<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Eshleman (2009)
Title Antiretroviral drug susceptibility among drug-naive adults with recent HIV infection in Rakai, Uganda.
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 104
NumPts 104
Subtype D, A, C, CRF01_AE

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 104 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A02378W2 07-156995 None None   K11Q, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162C, T200V, Q207E, R211K, K238R, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
A05705W3 07-156996 None None   V21I, V35T, T39K, K49R, V60I, E169D, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T, D250E, K281R, L283I, T286A, I293V  
A06734R9 08-102647 None None   V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, S162C, D177E, Q207G, R211K, V245K, A272S, K281R, L282C, L283I, T286A  
A07072W1 07-156997 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, D250E, A272P, T286A, A288T, E291D, V292VI, I293V  
A09917B6 07-156882 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K166R, K173A, Q174R, T200A, Q207E, D218DG, V245Q, S251D, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V  
A13889W2 08-102648 None None   E6K, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K, V245K, E248D, D250E, A272P, L282C, T286A, E297K  
A31623W2 08-102649 None None   I5V, E6D, K11R, V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E, A272P, L282C, T286A, I293V  
A40697W2 08-101505 None None   V35T, V60I, D121H, K122KE, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, P243A, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
A50250R9 07-156998 None None   K11T, P14PL, K20R, V21I, V35T, T39R, K46KR, K49R, V60I, I135M, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K, P243S, V245Q, E248D, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
B03497W2 07-156906 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D177E, I195L, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
B05421W3 08-102650 None None   K20R, I31R, V35L, T39A, I47L, K49R, I50V, V60I, D121Y, K122E, I135V, T165I, D177E, V179T, T200I, Q207E, R211K, K238KR, V245Q, K281R, L282C, L283I, I293V  
B06329W1 07-156909 None None   K32R, V35IT, T39TA, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, A272P, K275R, K277R, Q278H, L282C, T286A, I293V, P294PL  
B06769W2 07-156979 None None   E6D, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135V, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E, T286A, E291D, I293V, P294T  
B08298B6 07-156912 None None   V35M, T39A, E40D, K43T, K49R, V60I, S68N, D121Y, K122E, D123E, I159V, D177E, G196E, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, V276VI, K277KR, L282C, L283I, T286A, I293V  
B20757W3 07-156919 None None   I5V, V35I, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245E, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V  
B22943W3 07-156987 None None   V35R, T39A, K49R, V60I, D121Y, K122E, I142T, T165TI, D177E, T200E, E204K, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K275R, K277R, Q278H, L282C, T286A, I293V  
C03294W3 08-102651 None None   K32R, V35T, K49R, V60I, S68G, K122E, D123N, I159V, E169D, D177E, I178L, T200I, Q207D, R211K, P243S, V245E, D250E, A272P, L282C, L283I, R284K, T286A, I293V  
C03919W2 07-156988 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, I159IV, S162SC, D177E, I195L, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
C06231W1 07-156895 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, A158S, K173S, N175H, T200A, Q207A, R211S, V245Q, D250E, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
C06443W1 08-101510 None None   E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211NS, V245E, D250E, T286A, E291D, I293V, P294T  
C08508W1 08-102848 None None   E6K, K11N, V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200E, Q207G, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V  
C10111W3 07-156980 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123G, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, A272Q, K277R, L282C, T286A, I293V  
C25290W3 08-102854 None None   V35T, E44D, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162C, D177E, T200I, Q207E, R211K, F214L, V245T, A272P, K277R, L282C, E297K T253TN 
C35667W1 07-156902 None None   K11T, V35T, T39R, K49R, K122E, D123S, I135IT, I142V, S162C, T165I, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
