<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Jacobs (2008)
Title Phylogenetic diversity and low level antiretroviral resistance mutations in HIV type 1 treatment-naive patients from Cape Town, South Africa.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 91
NumPts 91
Subtype C, B

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1078C 1078C None None   V35VA, T39TA, S48ST, K49R, V60VI, R83RK, Q207E, R211K, V245EQ E53EK 
1438 1438 None None   V35T, E36A, T39E, K49R, K122E, D123S, T165I, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207K, V245Q, E248D N54H 
1439 1439 None None   E28EA, V35T, E36V, T39E, S48T, K49R, I50V, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245KQ  
1440 1440 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177DE, V179VI, G196GV, T200A, E203ED, Q207E, R211K, V245L, E248D  
1441 1441 None None   I31R, V35I, E36A, T39E, K122KE, D123S, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207AT, R211K, T240TA, V245Q  
1442 1442 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, K173A, D177E, I195IL, T200A, E204EK, Q207AE, R211RK, V245Q  
1445 1445 None None   E6D, V8VI, V35K, E36A, T39E, S48T, K122KE, S162C, K173A, D177E, Q197QK, T200A, Q207E, V245Q  
1446 1446 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123G, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
1447 1447 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, T165TI, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1448 1448 None None   K20KR, V35AT, E36A, T39E, S48ST, V60VI, K104R, K122E, D123G, I135AV, K173A, D177E, T200E, Q207N, R211K, V245Q  
1450 1450 None None   V8VI, K20KR, V35T, E36A, T39E, K122E, D123DGNS, A158AS, S162SC, K173AT, D177DE, T200A, Q207A, R211K, T240A, V245LQ  
1484B 1484B None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174E, D177E, I178IM, Q207A, V245Q, D250E  
1514B 1514B None None   E6D, K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1518B 1518B None None   V35I, R83K, K122E, I135T, I202V, R211K  
1607 1607 None None   V8I, K49R, V106I, D123E, I135T, E169DN, I178L, T200A  
1613 1613 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K64R, K122E, D123G, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
1614 1614 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
1666 1666 None None   E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1668 1668 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
1676 1676 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122KE, S162C, K166R, K173A, Q174HN, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
1677 1677 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K101R, K122E, D123G, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V241I, V245K  
1680 1680 None None   V35T, T39R, S48T, V60I, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q K82K* 
1697 1697 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, S162F, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207A, V245Q, D250E  
1742 1742 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, E169D, K173A, D177E, T200A, R211K, V245Q  
1743 1743 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, K122E, D123N, I135V, S162C, K173T, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
1744 1744 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D  
1745 1745 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, S162C, K173A, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245L  
1748 1748 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K101Q, K122E, D123G, E138A, T139A, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207AT, R211K, V245Q, E248N, D250E  
1749 1749 None None   P4PS, V35T, E36A, T39E, S48T, D123N, K166R, K173T, D177E, T200A, E204K, Q207A, R211K, V245Q  
1750 1750 None None   K49R, R83K, Q207E, R211K, V245E E53K 
1752 1752 None None   V35A, T39TAEK, S48ST, K49KR, K122E, D123G, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1753 1753 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1754 1754 None None   V21I, V35I, E36A, T39E, S48T, V60I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
1755 1755 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K104R, K122E, D123G, I135V, K173A, D177E, T200E, Q207N, R211K, V245Q  
1756 1756 None None   P4S, E6ED, K11Q, K20R, V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, T240A, V245Q  
1757 1757 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1758 1758 None None   E6D, V21VI, V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173V, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1759 1759 None None   K32KR, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, S162C, K166R, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1760 1760 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, T139Q, I142R, A158S, S162A, T165I, K173A, Q174K, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
1761 1761 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, E194D, G196M, T200A, Q207R, R211T, V245Q  
1762 1762 None None   V35T, T39K, S48T, D121E, S162C, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, D250E  
1763 1763 None None   E28D, V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, T165I, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1764 1764 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207EK, R211K, V245Q, K249T  
1767 1767 None None   P4PS, V8VI, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, G196R, T200A, Q207G, R211K, V245Q, D250E, K259N  
