Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Lloyd (2008)
Title Prevalence of resistance mutations in HIV-1 infected Hondurans at the beginning of the national antiretroviral therapy program.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 336
NumPts 336
Subtype B, F, A, C


  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 336 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CR002 03HN_CR002 None None   Q174E, Q207E, R211K, A272S, T286A, I293V, A304AE  
CR004 03HN_CR004 None None   V60VI, S68G, K103R, D123DE, I135T, K166KR, Q174E, T200A, L228LF, V245KQ, L246LV, A272S, K277KR, T286A, I293V, E297EA  
CR006 03HN_CR006 None None M184V K103N V60I, A98S, I135T, Q174E, I202V, R211M, V245E, A272P, I293V  
CR009 03HN_CR009 None None M184V K103N, P225H V60I, K101Q, I135T, I178M, T200A, V245Q, A272P, T286A, I293V  
CR010 03HN_CR010 None None  V179D T107S, V118I, S162C, K173R, Q174E, T200I, F214L, V245M, A272P, T286A, I293V, E297D  
CR011 03HN_CR011 None None   P4S, I5IV, V35T, K103R, D123E, I142IT, D177E, F214L, V245I, A272S, Q278QH, T286A, I293V K30KT 
CR012 03HN_CR012 None None M41L, L74V, L210W, T215Y K103N, G190S K20R, K122E, I178M, T200Q, K223Q, L228R, V245Q, K275Q, V276I, L283I, I293V, E297A  
CR015 03HN_CR015 None None   K20R, V35T, V60I, I135IT, Q174E, I202V, K277R, L283I, I293V, E300Q P97PS, L260LF, L264LF 
CR017 03HN_CR017 None None   Q174E, K238R, V245T, A272S, K275Q, K277R, T286V, I293V, P294T P97PR, N265NFIY 
CR022 03HN_CR022 None None   V35E, T39A, D121HY, K122E, I135R, D177E, I178M, V245M, T286A P97PS 
CR023 03HN_CR023 None None   K20R, Q174E, I178L, V179I, E204K, V245M, A272S, T286A, A288T, I293V, E312K  
CR024 03HN_CR024 None None   K20R, D123E, Q174E, D177E, I178V, I202V, A272T, V276VI, T286A, I293V  
CR025 03HN_CR025 None None D67N, K70R, M184V, T215FI, K219E K101E, G190A K49R, I50V, W88S, K103R, K166R, Q174E, Q207E, F214L, K238KR, A272S, K275Q, K277R, I293V, E312N  
CR026 03HN_CR026 None None   V35I, D123E, Q174E, I178M, R211K, V245M, A272S, T286A, V292I, I293V, E297Q, E312K  
CR028 03HN_CR028 None None   K20R, S162A, Q174A, A272S, K277R, I293V, E312K  
CR029 03HN_CR029 None None   V35VI, S162C, I195T, R211K, A272P, L283LI, I293V  
CR030 03HN_CR030 None None   K20R, V35I, S48T, T69A, V118I, K122P, K173T, Q174K, D177E, T200I, R211RK, F214L, V245M, I257L, K275Q, K277R, I293V, E297A  
CR031 03HN_CR031 None None   E6D, W88C, V118I, D123N, K173E, Q174R, I178L, R211RK, F214L, A272T, T286A, I293V, E312Q K11PQ 
CR034 03HN_CR034 None None D67DN, K70R, M184V, T215I, K219E K101E, K103S, G190A K20KR, K49R, I50V, K122KE, K166R, Q174E, Q207E, F214L, A272S, K275Q, K277R, I293V  
CR037 03HN_CR037 None None   R83K, K122P, D177E, A272P, K277R, E291D  
CR038 03HN_CR038 None None   V35I, I135T, Q174E, V245L, A272S, T286A, A288S, I293V, E297A  
CR039 03HN_CR039 None None   E6D, D86E, V90I, K122P, Q207E, R211K, A272ST, T286A, I293V D121V 
CR040 03HN_CR040 None None M184V K103N, V108VI V60I, A98S, I135T, Q174E, I202V, R211M, V245E, A272P, I293V  
CR041 03HN_CR041 None None   D123E, I135V, K173Q, R211K, F214L, V245E, A272S, T286A, I293V  