C36303W3 07-156922 None None   V35T, E36D, T39R, K43Q, K49KR, V60I, K102KR, I135T, D177E, T200I, Q207E, R211RK, V245KQ, D250E, A272PS, V276I, L282C, T286A, I293V  
C38298W3 08-102859 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, D121H, K122E, D123G, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
D08444W3 07-156544 None None   V35T, I47L, K49R, I50V, V60I, K122E, D123N, K173N, D177E, I178M, T200M, Q207E, R211K, V245E, A272P, K275Q, K277R, L282C, E291D, V292I, E297A  
D09716B6 07-156562 None None   V8I, V35T, T39I, K49R, V60I, K122E, D123EK, I135T, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, L282C, L283I, I293V  
D10510W3 07-156925 None None   E6N, V21I, V35T, E36ED, T39TAIV, V60I, K104R, D121Y, K122E, D177E, I178L, T200I, E204K, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K275R, K277R, Q278H, L282C, L283I, T286A  
D27089W2 07-156927 None None   E6D, V35T, T39A, E40D, V60I, V118VA, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207N, V245K, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
D27275W2 08-102864 None None   E6D, V21I, V35T, K49R, I50V, V60I, D123S, I135T, S162C, K173L, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207E, R211NS, D250E, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294AT E36R 
D39781W2 08-101514 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I142V, K173T, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, P243T, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
D40933W3 07-156928 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248D, T286A, E291D, V292I, I293V, P294V  
E02047B1 07-156929 None None   P4S, K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K43E, E44ED, D123N, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
E04754B6 07-156932 None None   V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, T139A, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245Q, D250E, A272S, L282C, L283I, T286A, I293V  
E04982W3 07-156934 None None   E6EK, T7TA, V35T, V60I, K122E, D123S, K173AV, Q174K, D177DE, V179I, T200TA, Q207A, R211K, H221HY, V245Q, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V L283LP 
E05408W2 07-156936 None None   P4T, V35T, T39I, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, E297EGKR  
E06550W2 08-102868 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E36A, T39E, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A  
E13257W2 07-156981 None None   E28G, V35T, E44D, K122E, D123N, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207D, R211K, F214L, V245K, I257L, L282C, R284K, T286A, I293V, P294S Q174Q* 
E21365W2 08-102874 None None   V35T, E40D, K43R, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, S251C, A272P, K277R, L282C, A288T, I293V  
E21593W3 08-101544 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, K173S, D177G, Q207A, R211S, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V  
E22831W1 07-156982 None None   V35T, T39TA, E40ED, K43KR, I47IL, K49R, V60I, K122E, I142V, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, A288T, I293V  
E23593W1 07-156889 None None   V8VI, V35K, K49R, V60I, S68G, V118VI, I159V, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245T, D250E, K281KR, L282C, T286A  
E35130W3 07-156939 None None M41L  K11H, V35E, K49R, V60I, D121Y, K122E, R125K, I135R, D177E, T200I, Q207G, R211K, V245I, D250E, A272P, L282C, T286A, I293V  
E35635W3 08-102880 None None   V8VI, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V241I, V245K, D250E, A272P, L282C, T286A, I293V  
E40578W1 07-156559 None None   V35T, E40D, V60I, D177E, G196E, T200I, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, V276I, L282C, L283I, T286A, A288T, I293V  
F03996W1 08-101570 None None   V35T, K49R, V60I, D121DY, K122E, I135R, D177E, I178IM, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K275R, Q278H, K281R, L282C, T286A, I293V, P294PS, A304E  
F07344W1 07-156991 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, V90I, D121Y, K122E, I135T, K173N, D177E, T200I, Q207E, R211K, I244V, V245T, K249Q, D250E, A272P, K277R, L282C, P294A  
F08438W1 07-156944 None None   I5V, T27S, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, K201KR, Q207A, R211N, V245Q, D250E, K281R, T286A, E291D, I293V, P294T A299AT 
F20947R9 07-156983 None None   V35T, T39R, E40D, V60I, D121H, K122E, I135R, D177E, Q207G, R211K, V245T, D250E, A272S, V276I, L282C, T286A, I293V, A304E K13R 
