<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Avi (2009)
Title Absence of genotypic drug resistance and presence of several naturally occurring polymorphisms of human immunodeficiency virus-1 CRF06_cpx in treatment-naive patients in Estonia.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 56
NumPts 56
Subtype CRF06_cpx, F, G, B

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
B14 B14 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
B142 B142 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, Q207E, R211K  
B17 B17 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, V189A, T200A, Q207E, R211K  
B20 B20 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, K122Q, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
B21 B21 None None   K20R, K32R, V35I, T39A, V60I, I135V, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
B31 B31 None None   K20R, K32R, V35T, K122E, I135V, I142T, R172K, D177E, I178M, T200G, E204K, Q207D, R211K  
B36 B36 None None   K20R, V35I, V60I, D123E, I142T, D177E, T200V, E203D, Q207E, R211K  
B52 B52 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I135V, I142T, K173E, Q174R, D177E, T200V, Q207E, R211K  
B67 B67 None None   K20R, K32R, V60I, I142T, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207D, R211S  
B81 B81 None None   K20R, K32R, V35T, E40D, V60I, D123E, I142T, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
M01 M01 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M02 M02 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, K166T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M06 M06 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, K122A, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M07 M07 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
M09 M09 None None   K20R, V35T, V60I, K122P, D123E, I142T, K173Q, Q174R, D177E, I178L, T200V, Q207E, R211K  
M11 M11 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M26 M26 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
M262 M262 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, D123E, I142T, K166R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M28 M28 None None   K20R, K32R, K49R, V60VI, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
M32 M32 None None   K20R, V35T, V60I, D123E, I142T, Q174R, D177E, T200E, Q207E, R211K  
M35 M35 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K L228S 
M44 M44 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, D123E, I135T, I142T, Q174R, D177E, T200X, Q207E, R211K  
M52 M52 None None   K20R, V35I, I142T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F227I  
M56 M56 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, K166R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
M65 M65 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, K166R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M66 M66 None None   K101Q, K102R, I135M, E138A, S162C, T200A, L210F  
M73 M73 None None   K20R, V35T, V60I, D123E, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M76 M76 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
M81 M81 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
M84 M84 None None   K20R, V35T, E40D, V60I, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
M85 M85 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
M91 M91 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, K166R, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E  
M94 M94 None None   K20R, V35T, K49R, V60I, K122E, D123E, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K, D218H, K223R  
M98 M98 None None   K20R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
N09 N09 None None   K20R, K32R, V35T, E40D, V60I, D177E, I178M, I195L, T200V, Q207E  
N12 N12 None None   K20R, V35I, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K, F214L  
N17 N17 None None   K20R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200E, Q207A, R211K  
N19 N19 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N21 N21 None None   K20R, V35M, V60I, Q174R, D177E, I178M, T200V, E203Q, Q207D, R211K  
N33 N33 None None   K20R, V35T, T39A, V60I, I135T, I142T, T165I, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N34 N34 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N38 N38 None None   K20R, K32R, V35T, E40D, V60I, K122P, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N43 N43 None None   K20R, K32R, V35I, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N432 N432 None None   K20R, K22*, V35I, T39A, V60I, I135T, I142T, D177E, T200V, Q207E  
N44 N44 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, K122E, D123S, S162A, Q174R, D177E, I178M, Q207E, R211K  
N46 N46 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200E, Q207E, R211K  
N49 N49 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142M, D177E, I178M, T200V, Q207D, R211K  
N52 N52 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, S162A, Q174R, D177E, I178M, G196E, T200V, Q207A, R211K  
N55 N55 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, S162N, Q174R, D177E, I178M, V189I, T200V, Q207E, R211K  
N58 N58 None None   K32R, V35T, V60I, K173E, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N65 N65 None None   K20R, K32R, V35I, T39A, V60I, I142T, T200V, Q207D, R211K  
N74 N74 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, L210F, R211G, T216S L209F 
N75 N75 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, I142T, D177E, I178M, Q207E, R211K  
N80 N80 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
N89 N89 None None   K20R, V35T, V60I, I142T, Q174R, D177E, I178M, T200V, Q207G, R211K  
N98 N98 None None   K20R, K32R, V35T, V60I, I142T, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  

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