CR042 03HN_CR042 None None M184V K103N, V108I K20R, I135T, S162C, Q174E, Q207R, F214L, H221Y, V245M, K249R, A272S, K277R, Q278E, I293V, E298A, E312K  
CR043 03HN_CR043 None None   K20R, K103R, K122KE, Q174E, V245K, A272T, T286A, I293V  
CR044 03HN_CR044 None None   V35T, V60I, K104R, K166R, Q174E, D177H, I178M, Q197E, E248D, A272S, K277R, T286A, I293V  
CR045 03HN_CR045 None None   K11Q, K43Q, I135T, Q174E, Q197E, I202V, Q207K, R211G, A272S, K281KR, T286A, I293V  
CR046 03HN_CR046 None None   K122KE, I135T, Q174E, V245M, A272T, K277R, T286A, I293V, E297V  
CR052 03HN_CR052 None None   D123E, Q174E, D177DE, G196E, L228LF, V245M, E248ED, D250E, A272S, K277R, T286A, I293V  
CR055 03HN_CR055 None None   D123E, Q174E, D177DE, G196E, V245M, D250E, A272S, K277R, T286A, I293V  
CR056 03HN_CR056 None None   K122P, D177E, G196E, T200A, F214L, V245M, K277R, Q278H, T286A, I293V, E297AT  
CR057 03HN_CR057 None None   K20R, V35I, D123E, Q174E, D177E, I178M, V245M, A272S, T286A, I293V  
CR058 03HN_CR058 None None   P4S, V8VI, V60I, I135V, I142T, Q174E, V245I, A272S, T286A, I293V  
CR059 03HN_CR059 None None   V60I, R83K, D123E, T200A, R211K, I257L, A288S  
CR060 03HN_CR060 None None   A98S, D123E, Q174K, D177E, V245M, A272T, T286A, I293V  
CR061 03HN_CR061 None None   V35I, D123E, Q174E, I178M, V245M, A272S, I293V  
CR062 03HN_CR062 None None M184MV, L210LW  E6ED, K20R, V106VI, K122KE, D123E, I135T, S162C, K173T, Q174K, I178L, T200TA, R211K, F214L, V245I, A272S, T286A, I293IV, E297A  
CR064 03HN_CR064 None None   K20R, D123E, Q174E, D177E, I178V, I202V, A272T, K277R, T286A, I293V  
CR065 03HN_CR065 None None   T7TI, G45E, S68G, K122P, D123DE, S162H, I178M, I195IT, T200A, R211K, E248ED, K275Q, V276I, T286A, I293V, P294T, E312N  
CR066 03HN_CR066 None None   V35IM, S48T, K103R, K122E, D123EG, I135T, K166KR, Q174E, R211RK, V245M, A272S, K277R, T286A, A288T, I293V, T296S, E297P, A304AE, K311KQ, E312N  
CR067 03HN_CR067 None None   E6D, K20R, T39TA, V106I, K122KE, D123E, I135T, S162C, K173AT, Q174K, I178L, R211RK, F214L, V245I, A272S, T286A, E297A, E312N  
CR068 03HN_CR068 None None   K104KR, K122KE, D123E, I135T, K166R, Q174E, D177E, T200A, V245M, A272S, T286A, A288T, P294T  
CR069 03HN_CR069 None None   K122E, S162C, I195T, T200A, Q207QELV, R211K, V245M, A272G, T286A, I293V, E312T  
CR071 03HN_CR071 None None   K103R, Q174E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, A272S, Q278H, T286A, I293V, P294A, E297A, A304E, E312KR  
CR072 03HN_CR072 None None   K20R, V118I, D123E, Q174N, I178L, T200A, E204D, R211K, F214L, V245M, A272S, T286A, I293V, E297R, E312N  
CR073 03HN_CR073 None None   V35L, T39A, S48T, A98S, K122E, D123DE, I135R, Q174E, D177E, I202V, Q207E, A272S, T286A, A288T, I293V, T296S, E297A, E312N  
CR074 03HN_CR074 None None   V35T, S48T, K49R, V60I, K103R, K122E, I135T, Q174E, R211K, V245M, A272S, K277R, T286A, E297A  
CR075 03HN_CR075 None None   V35T, T39M, V60I, D123E, T139TA, K173AT, Q174K, I202V, Q207E, R211K, V245Q, I257L, V261I, A272P, K281KR, E291D, V292I, I293V, E297T  
CR077 03HN_CR077 None None   V8I, V60I, V118I, D123E, I135T, A158S, R211K, F214L, V245E, E248N, A272P, T286A, E297R, L301I, L310I  
