<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Pillay (2008)
Title Antiretroviral drug resistance surveillance among drug-naive HIV-1-infected individuals in Gauteng province, South Africa in 2002 and 2004.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 101
NumPts 101
Subtype C, G


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 101 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0011 2004_0011 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207K  
0091 2004_0091 None None   V21VI, V35KT, E36EA, T39EK, S48T, V60VI, W88WC, K102KR, K104KR, K122KE, D123E, S162SC, K173KEIV, D177E, T200A, I202V, Q207KNRS, R211K E89E*, W229W* 
0138 2004_0138 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K166R, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, F214L  
0180 2004_0180 None None   V35T, E36M, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, E138A, E169EA, K173N, Q174R, D177DN, T200A, Q207EGKR, R211K, F214L  
0192 2004_0192 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K166R, K173AV, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
0226 2004_0226 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, W88C, D123E, K173T, D177E, I178V, I195IL, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L  
0238 2004_0238 None None   K32Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211RK  
0309 2004_0309 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, I195R, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L  
0641 2004_0641 None None   K11R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E  
0681 2004_0681 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, I178M, Q197K, T200A, Q207N, R211K  
0745 2004_0745 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173E, Q174R, D177E, T200S, Q207E  
0824 2004_0824 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173A, Q174K, T200A, R211K, F214L Q207M 
0873 2004_0873 None None   V35T, E36EK, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
0886 2004_0886 None None  V179D V35T, E36A, T39E, E42EG, S48ST, V60I, K122V, D123DG, I135V, S162C, K173T, D177G, T200A, I202V, Q207E, F214L  
0888 2004_0888 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, W88C, K103R, V118I, K122E, D123N, I135V, T165I, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K, F214L  
0926 2004_0926 None None   K20R, V35T, T39G, K49R, K104R, K122E, D123S, A158S, T200A, Q207E, R211K, F214L T139G 
0946 2004_0946 None None K70R  K32E, V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, G196R, Q207D, R211K  
0969 2004_0969 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1027 2004_1027 None None   V21I, V35T, T39K, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K  
1058 2004_1058 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, R211K  
1068 2004_1068 None None   E6K, V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
1076 2004_1076 None None   P4ST, E6ED, V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, D121C, K122E, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
1137 2004_1137 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173A, D177E, I178IMV, T200A, Q207E  
1166 2004_1166 None None   V35T, T39E, S48T, K122A, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K  
1193 2004_1193 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E  
1228 2004_1228 None None T69D  K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, S162Y, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
1293 2004_1293 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207K, H235HP, K238R T165TS 
1300 2004_1300 None None   P4S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104N, K122E, D123G, I135V, K173A, T200A, Q207E, R211K  
1320 2004_1320 None None   V35T, E36A, T39EG, S48T, K122E, D123G, A158AS, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L K30KR, I31IKN 
1323 2004_1323 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E L26LM 
1338 2004_1338 None None  K103KN V35T, E36EA, T39E, K122E, I135IATV, S162C, K173AT, D177E, T200TAEK, I202IV, Q207EG, R211RK D86AV 
1437 2004_1437 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1457 2004_1457 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, G196K, T200A, Q207D  
1517 2004_1517 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, W88S, L100F, K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177N, T200A, E203D, Q207E, R211K, F214L  
1583 2004_1583 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102KQ, K122E, D123G, S162C, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202IV, Q207E, R211K  
2025 2004_2025 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, I135V, S162C, K173A, Q174K, D177E, I195L, G196M, T200A, Q207E, R211K F124S, Q151R 
2279 2004_2279 None None A62V  V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K L34V 
2440 2004_2440 None None   V35T, E36A, T39E, K122KE, K173I, Q174K, T200E, Q207KR, R211EK  
2556 2004_2556 None None   P14Q, V35T, T39E, S48T, W88C, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207G, R211K  
2562 2004_2562 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, I135K, I142V, F171L, K173A, Q174K, D177E, T200TM, Q207E  
2605 2004_2605 None None   P4H, V35T, E36A, T39E, S48T, K103E, K104N, V118I, K122E, E138A, K173T, Q174K, G196K, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T  
2948 2004_2948 None None   E6ED, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177DE, T200A, Q207D  
5637 2002_5637 None None  A98G V35T, E36V, T39E, S48T, K82R, K122E, D123S, K173T, T200A, Q207E, F214L, P243A  
6300 2002_6300 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173E, D177E, T200A, E204K, Q207E  
6457 2002_6457 None None   K22KN, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D123EK, A158S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T  
6547 2002_6547 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, K173A, Q174K, T200E, Q207R, R211K, T240P  
6659 2002_6659 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, I167V, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K  
6665 2002_6665 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135V, K173A, T200E, E204Q, Q207A, R211K D177NS, I180IM 
6673 2002_6673 None None   V35L, T39K, S48T, A98S, K122E, D123S, Y144*, K173A, D177E, Q207N I180NS 
6731 2002_6731 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, K122E, D123N, E138A, I142V, K173T, Q174K, G196E, T200A, Q207A, F214L  
6882 2002_6882 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
