None None K70KT  V35L, T39TA, K122AP, D123DE, I180V, Q207E, R211K  
BRGO3010 BRGO3010 None None   V35I, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207E, R211K  
BRGO3011 BRGO3011 None None   V35I, R83K, D123E, Q207E  
BRGO3012 BRGO3012 None None   K49R, V106VI, K122E, D123S, I135T, T139TS, I142IM, S162C, D177G, Q207D, R211K  
BRGO3013 BRGO3013 None None   K49R, K102R, V106I, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, R211K  
BRGO3015 BRGO3015 None None   K20R, V35I, R83K, K122KE, D123E, S162C, E169D, I178L, G196E  
BRGO3016 BRGO3016 None None   V21I, V35I, V106VI, D123E, I135R, S162C, E169ED, D177E, I178L, V179I, G196E, T200TA, R211K  
BRGO3017 BRGO3017 None None   V60VI, S68NT, K122E, I135T, K166R, T200A, Q207R  
BRGO3018 BRGO3018 None None   D123E, K173KE, R211Q, V245E  
BRGO3019 BRGO3019 None None   V35I, K122E, I135T, S162C, R211K  
BRGO3021 BRGO3021 None None  V179D K122E, T200A, F214L  
BRGO3022 BRGO3022 None None   K20R, K104R, D121H, K122E, I135T, T165I, D177DE, I178L, G196E, F214L, V245K  
BRGO3024 BRGO3024 None None   V35L, V118I, I135V, E138A, S162C, K173T, Q174K, G196GE, Q207D, R211K, F214L  
BRGO3026 BRGO3026 None None   K20R, V35I, S48T, A98S, I135L, E138A, S162SC, K166KR, Q207E, R211K  
BRGO3027 BRGO3027 None None  K103N K20R, T27P, V35M, V90I, K122E, I135T, K166R, G196E, T200A, Q207E, R211K  
BRGO3028 BRGO3028 None None   D121H, K122E, I135T, K173Q, V179I, E204D  
BRGO3029 BRGO3029 None None   K11Q, V21I, V35IM, K122E, D123N, R211K, E248D  
BRGO3032 BRGO3032 None None   V118I, D177E, G196E, T200TA, I202V, E204K, R211G, F214L, V245K  
BRGO3033 BRGO3033 None None   K11Q, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, E169D, I178L, T200A, R211K  
BRGO3034 BRGO3034 None None M41L, T215D  K20R, T27S, I31L, T39A, K64R, D121H, K122E, S162Y, D177G V90VFL, L92S 
BRGO3036 BRGO3036 None None T215D Y188L K20R, S68G, V118I, K122E, I135T, S162G, I202V, R211K, F214L  
BRGO3037 BRGO3037 None None   K122E, D123N, I135T, I178M, G196E  
BRGO3038 BRGO3038 None None   K32R, D121Y, K122E, E138A, I142V, T165I, V179I, T200A, R211K  
BRGO3040 BRGO3040 None None   K122E, E169D, K173E  
BRGO3041 BRGO3041 None None   S48T, K122E, I135T, K166R, D177E, G196E, R211K, V245K  
BRGO3042 BRGO3042 None None   V35T, E40ED, K49R, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211K, V245Q  
BRGO3043 BRGO3043 None None   I135T, D177E, Q197K, I202V  
BRGO3044 BRGO3044 None None   K122E, I135T  
BRGO3045 BRGO3045 None None   K20R, A158S, V189VI, T200S, I202V, R211K, F214L  
BRGO3048 BRGO3048 None None T215S  D123E, I135T, D177E, T200A, R211K C38CY 
BRGO3049 BRGO3049 None None   I135T, K166R, D177E, V179I, G196K, I202V, Q207E  
BRGO3050 BRGO3050 None None   V35M, V60I, R83K  
BRGO3051 BRGO3051 None None   V60I, K102R, K122E, I135T, V179I, T200TA, E204D, R211K  
BRGO3052 BRGO3052 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, T200A, I202V, Q207E, R211K  
BRGO3053 BRGO3053 None None   V35I, S68N, T200TA, I202IV, R211K L210G 
BRGO3054 BRGO3054 None None   V21I, I135T, G196E, I202V  
BRGO3056 BRGO3056 None None   I135V, K173N, R211K  
BRGO3057 BRGO3057 None None   K49R, K173N, R211K  
BRGO3058 BRGO3058 None None   V35I, K102Q, I135T, S162C, R211K, K238KR, V245R Y232YD 
BRGO3059 BRGO3059 None None   V35T, T39Q, E40D, I135V, K173E, Q207K, R211T, V245T  
BRGO3061 BRGO3061 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135K, S162C, T200E  
BRGO3063 BRGO3063 None None   V106I, K122E, S162C, Q174H, I178L, G196E, T200TA, R211K  
BRGO3065 BRGO3065 None None   P4S, D123E, I135T, I178M, V245Q  
BRGO3066 BRGO3066 None None   I135T, I178IM, V245Q  
BRGO3068 BRGO3068 None None L210W  V35L, V60I, S68G, K122E, I135V, I178IM, T200A  