F28785B6 07-156992 None None   K11Q, V35T, K49R, V60I, K104KR, K122E, D123N, E169D, T200I, I202V, Q207D, R211K, K238R, P243T, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
F35636W3 07-156984 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, T69TS, K122E, I142IT, D177E, I178MV, T200I, Q207G, R211K, V241I, V245K, D250E, A272P, L282C, T286A, I293V  
F39204W2 08-102893 None None   E6EQ, V35T, V60I, K122E, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272Q, V276I, L282C, L283I, T286TA, I293V  
G08798W3 07-156948 None None   V35T, E40D, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, Q207E, R211S, F214L, V245E, D250E, V261I, K275R, V276I, T286A, E291D, I293V, P294T  
G10555B6 08-101571 None None   K11T, V35A, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, V179I, T200L, Q207G, R211K, V245T, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, V292I, I293V  
G12165A6 08-101572 None None   K11T, V21I, V35T, T39KR, K49R, E53D, V60I, D121Y, K122E, S162SN, D177E, I178M, T200TI, E204KN, Q207D, R211K, V245K, D250E, A272S, K277R, L282C, L283LI, T286TA, I293V  
G32218W2 08-101573 None None   V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135V, S162C, E169D, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245EK, D250E, A272P, L282C, L283I, A288T, I293V  
G36577W3 07-156952 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, P243S, V245K, D250E, A272S, L282C, T286A, V292I, I293V  
G49070R9 07-156545 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, K102KQ, I135IATV, I142V, I159IV, D177E, E194D, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K275R, K277KR, Q278HN, L282C, T286A, E291EA, I293IV  
G50468R9 07-156956 None None   E6D, V35T, V60I, K64KR, K122E, D123NS, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200AE, Q207A, R211S, V245VM, D250E, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297Q  
H02375W2 07-156958 None None   K11Q, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162SC, I195IT, T200V, Q207E, R211K, K238R, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
H13658W2 08-101499 None None   V35I, K49R, V60I, D121Y, K122E, F171Y, D177E, I178IM, G196GR, T200IM, Q207D, R211K, P243T, V245K, D250E, A272P, K275R, L282C, T286A, I293V  
H13771W2 08-101575 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200M, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272T, L282C, A288T, I293V  
H13802B6 08-101500 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245IK, D250E, K277R, L282C, L283I, T286TA, A288AT, I293V  
H15006W2 07-156959 None None   E6EK, V35T, T39I, E40A, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277KR, L282C, T286A, I293V, E297K K275LQ 
H20818W2 08-101503 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245E, D250E, S251D, A272P, K277R, K281R, L282C, R284K, T286A, A288T, V292I, I293V, E298A  
H28745W2 07-156961 None None   K11T, K20R, V21I, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, V179I, E194D, I202V, Q207D, R211K, V245Q, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V A272L 
H30633W1 07-156985 None None   V35T, K49R, V60I, K104R, D121Y, K122E, E138Q, S162C, D177E, I180V, T200R, Q207G, R211K, V245K, E248D, D250E, I257IL, A272S, K281R, L282C, T286A, I293V K13R 
H37159W2 08-101504 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, K173S, D177G, Q207A, R211S, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V  
H37890R9 08-101577 None None K219KR  K20R, V35T, E40G, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, D250E, Q278QH, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T A272LPS 
H39955W2 08-101578 None None   V35T, V60I, D121C, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207K, R211K, V245T, K277R, L282C, T286A, I293V, E297N  
H45372W3 08-101507 None None   E6N, K20R, V35T, T39L, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245Q, D250E, V276VI, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
J00596W2 08-101579 None None   K32R, V35T, K49R, V60I, D121C, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K, P243S, I244IV, V245K, D250E, A272S, K277R, L282C, L283I, A288T, I293V  
J03096W3 08-101793 None None   V35T, T39S, K43E, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
J05347W1 07-156549 None None   V35T, K49R, V60I, V106I, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V, E297A  
