<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Liu (2007)
Title Polymorphisms and drug resistance analysis of HIV-1 CRF01_AE strains circulating in Fujian province, China.
Citation Arch Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 66
NumPts 66
Subtype CRF01_AE

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
fj01 fj01 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178V E53K 
fj02 fj02 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M  
fj03 fj03 D4T, 3TC NVP   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173M, Q174K, D177E, I178M, E194K  
fj06 fj06 D4T, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E  
fj07 fj07 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173M, Q174K, D177E  
fj08 fj08 None None   E6D, K11A, V35T, T39E, I50N, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E I37N 
fj09 fj09 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, K173R, Q174K, D177E  
fj10 fj10 D4T, 3TC NVP  Y188L E6D, K11T, V35T, T39E, D86G, F87L, V106I, T107S, K122E, D123S, S163C, K173I, Q174K, D177E, V179I W88L 
fj11 fj11 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj12 fj12 D4T, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178V  
fj13 fj13 None None   E6D, K32R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj14 fj14 D4T, 3TC NVP K70Q  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I I63L 
fj15 fj15 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K66R, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E  
fj16 fj16 None None K70Q  E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, L100F, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M G15~, T27F 
fj17 fj17 D4T, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, K173T, Q174K, D177E, V179I  
fj18 fj18 D4T, 3TC NVP D67G, K70R K103N E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K101Q, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj21 fj21 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E  
fj22 fj22 D4T, 3TC NVP   E6D, V35T, T39K, K43E, K102R, V106I, K173I, Q174K, D177E, V179I, E194Q  
fj24 fj24 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj25 fj25 None None   E6D, V10A, K32R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj26 fj26 None None   E6D, K11T, V21G, T27A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E K22I 
fj30 fj30 D4T, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, L100F, K102R, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I  
fj31 fj31 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj33 fj33 D4T, 3TC NVP  Y181C P4T, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, L100F, V106I, V118I, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M  
fj35 fj35 D4T, 3TC NVP   E6D, V35T, E36A, T39K, K122E, D123S, K166R, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E  
fj36 fj36 D4T, 3TC NVP   I5V, E6D, K11T, V35T, T39E, K46E, V60I, K66R, D121H, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E K30T, K49N 
fj39 fj39 None None   E6D, K11A, V35T, T39N, V60I, F77S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V V148M 
fj40 fj40 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E  
fj43 fj43 None None A62V  E6D, K11T, T27P, V35P, T39K, K43E, T58I, T69N, G112A, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, V179I I63L 
fj44 fj44 None None  Y181F, Y188F E6D, K11A, V35T, T39E, K49R, K122E, D123S, S134R, A158P, S163G, K173I, Q174K, D177E, I178M, L187S M164R 
fj45 fj45 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162T, K173I, Q174K, D177E  
fj46 fj46 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj47 fj47 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, K166R, K173I, Q174K, D177E Y127F 
fj48 fj48 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135L, E138G, R172K, K173L, Q174K, D177E, I178M  
fj49 fj49 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I  
fj50 fj50 None None   E6D, K11A, V35T, E36A, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E  
fj51 fj51 None None   V35T, T39R, K122E, D123S, S162G, K173T, Q174K, D177E L34F 
fj52 fj52 None None   V35T, T39A, K43E, D123E, I142V, K166R, K173N, Q197E  
fj53 fj53 None None   E6D, V35I, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj55 fj55 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E  
fj57 fj57 D4T, 3TC NVP M184V G190A E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj58 fj58 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj59 fj59 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj60 fj60 None None   E6D, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E  
fj61 fj61 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D121H, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, G196E  
fj62 fj62 None None   K11T, V35T, T39K, E40A, K43E, K122E, D123S, I135L, K166R, R172K, K173I, Q174K, D177E, G196E  
fj63 fj63 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135L, K166R, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E G141R 
fj64 fj64 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  
fj66 fj66 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, G196E S191F 
fj67 fj67 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E S191F 
fj69 fj69 D4T, 3TC NVP K65R K103N, Y181C E6D, K11T, L34I, V35T, T39Q, V60I, S68G, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E I178K, S191F 
fj72 fj72 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj74 fj74 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K104R, K122E, D123S, I135V, S162C, D177G S191F 
fj75 fj75 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M S191F 
fj76 fj76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M S191F 
fj77 fj77 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, T131P, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M G155R 
fj78 fj78 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, V179I S191F 
fj79 fj79 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177E  
fj80 fj80 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj81 fj81 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, T139A, S162C, Q174R, D177E T131S, I178K 
fj82 fj82 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj88 fj88 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162N, K173I, Q174K, D177E  
fj91 fj91 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V90I, D123N, Q174K, D177E, V179I  
fj93 fj93 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, E36D, T39K, K43E, K49R, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M  
fj94 fj94 None None M41L  E6D, K11T, V35T, C38*, T39K, K43E, T58N, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M L80V 
fj96 fj96 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E  

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