6899 2002_6899 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123G, T165V, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207X, R211RK  
7048 2002_7048 None None   K32R, V35T, T39K, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, T139A, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207A  
7098 2002_7098 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, S162F, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, R211K  
7170 2002_7170 None None   V35T, T39E, S48T, A98S, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177G, T200A, Q207A  
7458 2002_7458 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, T200A, Q207D, R211K  
7528 2002_7528 None None   P4PS, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T165I, K166R, P176PQ, T200A, Q207E, F214L  
7621 2002_7621 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K  
7623 2002_7623 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122KE, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211K  
7629 2002_7629 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, K122E, D123NS, I135T, S162C, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207AE, R211K, F214FL K13KR 
7648 2002_7648 None None   V21VI, I31IV, V35T, E36AV, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173A, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K P217PS 
7737 2002_7737 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123DN, I135T, S162C, K173A, D177E, V189VI, T200A, Q207E, R211K, F214L  
7794 2002_7794 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q197P, T200A, Q207E, R211K, F214L  
7809 2002_7809 None None   K11Q, V35T, T39K, K43E, S68SN, D121Y, K122E, D123S, I135R, I142V, S162C, K173IV, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207E, L228Q  
7832 2002_7832 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, Q197L, T200A, K201R, Q207E  
7839 2002_7839 None None   E6K, V8I, K11R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
7931 2002_7931 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, I135V, I142T, T165I, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E K13R 
8018 2002_8018 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135V, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
8175 2002_8175 None None   V35T, T39E, V118I, K122E, D123G, E138A, I142IT, T165TI, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
8199 2002_8199 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123S, D177N, T200A, Q207E, R211K, F214L  
8209 2002_8209 None None   V35T, T39Q, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K  
8219 2002_8219 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, A98S, K103R, K122E, D123G, I135T, P170PL, K173A, D177G, T200A, I202V, Q207K  
8249 2002_8249 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, K104R, K122E, D123N, E138A, T165I, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
8302 2002_8302 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, I50V, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E  
8308 2002_8308 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, S162C, F171Y, K173S, Q174K, D177G, V179I, T200A, Q207K, R211E  
8310 2002_8310 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, E138A, T139A, T165I, K173R, Q174K, T200A, Q207E, F214L  
8317 2002_8317 None None   P4S, V21I, V35T, E36V, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173A, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K  
8432 2002_8432 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, D123G, S162N, K166KR, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, D218N P217Q 
8470 2002_8470 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, I142V, T165I, K173A, D177E, Q207E, R211K  
8495 2002_8495 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, I50V, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E  
8546 2002_8546 None None   V8I, V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D123E, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T  
8584 2002_8584 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, V189I, T200A, I202IV, Q207E, F214FL  
8762 2002_8762 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, K166R, K173A, D177E, T200AE, Q207S, R211K, D218DN, E233EA Y56YC 
8812 2002_8812 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, S163SG, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, P243T D121DG, K220KE 
8891 2002_8891 None None D67G, L74F, M184L K101E, Y188F V35T, E36AT, T39E, S48T, P52PA, S68R, S105A, I135T, E138A, S162Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E Y56F, N57Y, T58P, I63L, V148VA, Q182P 
9086 2002_9086 None None   V35M, S48T, E53D, V60I, K122E, D123G, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
9175 2002_9175 None None   V21I, T27S, V35T, T39E, S48T, V60I, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K H208N 
9212 2002_9212 None None   K32KN, V35T, E36T, T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, T139TA, K173I, Q174K, I178L, G196GE, T200A, Q207E, R211K, F214L  
9265 2002_9265 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
9273 2002_9273 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, D123G, I135V, K166KR, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RG, F214L  
9360 2002_9360 None None L210W  V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I142V, K173A, Q174K, D177E, G196T, Q197K, T200A, I202V, Q207E, R211K  
9374 2002_9374 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, P176S, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, Q242QH  
9389 2002_9389 None None  K101KE E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, I142V, P170PS, K173A, D177E, T200A, Q207E  
9472 2002_9472 None None   V35T, E36EV, T39E, S48T, K122E, D123S, I159V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
9552 2002_9552 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
9577 2002_9577 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, I135V, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, E204Q, Q207A, R211E  
9595 2002_9595 None None   P14PL, K22N, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K L12S, K13R, D17H, P19S 
9621 2002_9621 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K103KR, K122E, D123G, K173AV, D177E, T200A, Q207E, R211RK  
9624 2002_9624 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177DN, Q197P, T200A, Q207N, R211K  
9633 2002_9633 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E