J10167W3 08-101511 None None   P14S, K32R, V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139I, D177E, T200I, Q207G, R211K, K238R, I244V, V245K, E248D, D250E, A272P, K277R, K281R, L282C, L283I, T286A, I293V  
J12604W2 08-101518 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, I142V, T165I, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, D250E, S251N, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V  
J21783R9 08-101521 None None   E6D, V35T, E40D, V60I, K122KE, D123N, I135V, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E, T286A, I293V, P294T  
J22380W2 08-101535 None None   E6EK, V35T, K49R, V60I, S68G, D121Y, K122E, D177E, I178M, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
J30993R9 07-156967 None None   K20R, V21I, V35T, T39K, I50V, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D, K281R, T286A, I293V, P294T  
J31493W1 07-156994 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, I142K, K173A, I178M, V189I, T200I, Q207E, R211K, P243PS, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, I293V, E297K, A304E  
J45014W3 08-101543 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, S162SN, D177E, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272P, K281KR, L282C, L283I, T286A  
J49527R9 08-101550 None None   V35T, T39TA, E40D, V60I, E138A, T139A, I142V, D177DE, I178M, V179I, G196E, Q207E, R211K, F214L, V245T, D250E, A272P, K275KR, K281KR, L282C, V292I, I293V  
K09623B6 07-156971 None None   L34I, V35T, T39A, K49R, V60I, D121H, K126KQ, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, I293V  
K09738W2 08-102645 None None   V35T, T39I, E40D, V60I, D177E, I178M, T200I, Q207E, V245K, D250E, A272Q, V276I, L282C, L283I, I293V  
K10192W1 07-156972 None None M41L  I5V, E6ED, K32R, V35T, K49R, V60I, T69TI, D121Y, K122E, Q174R, D177E, I178V, T200I, Q207E, R211K, V245E, K249KQ, D250E, K281R, L282C, L283I, R284K, T286A, I293V  
K12281R9 08-102646 None None   K11Q, V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, P243A, V245K, D250E, A272P, K277R, K281R, L282C, L283I, T286A, I293V  
K13286W3 08-101560 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135IV, S162A, D177E, I178V, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, K277R, T286A, I293V, L295M, E297Q  
K13668W3 07-156999 None None   V35T, T39M, E40D, K49R, V60I, K104R, E169D, D177E, I178M, V179VI, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, L282C, L283I, T286S, I293V  
K13985B6 07-157000 None None   V35T, K49R, V60I, D123E, D177E, I178M, T200I, Q207G, V245K, A272P, L282C, T286A, I293V, A304E  
K20527W2 08-101565 None None   K11Q, V35T, K122E, D123S, I142T, K166R, D177E, I178L, T200I, Q207G, R211K, V245K, D250E, A272PST, K275KR, K277R, Q278QH, L279LI, L282C, L283I  
K22917W3 07-157001 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K49KR, I50IV, V60VI, K122E, D123N, I142V, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, V245E, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
K23352W2 08-101592 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, F171Y, D177E, I178M, V189I, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, V276I, K277R, L282C, L283I, T286A, I293V  
K24111W1 07-156976 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S, V245E, D250E, L283I, I293V, P294A L282LF 
K27580M1 08-101567 None None   V35T, S48T, K49R, V60I, V90I, K122E, D177E, T200I, Q207E, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, L283I, I293V, E297A  
K31818R9 08-101584 None None   V35T, E36D, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250DEKN, A272S, K275Q, K277R, L282C, T286A, I293V  
K35135R9 08-101587 None None   M16MT, V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, T139V, D177E, I178M, D192DN, T200I, Q207EG, R211K, V245K, E248D, D250E, A272AS, K277R, L282C, T286A, I293V  
K38619W2 07-157002 None None   V35T, T39TI, K49R, V60I, F77FS, D121Y, K122E, E169D, D177E, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, L282C, T286A, I293V  
K39436W2 07-156978 None None V75I  A33V, V35T, T39K, I47IL, K49R, V60I, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272S, K281R, L282C, T286A I37M 
K45887W3 08-101589 None None   P4T, V35T, K49R, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, S162N, D177E, I178M, I195K, T200I, Q207E, R211K, I244V, V245T, D250E, A272P, I274V, Q278H, L282C, T286A, I293V  

Database

Resources

Team