CR078 03HN_CR078 None None   E6D, K102Q, K103R, T107TS, V118I, K122P, Y144YF, K166R, I180V, F214L, A272S, K277R, T286A, I293V, E312K  
CR079 03HN_CR079 None None   V35I, K103KR, I135L, Q174E, T200TA, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272S, T286A, I293V, P294A, E297A Q258Q* 
CR080 03HN_CR080 None None   K64KR, D86E, V90I, A98S, K103R, K122E, I135T, V179I, I202V, R211K, K238KR, V245K, A272S, T286A, I293V, E297K, K311E, E312K  
CR081 03HN_CR081 None None M41L, M184V, T215F Y188L K103R, I142V, Q174E, T200A, E204A, F214L, E248D, A272P, K277R, T286A, I293V, E298A, E312N, I326V  
CR084 03HN_CR084 None None   V35VI, V118I, K122KE, K166KR, K173E, Q174R, T200A, Q207E, R211RK, F214L, A272ST, K277R, I293V, E297A, E312K  
CR085 03HN_CR085 None None   D123E, Q174A, D177E, T200A, R211K, V245A, A272S, T286A, I293V, E298EA  
CR086 03HN_CR086 None None   D86E, D123E, I135V, S162A, V179VI, I195IT, T286TA, I293V  
CR087 03HN_CR087 None None   E6D, V21I, V60I, D123DE, I135IV, A272P, K281R, V292I, E297K  
CR088 03HN_CR088 None None   V35I, D121DY, K122E, D123E, S162C, I195T, Q207QH, R211K, K238KR, K277R, T286A, I293V Q174P 
CR089 03HN_CR089 None None   K122E, I135T, I142T, K173I, Q174K, D177E, V179T, R211K, I244V, V245I, A272T, T286A, I293V  
CR090 03HN_CR090 None None M184V K103N, V108I, G190A K101Q, D123E, I135K, Q174K, T200I, R211S, V245M, A272T, K277R, T286A, I293V  
CR092 03HN_CR092 None None   D86E, K103R, I135V, K173E, K277R, A288S, I293V, E297T  
CR093 03HN_CR093 None None   I135V, S162C, Q174E, R211K, V245M, A272P, K277R, L283I, T286V, A288T, I293V, E297A  
CR094 03HN_CR094 None None M184V K103N K20R, V35I, D123E, I135L, Q174E, D177E, Q197R, R211K, V245M, S251R, K277R, T286A, V292I, I293V, E297A  
CR095 03HN_CR095 None None   V35I, S68G, K122E, S162N, Q174E, I178L, T200A, E204K, Q207E, V245M, A272P, K277R, T286A  
CR097 03HN_CR097 None None M41L, D67DN, M184V, L210W, T215Y K101P, K103S V35T, K49R, V60I, R83RK, S105SL, D123E, D177E, I178L, V179VI, T200I, R211K, A272P, V276I, L283I, R284RK, I293IV, P294Q  
CR098 03HN_CR098 None None   E6D, K122Q, I135T, S162C, Q174E, Q207R, V245M, A272T, T286A, I293V, E297EQ L120S 
CR099 03HN_CR099 None None   K20KE, E79D, D123E, S162C, K173R, Q174A, I202V, Q207E, A272T, T286A, A288T  
CR102 03HN_CR102 None None   V35IL, D123E, K173E, Q174K, D177E, I202V, Q207E, A272T, T286A, I293IV, L301I, K311R, E312K  
CR103 03HN_CR103 None None   D121DY, K122E, I135V, S162C, K173E, D177E, I178IM, I195IT, T200A, V245M, A272P, K275Q, V276I, L283I, I293V, P294T  
CR104 03HN_CR104 None None   D123DE, S162A, Q174E, P176PS, R211RK, V245Q, E248D, A272T, T286TA, I293V, E312N  
CR105 03HN_CR105 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, K173KQ, D177E, I178IV, Q207E, R211K, V245M, I257IL, A272P, K277R, I293V P97PS 
CR107 03HN_CR107 None None   S162C, I178M, I195IT, E224D, V245K, K249Q, T286A, I293V  
CR109 03HN_CR109 None None  K101E, G190S K122P, D123E, I135T, S162A, T165I, Q174E, D177E, V179VI, I202V, F214L, D250E, A272P, K277R, T286A, I293V, T296S, E297A, E312T  
CR111 03HN_CR111 None None   V118A, D123E, T165I, D177E, I202V, Q207E, R211K, V245VM, A272P, T286A, I293V  
CR112 03HN_CR112 None None   Q174E, F214L, V245R, E248D, A272S, K277R, T286V, I293V, E297R, L301I  
