Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Rhee (2009)
Title Predictive value of HIV-1 genotypic resistance test interpretation algorithms.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 720
NumPts 627
Subtype B, A, CRF02_AG, C


  Page 1 of 8    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 720 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CA1290 CA3214 DDC, AZT, D4T, 3TC, DDI NVP M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q K103N K122E, I178M, T200A, Q207E, D218E, K223KR, D250A, A272P, E297A R172RS 
CA1339 CA3371 AZT, 3TC, DDI NVP L74V, M184V K101E, Y181C, G190A T39S, S162A, T200TA, R211Q, D237DN, V245E, A272P  
CA1415 CA9241 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q K101E, K103KN, Y181C K20R, V35T, T39A, K122E, K166R, Q207E, L228H  
CA1419 CA3802 AZT, DDI, 3TC, D4T, DDC NVP M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219E Y181IS D123E, G196E, R211K, V245T, E248D  
CA1429 CA8486 AZT, DDI, 3TC, D4T, DDC NVP A62V, T69S_SG, T215Y Y181C I135T, K166R  
CA1431 CA3828 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, L210W, T215Y K103KN, Y181YC, G190GA K43E, V118I, I135V, I142V, K166R, R211K, H221HY, L228LI, V245M  
CA1435 CA3836 AZT, D4T, 3TC, DDC, DDI, ABC EFV M41L, D67N, T69D, K70R, L74V, T215F, K219Q Y181C, G190RS V35K, V60I, K104N, V118I, K122E, I135T, S162D, F214L, A272P, Q278X L283IV 
CA1445 CA3859 D4T, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219E  K11KR, K43Q, V60I, V118I, I135V, K166R, R211K, V245T L234LR 
CA1447 CA3863 AZT, 3TC, D4T None M41L, D67G, L210W, T215Y  A98S, K102Q, K122E, A272P, I293V  
CA1455 CA3883 AZT, DDI, D4T, DDC NVP M41L, D67G, K70R, L74I, T215Y, K219E  E28A, V60I, S68G, K122E, I135T, I178M  
  CA7736 AZT, DDI, D4T, DDC, ABC NVP, EFV M41L, D67G, K70R, L74V, T215Y, K219E K101E, Y181V, G190A E28A, V60I, S68G, K122E, I135T, I178M  
CA1456 CA3885 DDC, AZT, D4T, 3TC NVP M41L, D67N, M184V, T215Y Y188L K122E, I135T, S162C, E203K, R211K, A272P  
CA1462 CA3900 AZT, 3TC, D4T, DDI DLV M41L, L74V, V75VL, M184V, T215Y Y181C T69TP, K122E, I135T, Q197E, E204Q, Q207E, R211K, R284K, T286A H96HQ, L120V 
CA1469 CA3916 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, D67N, K70R, L74I, T215F, K219Q  V118I, K122E, I135T, I202V, H208Y, R211K, D218E H198HQ 
CA1481 CA4244 AZT, 3TC NVP D67N, T69D, K70R, T215F, K219E K103N, Y181C K64R, K122E, I142V, L228LR  
CA1491 CA4267 AZT, 3TC, D4T, DDI None M184V  V35Q, T39A, S68G, V90I, K122E, I135R, R211K, V245M, E248D K223KN 
CA1493 CA4271 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  T39A, K122E, I135IV, I142IV, T200TA, Q207N, R211K P133PR, N136NS 
CA1494 CA4273 AZT, DDI, 3TC, D4T None D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q  P4PS, K20R, V60I, K122E, K166KR, D177E, I178M, Q207E, V245E, A272P, K277R, I293V, E297Q N136ND, Q145QP 
CA1495 CA4275 AZT, 3TC, D4T, DDC None D67N, K70R, M184V  V35I, K122E, I135T, I142L, Q197QH, T200I, Q207D, R211K, V245T  
