<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Nouhin (2009)
Title Low prevalence of drug resistance transmitted virus in HIV Type 1-infected ARV-naive patients in Cambodia.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 67
NumPts 67
Subtype CRF01_AE, B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KC01 KC01RT None None   T39K, K43E, D121DH, K122E, D123S, Q174N, D177E, Q207A, R211S  
KC02 KC02RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, S162SN, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KC03 KC03RT None None   T39K, K43Q, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC04 KC04RT None None   T39E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC05 KC05RT None None   V60I, K122E, D123N, R125RK, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
KC06 KC06RT None None   T39K, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S  
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KC08 KC08RT None None   T39K, K122E, D123S, R125RK, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC09 KC09RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC10 KC10RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC11 KC11RT None None   V118I, I135T, G196E, E204D, Q207H, R211K, F214L  
KC12 KC12RT None None M184MV K103N T39E, K101KQ, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC13 KC13RT None None   T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
KC14 KC14RT None None   T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238KR  
KC15 KC15RT None None   T39A, K122E, D123NS, R125RK, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC16 KC16RT None None   T39K, K43E, V60I, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177EK, V179I, T200I, Q207A, K238R  
KC17 KC17RT None None   E36ED, T39K, R83RK, V106I, K122E, D123NS, R125RK, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC18 KC18RT None None   T39E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207A  
KC19 KC19RT None None   V35I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC20 KC20RT None None   T39Q, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
KC21 KC21RT None None   E40D, V111I, K122E, D123N, K166R, K173IT, Q174K, N175H, I178L, V179I, Q207A, L210M, R211N, K238R  
KC22 KC22RT None None   T39N, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207D, R211K, K238R D218H 
KC23 KC23RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135K, I142V, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
KC24 KC24RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, K238R  
KC25 KC25RT None None   T39A, S68N, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC26 KC26RT None None   S68G, I135T, K166R, G196E, Q207H, R211K  
KC27 KC27RT None None  V179D T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC28 KC28RT None None   T39E, K49R, K122E, D123N, I135T, I142V, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC29 KC29RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200M, Q207A, R211S, K238R  
KC30 KC30RT None None   T39N, V60I, K102Q, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
KC31 KC31RT None None   T39N, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC32 KC32RT None None   T39K, S68G, K122E, D123S, I135IV, I159IV, S163ST, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KC33 KC33RT None None   T39KN, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, K238R  
KC34 KC34RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KC35 KC35RT None None   T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KC36 KC36RT None None   T39N, V60VI, K122E, D123S, T165I, K173R, D177E, T200TI, Q207A, R211S, K238R  
KC37 KC37RT None None   T39K, K122E, D123S, I159V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179T, Q207A, R211S, K238R  
KC38 KC38RT None None   T39K, K43E, K49R, V106I, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207R, R211S, K238R  
KC39 KC39RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC40 KC40RT None None   T39K, K43Q, S68G, K122E, D123S, S162H, K166R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC41 KC41RT None None   T39D, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
KC42 KC42RT None None   T39R, K43E, K122E, D123S, K166R, Q174E, D177E, V179I, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R  
KC43 KC43RT None None   T39E, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207L, R211K, K238R H235HR 
KC44 KC44RT None None   T39K, K122E, D123S, S162N, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
KC45 KC45RT None None   T39E, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174N, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC46 KC46RT None None   T39K, V60I, V106I, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207G, R211S  
KC47 KC47RT None None   T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
KC48 KC48RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, K238R  
KC49 KC49RT None None   T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC50 KC50RT None None   T39K, K43E, S68G, K102R, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207A, R211S  
KC51 KC51RT None None   T39E, K102R, D121Y, K122E, D123G, K173I, Q174K, I178M, V179I, Q207A, R211N, K238R  
KC52 KC52RT None None   T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
KC53 KC53RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KC54 KC54RT None None   V60I, I135T, G196E, I202V, Q207H, R211K  
KC55 KC55RT None None   V106I, D121H, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238KR  
KC56 KC56RT None None   T39K, K43E, K49R, D123N, I135M, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
KC57 KC57RT None None   T39K, K43Q, D121H, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R  
KC58 KC58RT None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R  
KC59 KC59RT None None   T39K, K43E, R83RK, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177K, V179VI, Q207N, R211S, F214FL, K238R  
KC60 KC60RT None None   T39K, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207V, R211N, K238R  
KC61 KC61RT None None   T39D, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, K238R  
KC62 KC62RT None None   T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R  
KC63 KC63RT None None   T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KC64 KC64RT None None   T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
KC65 KC65RT None None   T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KC66 KC66RT None None   T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
KC67 KC67RT None None   T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, E203ED, Q207S, R211S, K238R