<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Paraschiv (2007)
Title Polymorphisms and resistance mutations in the protease and reverse transcriptase genes of HIV-1 F subtype Romanian strains.
Citation Int J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 29
NumPts 29
Subtype F

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1413 1413_2003 None None   V35T, T39A, E40ED, E53D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200IV, I202IV, Q207A, R211K, V245N, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, I329V  
1436 1436_2003 None None   V35T, T39A, E40ED, I50IV, K64KN, T69TA, E79ED, D123E, I135L, S162C, K173AT, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286AV, A288AS, E291D, V292IT, I293V, P294T, E297A  
155 155_2003 None None   V35T, T39S, E40D, E42K, V60I, D123E, I135L, E138A, I142V, S162H, L168*, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I309V, D320N, I329V M41R, E169S, K173APT, R307RS, V317Y, Y318I, Y319E 
156 156_2003 None None   V35T, T39A, E40D, K102Q, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, L283LI, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T  
1569 1569_2003 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K166Q, K173IV, Q174K, I195L, T200A, I202IV, Q207A, R211K, V245Q, E248DN, A272P, V276VI, L283LI, R284RK, E291ED, V292I, I293V, P294T, E297A, A304AE, V317A  
157 157_2003 None None   V35I, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207AT, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291ED, V292I L120F 
158 158_2003 None None   V35I, E40D, W88C, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, A288G, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, A304E, A327V  
2093 2093_2004 None None   V35T, V60I, K122KE, D123E, S162A, K173E, Q174K, D177E, I178L, T200A, I202IV, E204EQ, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, T286TA, E291D, V292I, I293V, E297A, V314I, D324E, K331N  
2152 2152_2004 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174K, Q207A, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, D324N  
2165 2165_2004 None None  V179D V35T, T39A, E40D, I135L, I142IV, S162H, K166E, E169EK, K173IT, Q174K, I195L, G196E, T200TA, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, V276VI, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, K331N  
2301 2301_2004 None None  V179D V35T, T39A, E40D, S68G, D123E, I135L, I142IT, S162H, K173I, Q174K, D177E, I195L, G196E, T200A, E203D, Q207T, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I326M  
2303 2303_2004 None None   V35T, T39N, E40D, V60VI, D123E, I135IT, S162H, K173IT, Q174K, Q207G, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, E298ED, A304E, V317A, Q332H  
2307 2307_2004 None None   V35T, T39N, E40D, D123E, S162H, K173I, Q174K, Q207EG, R211K, L228LM, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PS, E297T, A304E, V317A  
304 304_2004 None None   V35T, T39A, V60I, S68N, K102KR, D123E, I135T, E138A, S162Y, K173E, Q174K, D177G, V179I, I195L, T200A, Q207EG, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V314I, V317A, D324E  
337 337_2004 None None   V35T, T39A, E40D, K102Q, K104R, D123E, I135L, S162Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I326V  
3402 3402_2003 None None   K20KR, V35T, T39A, E40D, V60VI, K104KR, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207AE, R211K, V245Q, E248D, D250DE, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
3610 3610_2003 None None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162H, K173I, Q174K, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291ED, V292I, I293V, P294Q, E297A, I326T E40DY 
397 397_2003 None None   K20KR, V35T, T39A, V60VI, D123E, I135L, E138G, T139A, I142V, S162H, M164ML, K173T, Q174K, N175Y, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286V, V292VI, I293V, P294T, E297A, I329V  
4420 4420_2004 None None   V35P, T39A, E40D, V60I, K101KR, D123E, I135L, E138A, K173A, Q174K, I195L, T200K, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, R284K, T286A, E291A, V292I, I293V, L295M, E297A, V317A  
4505 4505_2004 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, E204EQ, Q207AE, R211K, V245Q, E248N, A272P, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, A304E  
4983 4983_2004 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, K173A, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, A304E, V317A, I329L  
523 523_2004 None None   V35T, E36EA, T39A, E40D, K122R, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195IL, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
530 530_2004 None None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162H, K173M, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207T, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E297A  
590 590_2004 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, S162H, K173R, Q174K, V179VI, T200A, Q207A, R211K, E224ED, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, A304E  
632 632_2004 None None   K32KR, V35T, E40D, V60I, D123E, I135L, I142V, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207AT, R211K, V245Q, E248DN, A272P, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, E300EK, V317VA, I326IV, Q334L  
634 634_2004 None None   V35T, T39L, D123E, S162C, K173T, Q174K, I178L, I195L, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286TA, E291D, V292I, I293V, E297A  
697 697_2004 None None   V35T, V60I, D123E, I135L, S162HY, K166KR, K173I, Q174K, I195IL, T200A, Q207T, R211K, V245Q, E248N, A272P, K275Q, V276I, K277R, L283LI, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
842 842_2004 None None   V35T, E36D, T39L, E40D, D86E, D123E, S162C, Q174K, I195L, G196E, T200V, E203D, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297K, A304E  
894 894_2004 None None   V35T, T39A, E40D, W88S, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  

Database

Resources

Team