CA1496 CA4276 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, L210W, T215Y  K43EQ, T69N, D123E, S162C, R172RG, D177E, Q207E, R211K, K223Q, L228R I180IM, E203EDKN 
CA1498 CA4281 D4T, AZT, 3TC None M41L, D67DN, M184V, L210W, T215Y  K20R, Y144YF, S162C, E169D, Q197E, R199RT, T200TI, Q207E, R211K, A272P, K277R, E297APST, E300ED R143S, Q145K, T286AG 
CA1511 CA4328 AZT, 3TC None K70R, M184V  E169ED, Q174QE, Q197QH, T200A, F214L, P243PS, V245VL, L246LV, P247PT E233EQ 
CA1524 CA4366 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, D67N, T69D, V75M, F77L, M184V, L210W, T215Y E138K V35T, T39A, K43KE, E44ED, V60I, K82R, V118I, K122E, I135T, H208HY, A272P, K277R, T286A, E297A  
CA1534 CA4397 AZT, DDC, 3TC DLV M41L, M184MV, L210W, T215Y A98AG, K103N, Y181YC T39N, K43E, K122P, I142V, D177E, V179I, V189VI, I202V, Q207QE, R211K, Q278H, R284RK, T286A, E291D, V292I, I293V  
CA1551 CA4436 AZT, DDI, D4T, 3TC, DDC NVP M41L, M184V, T215Y K103N K20R, T39A, K122E, I135T, R211K, A272P, K275R, I293V  
CA1554 CA4442 D4T, AZT, 3TC, DDI, DDC NVP, DLV D67N, T215Y, K219Q K103N, Y188L V35I, R83K, K102Q, K122E, K166R, I178L, A272P, K277R, L283I, I293V, E297K  
CA1578 CA4504 AZT, 3TC, D4T, DDC None M184V  K20R, V35I, I135V, S162C, R211K, V245T, I293V K281KE 
CA1579 CA4506 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI DLV M41L, L210W, T215Y  K20R, K122E, E138G, D177E, I178L, R211K, K220X P140PQ 
CA1582 CA4514 AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y V179VD K43Q, V118I, K122V, D177E, G196E, Q207E, R211K, D218E P140PQ, G231GR 
CA1586 CA4522 D4T, 3TC, AZT DLV  K103N K20R, R83K, D123E, D177E, T200A, R211S, L260X  
CA1587 CA4524 AZT, 3TC, D4T NVP   K20R, I135T, K173E, I178IM  
CA1590 CA9315 DDC, AZT, D4T, 3TC, DDI None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y, K219N  E44D, V60I, V118I, K122E, I135T, G196E, T200I, E203K, Q207E, H208Y, R211K, K223E  
CA1592 CA4536 3TC, AZT None M41L  V60I, I135T  
  CA9180 3TC, AZT, D4T, DDI None   V60VI, I135T, R211K, A272P  
CA1617 CA4590 AZT, 3TC, D4T None M41L, D67N, L74I, M184V, L210W, T215Y  T39A, E44D, K102R, V118I, K122E, I142V, V179I, T200E, I202V, E203K, Q207E, R211A, V245K, A272P, E297K, S322T, I329V, P345E, G359S, A371V, T386I, K390R, E399D, A400T, V435E, D460N, R463K, K465KN, S468H, H483Y, I506L, Q524E, A554APST, R557RS K476KN 
CA1618 CA4592 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, K219Q Y188L K11KR, K64KR, K103R, I135V, E203EA, F214L, V245E, A272P, Q278QH, I293IV L264LV, L282LR, K287KE 
CA1622 CA4600 DDI, D4T, 3TC DLV M41L, T215Y K103KN, Y181C I142IV, K166R, Q207E, K277R, T286A, I293V  
CA1624 CA4604 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y, K219N  T39A, E44D, H208Y, R211K, V245T, K277R, R284K, T286A, V292I, E297K N265NT, C280CR 
CA1799 CA4834 D4T, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  E6D, K20R, T69N, K103R, K122E, T200I, R211K, F214L, K311KR, R356K, A360V, A376T, A400T, L452LS, T470A, H483Y, G490GE, L491LS, K527KN, A554N  
