<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Avi (2009)
Title Absence of genotypic drug resistance and presence of several naturally occurring polymorphisms of human immunodeficiency virus-1 CRF06_cpx in treatment-naive patients in Estonia.
Citation J Med Virol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 86
NumPts 86
Subtype CRF06_cpx, A, K

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
N02 N02 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, L63H, H69K, L89M  
N03 N03 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, L63H, H69K, L89M  
N04 N04 None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M  
N05 N05 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N06 N06 None    I13V, K14R, I15V, M36I, R41K, H69K, L89M  
N07 N07 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N08 N08 None    L10I, I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N09 N09 None    I13V, K14R, G17E, Q18R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N10 N10 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, K70R, L89M  
N17 N17 None    T12A, I13V, K14R, G17E, K20X, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N18 N18 None    Q2X, I13V, K14R, G17X, L19X, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69R, N88X, L89M  
N31 N31 None    I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
N32 N32 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
N38 N38 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M G68R 
N40 N40 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N47 N47 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N49 N49 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63H, H69K, L89M  
N50 N50 None    I13V, K14R, G17D, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63H, H69K, L89M  
N52 N52 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, L63H, H69K, L89M  
N53 N53 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
N56 N56 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, K45X, H69K, L89M  
N61 N61 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K45X, L63H, H69K, L89M  
N71 N71 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64L, H69K, L89M  
N72 N72 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35N, M36I, R41K, L63Q, H69K, L89M  
N73 N73 None    K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, V82I, L89M  
N74 N74 None    T4TS, K14R, G17D, L19I, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M, Q92K I13GV 
N75 N75 None    L10I, I13V, K14R, G16E, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63H, I64M, H69K, L89M, I93L  
N76 N76 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N77 N77 None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N78 N78 None    I13V, K14R, G17E, L19I, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N79 N79 None    I13V, K14R, G17D, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N81 N81 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, G49X, L63H, H69K, L89M  
N88 N88 None    T12A, I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
N99 N99 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U01 U01 None    I13V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, K70R, V82I, L89M  
U02 U02 None    K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U03 U03 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U04 U04 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K45X, L63H, H69K, L89M  
U06 U06 None    Q2X, I13V, K14R, G17E, K20M, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, K70R, L89M  
U07 U07 None    I13V, K14R, G17E, K20I, A22AP, E35D, M36I, N37D, R41K, L63H, H69K, K70R, L89M E21EAD 
U08 U08 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, L63H, H69K, I72V, L89M  
U09 U09 None    T12A, I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U10 U10 None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U11 U11 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U12 U12 None    T4X, Q7X, K14R, G16X, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M I13G 
U13 U13 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, N37D, L63H, H69K, L89M  
U14 U14 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63P, H69K, L89M  
U16 U16 None    L10I, I13V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U17 U17 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35N, M36I, L63H, H69K, L89M  
U18 U18 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U20 U20 None    I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U23 U23 None    I13V, I15V, G17E, K20I, E35D, M36I, L63P, H69K, V82I, L89M  
U24 U24 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, R57S, L63H, H69K, L89M  
U26 U26 None    T12A, I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U27 U27 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U30 U30 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U31 U31 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M  
U34 U34 None    I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, Q61H, L63H, H69K, L89M  
U35 U35 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M  
U36 U36 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M  
U37 U37 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, T74S, L89M  
U40 U40 None    I13V, K14R, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, K43R, L63V, H69K, L89M, I93L  
U41 U41 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  
U42 U42 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U44 U44 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U47 U47 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U52 U52 None    K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
U53 U53 None    I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M  
U55 U55 None    Q2X, I13V, K14R, I15V, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, I72V, L89M, L90X  
U56 U56 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  
U58 U58 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
U59 U59 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  
U62 U62 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  
U65 U65 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, L63H, H69K, L89M  
U73 U73 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, V82I, L89M  
U76 U76 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U77 U77 None    I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, R41K, K43R, L63H, H69K, V82I, L89M  
U81 U81 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U82 U82 None    Q2X, I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U85 U85 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U88 U88 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, V82I, L89M  
U89 U89 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U94 U94 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, L89M  
U95 U95 None    L10M, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
U98 U98 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63R, H69K, L89M  
U99 U99 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  

Database

Resources

Team