<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ly (2007)
Title Reverse transcriptase mutations in Cambodian CRF01_AE isolates after antiretroviral prophylaxis against HIV Type 1 perinatal transmission.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 185
NumPts 51
Subtype CRF01_AE


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Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 185 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NL_KHM_CA1 KHM_CA1 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211N, K238R  
NL_KHM_CA12 KHM_CA12 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA14 KHM_CA14 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245A  
  CA14W2R AZT NVP  A98AG V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173RT, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245A  
  CA14W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245A  
NL_KHM_CA17 KHM_CA17 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39M, R83K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA17W2R AZT NVP   V35T, T39M, R83RK, D86DE, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA17W6R AZT NVP   V35T, T39K, R83K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA17W52R AZT NVP   V35T, T39M, R83RK, D86DE, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA18 KHM_CA18 None None  V179D E6D, K11T, V35I, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, V245Q  
  CA18W2R AZT NVP  K103KN V35I, T39K, S68SG, V106I, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S, V245Q  
  CA18W6R AZT NVP  Y181YC V35I, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S, V245Q  
NL_KHM_CA21 KHM_CA21 None None   E6D, K11T, E28G, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K  
NL_KHM_CA24 KHM_CA24 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA27 KHM_CA27 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K122E, D123S, T165I, K173IT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
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  CA27W52R None NVP   V35T, T39K, K122E, D123S, T165I, K173IT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
NL_KHM_CA30 KHM_CA30 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA31 KHM_CA31 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
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NL_KHM_CA33 KHM_CA33 None None   V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA33W2R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA33W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA33W52R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
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  CA36W2R AZT NVP   V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA36W6R AZT NVP   V35T, T39E, K122E, D123ST, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA37 KHM_CA37 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA39 KHM_CA39 None None   E6D, V35T, T39N, E40D, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245K  
NL_KHM_CA42 KHM_CA42 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA42W2R AZT NVP   V35T, T39K, S68SR, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E Y127YH 
  CA42W6R AZT NVP   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA42W52R AZT NVP   T39K, K122E, D123S, R125RK, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238KR  
NL_KHM_CA43 KHM_CA43 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
NL_KHM_CA47 KHM_CA47 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, K173R, Q174KR, D177E, I178M, V179I, G196E, T200I, I202V, Q207A, V245E  
  CA47W2R AZT NVP   V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, K173R, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200I, I202V, Q207A, V245E  
  CA47W6R AZT NVP   V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165TI, K173R, Q174R, D177E, I178LM, V179I, T200I, I202V, Q207A, V245E  
  CA47W52R AZT NVP   V35T, T39E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, K173R, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200I, I202V, Q207A, V245E  
NL_KHM_CA48 KHM_CA48 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245A  
  CA48W2R AZT NVP  K101KE V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245A  
  CA48W6R AZT NVP   V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245A  
  CA48W52R AZT NVP   V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245A  
NL_KHM_CA50 KHM_CA50 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123NS, K173T, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA51 KHM_CA51 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, V245E  
NL_KHM_CA52 KHM_CA52 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211K, K238R, V245D  
NL_KHM_CA53 KHM_CA53 None None   E6D, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA53W2R AZT NVP V75VL Y181YC V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA53W6R AZT NVP V75VL Y181YC V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA55 KHM_CA55 None None V75VM  E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207E, R211S, K238R, V245E  
  CA55W2R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207A, K238R, V245E  
  CA55W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207A, K238R, V245E  
  CA55W52R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207A, K238R, V245E  
NL_KHM_CA56 KHM_CA56 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_CA59 KHM_CA59 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207R, R211S, K238R, V245E  
  CA59W2R AZT NVP   V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207R, R211S, K238R, V245E  
  CA59W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207R, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_CA6 KHM_CA6 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
  CA6W2R None NVP   V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
  CA6W6R None NVP   V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  CA6W52R None NVP   V35T, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
NL_KHM_CA60 KHM_CA60 None None   K11T, V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E  
  CA60W2R AZT NVP  Y181YC V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173AT, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E  
  CA60W6R AZT NVP  G190GA V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, I135T, I142IT, S162C, K173AT, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E  
  CA60W52R AZT NVP  G190GA V35T, T39N, K103KE, V106I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E  
NL_KHM_CA61 KHM_CA61 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
  CA61W2R AZT NVP  G190GA V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
  CA61W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43KE, V106I, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_CA8 KHM_CA8 None None   K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
  CA8W2R AZT NVP   V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
  CA8W6R AZT NVP   V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
  CA8W52R AZT NVP   V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245K  
NL_KHM_HM11 KHM_HM11 None None   E6D, K11S, V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_HM13 KHM_HM13 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207S, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_HM16 KHM_HM16 None None   E6D, K11T, V35IT, T39S, K64R, K122E, D123S, I135T, E138A, I142V, K173T, Q174K, D177G, I202IV, Q207A, R211S, V245E  
  HM16W2R None NVP   V35I, T39A, K64R, K122E, D123S, I135T, E138A, I142V, K173T, Q174K, D177G, I202IV, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_HM20 KHM_HM20 None None  V179D E6D, V35T, T39K, K43E, K166R, K173I, Q174K, D177E, G196GE, T200I, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_HM21 KHM_HM21 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, S162N, K173L, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207T, R211S, V245E, K249R  
NL_KHM_HM22 KHM_HM22 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, V245E  
NL_KHM_HM24 KHM_HM24 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, Q174R, D177E, I178M, Q207N, R211Q, V245E, K249R  
NL_KHM_HM29 KHM_HM29 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196R, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_HM30 KHM_HM30 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_HM6 KHM_HM6 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, K173I, Q174K, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245N, E248K E29G, H235L 
NL_KHM_HM7 KHM_HM7 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  HM7W2R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174KR, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  HM7W6R AZT NVP   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207AT, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_HM9 KHM_HM9 None None V75M  E6D, K11T, V35I, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_POP1 KHM_POP1 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64KR, K122E, D123S, I135M, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245D  
NL_KHM_POP2 KHM_POP2 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135KR, S162Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
NL_KHM_POP5 KHM_POP5 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135M, K173IT, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS1 KHM_SOS1 None None   E6D, K32R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS12 KHM_SOS12 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, E40D, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245D  
NL_KHM_SOS14 KHM_SOS14 None None  V108I K20R, V35T, T39K, K43E, K49KR, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS20 KHM_SOS20 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS3 KHM_SOS3 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS6 KHM_SOS6 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  SOS6W2R None NVP   V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162SC, T165I, K173IT, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
  SOS6W6R None NVP   V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162SC, T165TI, K173IT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NL_KHM_SOS9 KHM_SOS9 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173IM, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E