CA1808 CA7443 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, D67G, L74V, M184V  E6ED, K20R, E44D, S68G, V118VI, I135V, S162C, Q174QH, N175NY P140PQ 
CA1813 CA4867 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI DLV M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, L210W, T215Y, K219Q K103N, Y181C V60I, K102R, V118I, I135T, H208Y, R211K, F214L, D218E, H221HY, L228H, R284K, T286A, I293V, E297K E138EV 
CA1821 CA4903 AZT, DDC, D4T, 3TC, DDI None M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y  K20R, K122E, S162A  
CA1826 CA4913 DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y, K219R  K43Q, V60I, V118I, E203K, Q207E, R211K, E224ED, L228H, A272P, I293V K287KT 
CA1846 CA4950 DDC, AZT, D4T, DDI, 3TC NVP M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, T215F, K219Q A98G, Y181C, G190A K20R, V35L, T39A, K43E, V60I, D86E, V118I, I135V, S162D, V179VI, G196E, E203K, R211K, F214L, L228H, A272P, T286A, I293V, Q334L, G335S, R358K, A371AV, A376T, T386I, A400T, E432D, V467I, T470P, L491S, T497S, A554S K259K*RW, K287KE 
CA1847 CA4954 DDI, AZT None M41L, D67N, T69D, K70R, L74V, T215F, K219Q  A33AG, V60I, K103R, V118I, K122E, I135T, K166T, E194EA, I202IT, H208HY, F214L, D218DE I159L 
CA1850 CA10524 AZT, 3TC, D4T NVP D67N, K70R K103N E6D, A98S, K122P, I135V, D177E, R211K, A272P, K277R, I293V, E297A, A304G  
CA1853 CA4967 DDI, AZT, 3TC, D4T NVP M41L, M184MV, T215Y K103N K20R, D121H, K122E, I135T, I142T, D177E, I178V, G196E, R211K, A272P, K277R  
CA1854 CA4969 D4T, 3TC DLV  K101E A98S, D123E, E138A, I142V, T200AV, V245M, A272P, K277R, I293V K259K* 
CA1859 CA4979 DDC, AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K43E, E44D, A98S, V118I, D123N, I180V, R211K, F214L, L228R, A272P, I293V, M357T, K390R, A400T, V435I, A446S, Q509H, S519N, K527N, A554S  
CA1863 CA4988 AZT, DDI, D4T, 3TC NVP M41L, M184V, L210W, T215Y K103N, K238T K43E, K49R, R83K, V118I, I135T, I178M, V189I, T200A, R211K V254VF 
CA1866 CA4994 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC NVP M41L, A62V, D67N, V75I, M184V, L210W, T215Y, K219R V106A, G190A, F227L K43N, E44D, W88C, V118I, K122E, I142IV, G196E, Q207E  
CA1869 CA4998 AZT, 3TC, D4T DLV M41L, D67N, M184V, T215Y A98G S3C, K20R, V35I, E44D, R83K, V111I, K166R, I167V, T200A, I202V, H208Y, L210S, H221Y, V245T, E248D, D250E, A272P, K277R, I293V  
CA1872 CA5004 DDI, AZT, 3TC NVP M41L, M184MV, T215Y K103N K20R, K43KN, K64KR, K122E, E169D, V179I, A272P, K277R, Q278QH, L283I, I293V, E297K E42EA, N265NT, K281KE 
CA1963 CA7523 AZT, DDI, D4T, 3TC EFV D67N, K70R, T215V, K219Q K103N V35L, T69N, D123DE, K166T, V179I, G196E, V245EK, K277R, T290TA, I293V, P294T, E297K K263KQ, N265NT, L279LPS, R284RT 
CA2082 CA7708 AZT, 3TC, D4T NVP M184MV K101E E28K, I135IM, Q174K, N175Y, T286A K201KN, L209LP, K220KR, K259KQ, N265NS, R284RT 
CA2091 CA7726 AZT, 3TC, D4T, DDC None M41L, M184V  K122E, D123N, T200A, K201KI, E203EA, R211K K154K*, I202IFL, T216TI, Q222QH, Y232Y*, L246LQ 
CA2097 CA7744 AZT, 3TC None M41L, D67DN, K70R, M184V, N348I  S162A, Q174R, Q207E, A272P, I293V, K311R, S322T, Q334L, G335D, R356K, K366R, A400T, E404D, D460N, L469I, L491S, S519N, Q524E, V531I, K558R  