CR129 03HN_CR129 None None  V179D E6D, K22KR, S68G, K103KR, V106I, K122Q, I135V, T200A, F214L, V245T, K277R, T286A, I293V, E297A, E312K  
CR133 03HN_CR133 None None   V35VA, D121H, K122E, I142T, K173T, Q174K, D177E, V179T, Q207QE, R211K, V245VI, A272T, T286A, I293V, E312K  
CR134 03HN_CR134 None None   V35VI, V60I, R83K, D86E, V90I, D123DE, I135IM, E138A, A272P, T286P, I293V, E297R, L301I  
CR138 03HN_CR138 None None D67DN, M184V, T215Y  V21VI, K101Q, I135T, S162H, I178M, V179I, R211K, V245M, K275Q, V276I, T286A, I293V, P294T, E312N  
CR139 03HN_CR139 None None   E6D, D86E, K104R, I142T, Q174N, I178M, E204D, Q207E, A272S, T286A, E297A, K311R, E312T  
CR141 03HN_CR141 None None   D123DE, I135T, S162Y, D177E, R211K, I257L, A272P, T286A, A288S, I293V  
CR142 03HN_CR142 None None   V118I, D123E, I135T, Q174E, T200A, F214L, V245M, A272T, T286A, I293V  
CR143 03HN_CR143 None None   V35I, S68G, K122E, I135T, I178L, V245L, A272P, V276I, L283I, T286A, I293V, P294A  
CR144 03HN_CR144 None None   E6ED, K49R, K122P, I135T, S162C, E169D, Q174E, D177E, E204EQ, Q207E, A272S, K277R, T286TA, I293V, E312K  
CR145 03HN_CR145 None None   K20R, V35I, I135T, R211RG, V245I, S251H, A272T, T286A, I293V, P294A, E297Q, E312N  
CR146 03HN_CR146 None None   V8I, K122E, I135T, I142V, Q174A, V245M, I257L, T286A, I293V, E312K  
CR147 03HN_CR147 None None   D86E, V90VI, K102Q, K103R, I142T, K166R, K173R, Q174E, R211K, A272P, V276VI, R284RK, T286A, E291A, I293V, L301I L80H 
CR150 03HN_CR150 None None   V35T, V60I, S68G, T69N, K103R, D123E, T131TP, I135T, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, F214L, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, P294T, E312D  
CR151 03HN_CR151 None None   D123E, Q174E, D177E, I178IM, V245I, A272S, T286A, V292VI, I293V, E312N  
CR152 03HN_CR152 None None   K103R, D123E, I142IV, S162C, Q174E, D177E, A272T, T286A, I293V, E312N  
CR153 03HN_CR153 None None  V179D, Y188L V35VIM, S68G, K103R, K166R, Q174EK, R211KQ, F214L, A272S, T286TA, I293V, L301I, E312N K102L 
CR154 03HN_CR154 None None   K103R, D123E, I142V, Q174E, D177E, R211K, V245I, A272T, K277S, T286A, I293V, E312K  
CR155 03HN_CR155 None None   V8VI, E36D, D123E, I135V, I142V, K173E, Q174K, D177DG, I178L, R211K, V245M, E248D, A272S, T286A, A288S, E291A, I293V, P294T, E312K  
CR159 03HN_CR159 None None   K20R, V35VI, I50IV, V60I, S68G, D86E, F87FL, W88CS, V90I, K122V, I135V, Q174E, I178L, A272T, T286A, I293V, K311KR, E312N  
CR160 03HN_CR160 None None  K103N E6ED, K122E, I135T, K173E, T200A, I202V, E204K, R211RK, V245M, A272P, K275Q, V276I, T286A, V292I, I293V, E297P, A304E, E312K, V314I  
CR161 03HN_CR161 None None   K122KQ, D123DE, I135T, S162C, Q174E, Q207E, A272S, K277KR, T286A, I293V, K311KR, E312T  
CR162 03HN_CR162 None None  V108VI K102Q, K103R, K166R, Q174E, R211RG, F214L, A272S, K277R, T286A, I293V, L301I, E312N  
CR164 03HN_CR164 None None M184V Y181C V35I, D86E, D121Y, K122E, I135T, I142T, T165M, I178L, I195T, T200TA, F214FL, V245VM, A272P, V276I, L283I, I293V, E312T  
CR166 03HN_CR166 None None   K20R, K103R, D123E, Q174AE, V179I, R211K, V245M, A272S, K281R, L283LI, I293V, E297A, E312K