1768 1768 None None   V35T, E36A, T39E, E40ED, S48T, V118I, K122E, D123N, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200S, Q207A, R211K, F214L, V245Q  
1769 1769 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1770 1770 None None   V35I, E36A, T39E, S48T, W88C, K122E, D123G, I135V, I142V, A158S, K166R, K173A, Q174K, G196E, T200A, Q207E, R211RM, F214L, V245Q  
1771 1771 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, K173L, D177E, T200A, Q207DEG, R211K, V245Q  
1772 1772 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, I135T, A158G, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1773 1773 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K166R, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, D250E  
1774 1774 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1775 1775 None None   V35T, T39E, E53D, K122E, D123N, I135R, S162F, K173T, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
1776 1776 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, K173I, Q174K, T200A, K201X, Q207E  
1777 1777 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, I142V, A158S, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1778 1778 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, D177E, Q197P, T200A, Q207K, R211K, V245Q R199RS 
1779 1779 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207A, R211G, V245KQ  
1780 1780 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D, P243T, V245K, E248D, D250E  
1781 1781 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
1782 1782 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, I142M, K166R, K173AT, D177E, I178M, G196GE, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
1783 1783 None None   E6K, V35T, E36EA, T39K, S48T, D121H, K122E, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207EK, R211AEKT, V245Q  
1785 1785 None None   V8I, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
1786 1786 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123S, T139A, I142V, S162F, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
1787 1787 None None   V35T, E36A, T39EK, S48T, V60I, K104KR, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211K, F214L, V245Q  
1788 1788 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174K, D177E, T200A, R211K Q222QH 
1790 1790 None None  Y188YC V35T, T39E, S48T, K122A, S162C, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211KM, V245Q  
1792 1792 None None   K20R, V35T, T39E, W88C, K122E, I135R, E169D, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
1793 1793 None None   K20R, V35T, E36AV, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, Q197L, T200A, Q207A, R211E, V245Q  
1795 1795 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1796 1796 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, Q145C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
1798 1798 None None   K20R, K32N, V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162T, K166R, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207A, R211K R143RK, Q222QH 
1799 1799 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, T200A, E203D, Q207A, V245L  
1800 1800 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
1801 1801 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, Q145C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
1802 1802 None None  F227FL E6K, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, I142IV, K173E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
1803 1803 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245T  
1804 1804 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, L100V, K103R, K122E, K173A, D177E, G196Q, T200A, Q207E, R211K, V245Q A98C, S105N_Q 
1805 1805 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245E  
1806 1806 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, P247A  
1807 1807 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1809 1809 None None   V35T, E36A, T39E, K122A, D123S, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207K, R211K, V245Q  
1813 1813 None None   V8I, V35T, T39E, S48T, V60I, K64R, K122E, D123S, I135V, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1814 1814 None None   V35T, T39TA, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1815 1815 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, T165I, K166R, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1816 1816 None None  Y181C V35T, T39N, E40D, V60I, K166R, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1818 1818 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173V, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, K259N  
1820 1820 None None   V35T, T39E, S48T, D123E, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
1821 1821 None None   V35I, E36A, T39E, S48T, W88C, K122E, D123G, I135V, I142V, A158S, K166R, K173A, Q174K, G196E, T200A, Q207E, R211M, F214L, V245Q  
1823 1823 None None   V35R, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, S162C, K173T, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1824 1824 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173T, D177DE, T200A, Q207E, R211K, V245K  
1831 1831 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I142T, K173A, Q174R, D177E, I178M, G196M, T200A, Q207A, P243T, V245Q  
1832 1832 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, K122E, D123S, I142V, A158S, K173A, D177E, I178V, T200A, E204K, Q207D, L210I, R211K, V245Q  

Database

Resources

Team