BRGO3072 BRGO3072 None None   K20R, V60I, K64KR, K102Q, D121H, I135T, E138A, I142T, K166R, V245I  
BRGO3073 BRGO3073 None None   E28D, S162C, Q197E, R211K  
BRGO3075 BRGO3075 None None   V35L, D123E, D177E, Q207K, R211K  
BRGO3076 BRGO3076 None None   D123E, I135L, T165I, T200A  
BRGO3077 BRGO3077 None None   K49R, I50V, A98S, I135T, R211K, F214L  
BRGO3079 BRGO3079 None None   V60I, S68G, K122E, D123N, K166R, D177E, I178M  
BRGO3081 BRGO3081 None None   K122E, D123E, I142V, T200I, R211K  
BRGO3086 BRGO3086 None None   K20R, V35T, D123E, S162C, I178L, T200A, Q207H, R211K  
BRGO3087 BRGO3087 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, A158S, S162C, K173T, D177E, I178L, T200A, E203D, Q207D, R211K  
BRGO3088 BRGO3088 None None   V90I, K122E, D123N, I135T, D177E, Q197E, T200A, E204D  
BRGO3091 BRGO3091 None None   E53D, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, V179I, T200S  
BRGO3093 BRGO3093 None None   A98S, D123E, I135T, D177N, G196E, T200TI, I202V, R211K  
BRGO3094 BRGO3094 None None   K32R, D121DY, K122E, I135T, S162C, D177E, I178V, V179I, T200A, E204K, Q207E  
BRGO3100 BRGO3100 None None   V21I, K122E, D123N, T165I, T200E, R211K  
BRGO3101 BRGO3101 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, T165I, E169D, D177E, I178L, G196E, T200A  
BRGO3103 BRGO3103 None None   K122E, D123S, E169D, D177E, R211K  
BRGO3104 BRGO3104 None None   K122E, I135T, I142V, S162C, T200K L12V, I167IS 
BRGO3105 BRGO3105 None None   I135V, S162C, G196E  
BRGO3109 BRGO3109 None None  Y181C K20R, V35I, T69N, V118I, I135T, R211K, F214L  
BRGO3111 BRGO3111 None None T215S K101E, G190S E6T, V35I, S68G, K122E, V179I, T200A, R211K  
BRGO3112 BRGO3112 None None   V35M, T39M, I135V, S162C  
BRGO3116 BRGO3116 None None   K104R, V118I, D121H, K122E, I135R, S162C, T200E, F214L  
BRGO3120 BRGO3120 None None   V35I, R83K, K102Q, D123E, S162A, D177E, I178M, G196E, E203D, Q207E, R211K  
BRGO3121 BRGO3121 None None   V21I, T27S, V35I, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, E204Q, R211K  
BRGO3122 BRGO3122 None None   E6D, K20R, E36Q, K122P, K166R, D177E, R211K  
BRGO3126 BRGO3126 None None   V118I, K122E, D123E, I135T, R211K, F214L F77FY 
BRGO3129 BRGO3129 None None   E6D, K20R, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, I178V, Q197E  
BRGO3130 BRGO3130 None None   S162C, V245E  
BRGO3133 BRGO3133 None None   V35T, T39M, D123E, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, Q207E, R211K  
BRGO3134 BRGO3134 None None   T27S, V35I, D123E, I135T, S162C, D177E, V189I, R211K  
BRGO3135 BRGO3135 None None   E6K, K20R, K122E, K166I, Q174R, V179I, I202V, Q207E, R211K  
BRGO3136 BRGO3136 None None   K20R, K122E, I135T, R211K  
BRGO3137 BRGO3137 None None   D123E, S162C, E169D, D177E, G196E, R211Q  
BRGO3140 BRGO3140 None None   V35L, R83K, D123DE, S162C  
BRGO3141 BRGO3141 None None L210W  V21I, V35I, V60I, K122E, S162ST, T200A, I202V, R211K  
BRGO3142 BRGO3142 None None   K11R, I135T, S162C, T200E, E204K  
BRGO3143 BRGO3143 None None   I135T, S162C, D177E, I178V, G196E, T200S, Q207E  
BRGO3146 BRGO3146 None None   V35T, T69S, K122E, I135M, S162C, K173R, Q174K, Q207E  
BRGO3147 BRGO3147 None None   K20R, V35T, T39TA, K49R, D123E, T165I, D177N, G196E, T200V  
BRGO3148 BRGO3148 None None   K20R, K49R, I135V, S162C, T165I, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K  
BRGO3149 BRGO3149 None None   E6D, K20R, V90I, V118I, K122E, D177E, T200V, F214L  
BRGO3150 BRGO3150 None None   E6D, A98S, K122P, I135T, S162C, K173N, Q174R, D177E, R211K  
BRGO3151 BRGO3151 None None   K20R, K49R, D123DE, T165I, Q174H, I202V  
BRGO3155 BRGO3155 None None   A98S, K102Q, K122E, I135T, R211K  
BRGO3156 BRGO3156 None None   V35T, K122E, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, I178L, T200TA, Q207E, R211K