CA2206 CA7998 AZT, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  K43Q, E44D, V60I, V118I, K122E, I135T, H208Y, R211K, D218DE  
CA2213 CA8018 AZT, 3TC, D4T NVP T215FI Y188L V118I, K122E, I135T, R211K, F214L, A272P, V276T, Q278QH, L283I K275KN 
CA2251 CA8164 D4T, 3TC None D67N, T69D, M184V  V35I, I135V, S162C, R211K, V245T  
CA2256 CA9177 AZT, DDC, 3TC, D4T None M41L, L210W, T215Y  K11R, V35I, K43N, E44ED, R83K, G196E, T200A, Q207E, H208HY, R211K, L228HR, V245E, A272P, K277R, Q278H, T286A, E297R, G333E, R358RK, A360AT, A400L, E404N, N418S, L452A, D460N, H483Y, A554S  
CA2258 CA8182 AZT, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y  Q207E, E224ED, V245IM, K277R, T286A, I293V K220KIM 
CA2262 CA8192 D4T, 3TC DLV M41L, D67DN, M184V, L210W, T215Y, K219N  K20KR, T39A, E44D, V118I, K122E, I135T, D177E, H208Y, R211D  
CA2313 CA8442 DDC, AZT, D4T, 3TC None K70R, M184V  I135T, D177DE, G196E, Q207K, R211G, F214L  
CA2314 CA8403 DDI, AZT, D4T, 3TC NVP M41L, D67N, L74V, M184V, L210W, T215Y, K219N K103N, V108I, Y181C, F227L K20R, K43N, K101R, V118I, I135T, I202IV, E203K, R211K, K223E  
CA2315 CA8405 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M184V K103N S68G, V90I, D123E, D177DE, R211K  
CA2322 CA8421 DDC, AZT, D4T, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  K20KR, V60VI, V118I, D121Y, K122E, K166R, D177E, I178IV, G196E, R211K  
CA3879 CA9071 AZT, 3TC, D4T None M184V, T215Y  I135M, K173E, Q207E  
CA3886 CA9078 AZT, 3TC None M184V K103N I135V, S162C, I178L, R211K, P243PH L234LH 
CA3893 CA9085 D4T, 3TC None M184MV  V35I, I135T, I202V, F214L  
CA3908 CA9110 AZT None D67N, K70R  V60I, R83K, V90I, S162Y, E224ED K223KN 
CA3914 CA9117 AZT, 3TC, DDC, D4T, DDI None D67G, T69D, K70R  K64R, I142V, G196E, R211A, F214L, V245M I132IM, N137NCSY 
CA3963 CA9202 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC NVP M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y Y188L V21I, K43N, E44D, K102KR, V118I, K122E, I135T, S162C, V189VI, R211K, E224ED F130FL 
CA3968 CA9209 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q K103NS, Y181C T69N, V118VI, D123E, I135T, D177E, G196E, F214L, V245M, A272P, K277R, I293V, E297A  
CA3969 CA9212 AZT, 3TC, DDI None M184V, L210W, T215Y  K43Q, S68G, R83K, K122E, D123N, I135V, T139TM, T200A, R211K, T286A, E297K  
CA3970 CA9213 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  V35T, V60I, R83K, I135V, G196E, R211A, E297K  
CA3983 CA9232 DDC, AZT, D4T, 3TC None M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215Y, K219Q  S3SC, V35L, T39A, V60I, K122E, I135T, I167IV, D177DN, I178M, G196E, E203K, Q207E, H208Y, W212LM, D218DE, K223E, L228H, V245K, E248EV L234LV 
CA3984 CA9233 D4T, 3TC None M184V  K122P, I142IV, I202V, Q207G, R211Q P133PR, G141GR, Y144YS 
CA4060 CA9325 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q  I135V, D177E, D218DE, V245T, I293V, I326LV, I329V, A371V, T386I, T403R, V531I, A554T K390Q 
CA4062 CA9328 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  P4PS, K32R, K43KE, V118I, I178IM, A272S, T286A, E291D, I293V E233V 
CA4074 CA9354 Unknown, AZT, 3TC Unknown M184V M230ML K64R, V90I, A98S, I142V, S162C, R211RT Y232Y*, E248E* 
CA4091 CA9379 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M41L, D67N, T215Y V106A, F227L V35M, R83K, D123E, S162A, Q207E, D237E, V245Q  
CA4100 CA9395 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, K70R, V75VA, T215F, K219Q A98AG, Y181C K20R, I31IL, L34LI, V35A, T39A, V118VI, I135L, S162D, F214L, L228H, K281KR, E297P T286AG 
CA4129 CA9439 AZT, 3TC, DDI NVP M41L, L74I, M184V, T215Y Y181C K20R, K49R, K122Q, I135M, D177E, V179I, I202V, H221Y, V245R, A272P, I293V  
CA4144 CA9896 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, T215F, K219Q Y188L K122KE, I178L, R211K, F214L, K277R, T286A, A288G, E297K  
CA4159 CA9921 AZT, 3TC, D4T None M41ML, V75A, Q151M, M184V, T215TNSY  S68SG, D121H, K122E, K173Q, D177E, I178L, G196E, T200A, F214FL, V245M, E248D, D250A, A272P, E291D, I293V  
CA4164 CA9935 AZT, 3TC None M184V V179DE R83K, K102R, S162SC, S163T, K173N, Q174K, Q207E, R211K, V245T, E248ED, A272P, K277KR, T286A, I293V, E297T  
CA4166 CA9937 DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  K104KR, K122E, D123E, I142V, T200V  
CA4285 CA10457 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, T215Y  K20R, I135V, S162C, T200A, E203ED, R211Q, T286A, I293V, E297A  
CA4303 CA10492 DDC, AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210LW, T215Y  K20R, K104KN, I135T, L149X, K173E, Q174K, D177E, Q197E, I202V, Q207K, R211K, F214L, A272P, R284K, T286A  
CA4307 CA10496 AZT, D4T, 3TC, DDI None  M230MLV K122E, I178M  
CA4315 CA10506 AZT, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q  E40ED, V60I, V118I, K122KE, S134SCGR, I135T, I202V, F214L, L228H  
CA4316 CA10507 AZT, 3TC, D4T None M184V  I135V, S162C, A272P, K275R, L283I  
CA4330 CA10521 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215S, K219Q  D17DG, K20R, V35L, V60I, K103R, V118I, K122E, S134SC, K173E, Q207E, F214L, L228H, K277R, A288T, I293V, E297K P25PA 
CA4333 CA10525 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, V75M, M184V, L210W, T215Y  K20R, V21I, T39K, K43E, E44D, V60I, K104N, V118I, K122E, I135V, I202V, R211K  
CA4341 CA10537 AZT, 3TC, D4T, DDI None M41L, D67N, K70R, T215F, K219Q  V60I, V90I, K104N, I142V, S162Y, E203ED, R211K  
CA4354 CA10552 AZT, 3TC, D4T None M41ML, D67N, M184V, T215Y  E6D, G196E, T200I, I293V, E297Q  
CA4367 CA10569 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, M184V, L210W, T215Y  K20R, K43E, V118I, T200I, R211K  
CA4375 CA10578 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP, DLV M41L, D67N, L210W, T215Y K103N, Y188L K20R, E44D, V60I, K102N, V118I, K122E, I142V, Q197E, T200A, I202V, H208Y, V245E  
CA4378 CA10582 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, K219Q V179D, G190A K20R, K122E, I135T, G196E, F214L, A272P, E297A, A304G