<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ndembi (2008)
Title Molecular characterization of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and HIV-2 in Yaounde, Cameroon: evidence of major drug resistance mutations in newly diagnosed patients infected with subtypes other than subtype B.
Citation J Clin Microbiol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 74
NumPts 74
Subtype CRF02_AG, G, F, A, D, H, CRF13_cpx, K, CRF11_cpx

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CMYD-1 04CMYD-1 None None   V35T, T39M, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173N, D177E, T200A, Q207E T107R 
CMYD-10 04CMYD-10 None None   V21I, V35T, K43R, V60I, V106I, D121Y, K122E, I135T, K166R, D177E, T200A, Q207A, R211K  
CMYD-11 04CMYD-11 None None   V35I, E40D, K49R, K122E, D123G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
CMYD-12 04CMYD-12 None None  V179E V35T, V60I, K122E, K173R, Q174K, D177E, T200A  
CMYD-13 04CMYD-13 None None  V179E V35T, V60I, K173R, Q174K, D177E, T200A, R211S, D218X  
CMYD-14 04CMYD-14 None None   V35T, E36D, T39L, K122E, D123S, I135T, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CMYD-15 04CMYD-15 None None   V35T, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L  
CMYD-16 04CMYD-16 None None  V179E V35T, V60I, K173R, Q174K, D177E, T200A, R211S, D218X  
CMYD-19 04CMYD-19 None None   E6N, V35T, E36D, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K  
CMYD-20 04CMYD-20 None None   I5V, K11Q, V35I, K122Q, I135L, I142V, S162A, K173S, Q174H, D177E, V179I, T200A, L205X, Q207A, L210X  
CMYD-21 04CMYD-21 None None   E6G, K11A, V35T, K49R, K104R, K122E, D123N, I135V, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S  
CMYD-22 04CMYD-22 None None   V21I, V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CMYD-23 04CMYD-23 None None   V35T, K104R, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K, K220X, P225X  
CMYD-24 04CMYD-24 None None   K11E, P14T, V35T, V60I, V106I, V118I, D121Y, K122E, I135T, E138A, S162C, R172K, E204K, Q207E, F214L, E224D  
CMYD-25 04CMYD-25 None None   V35R, E36D, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, E224D  
CMYD-27 04CMYD-27 None None   V35T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CMYD-29 04CMYD-29 None None   V35T, E36D, K104R, K122E, D123T, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, E224D  
CMYD-3 04CMYD-3 None None   K20R, V35T, V60I, V106I, K122E, D123N, T139S, S162C, D177E, I178L, E204K, R206K, F214L L205I, Q207E_K 
CMYD-30 04CMYD-30 None None   V35T, K49R, K122E, D123N, I135T, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, E224D  
CMYD-31 04CMYD-31 None None   K20R, V35T, E36A, V60I, K104R, D121Y, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, E224D  
CMYD-32 04CMYD-32 None None   S48E, D123E, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, E224D  
CMYD-33 04CMYD-33 None None   V35T, E36D, T39L, K122E, D123E, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D  
CMYD-34 04CMYD-34 None None   V21I, V35T, T39A, D121Y, K122E, K173L, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211Q, E224D  
CMYD-35 04CMYD-35 None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174E, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K, E224X L210Q 
CMYD-36 04CMYD-36 None None   I5V, E6D, K122E, D123N, I135T, I142V, S162C, K173T, Q174H, D177E, T200E, I202V, Q207K, R211K, E224D  
CMYD-38 04CMYD-38 None None   V35T, L109I, I142V, S162A, K173A, Q174K, T200A, E204D, Q207D  
CMYD-39 04CMYD-39 None None   P4H, V35T, E36N, T39K, K43M, K104R, K122E, D123G, I142V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211E, K220X  
CMYD-4 04CMYD-4 None None   V35T, E36D, T39S, I135V, S162A, Q174G, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CMYD-41 04CMYD-41 None None   P4T, V35T, K49R, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E  
CMYD-42 04CMYD-42 None None   K11T, V35T, T39K, D121Y, K122E, D123G, I135T, I142V, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S E224R, P226T 
CMYD-44 04CMYD-44 None None   P4H, K20R, V35T, E36D, T39L, K122P, I135V, S162A, Q174G, D177E, T200A, Q207D  
CMYD-45 04CMYD-45 None None   V35T, E36D, T39L, V90I, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
CMYD-47 04CMYD-47 None None   V35T, T39A, D123E, I135V, I142V, S162A, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211M  
CMYD-49 04CMYD-49 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207T, R211K, E224D  
CMYD-5 04CMYD-5 None None   E6Q, V35T, V60I, K102Q, K122E, D123S, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207D, R211K  
CMYD-50 04CMYD-50 None None   K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, K104R, D121H, K122E, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207R, R211E, E224D  
CMYD-51 04CMYD-51 None None   V35T, E36D, K49R, K104R, K122E, D123G, I135V, S162A, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K H221I, Q222R 
CMYD-52 04CMYD-52 None None   K11A, E28K, K32E, V35T, E36D, S48E, K49R, V60I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, E194D, G196E, Q207E  
CMYD-53 04CMYD-53 None None   V35T, E36A, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, E224D  
CMYD-55 04CMYD-55 None None   V35T, E36D, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q207E, K220X  
CMYD-56 04CMYD-56 None None   P4H, V35T, E40D, K49R, V60I, V118I, I135T, E138A, S162C, R172K, D177E, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207E, R211Q, F214L, K220X, E224X Q182S, H208R 
CMYD-57 04CMYD-57 None None   P4T, V35T, E40D, K49R, V60I, V118I, T139S, S162C, E169D, D177E, I178L, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, H221P, K223R Q222E 
CMYD-58 04CMYD-58 None None  V108I P4S, K11Q, V35L, D123N, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CMYD-6 04CMYD-6 None None   V35T, K49R, K104R, K122E, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177Q, T200A, Q207E, R211K, K220X  
CMYD-60 04CMYD-60 None None   V35T, V60I, K122Q, I135L, S162A, E169Q, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, K220X, E224X  
CMYD-61 04CMYD-61 None None   V35T, I135V, I142V, S162A, K173A, Q174K, T200A, E204D, Q207D, F214L, P217X  
CMYD-62 04CMYD-62 None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207R, R211K  
CMYD-63 04CMYD-63 None None   V35T, K49R, K102Q, K122E, D123N, I135V, E138A, S162C, K173T, D177K, T200E, I202V, Q207K, E224X  
CMYD-64 04CMYD-64 None None   V35T, D123E, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207E, K220X, E224D  
CMYD-65 04CMYD-65 None None   V35T, E36D, T39S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E Q222QH 
CMYD-66 04CMYD-66 None None   V35T, K122P, I142V, S162C, K173A, Q174K, I178L, Q207G, R211K, T216X, K220X, E224D  
CMYD-67 04CMYD-67 None None   K11Q, V35T, E36D, V60I, I135V, E138A, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, E224X  
CMYD-69 04CMYD-69 None None   V35T, L109I, I142V, S162A, K173A, Q174K, T200A, E204D, Q207X, L210X  
CMYD-7 04CMYD-7 None None   V35T, T39S, D121X, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CMYD-70 04CMYD-70 None None   V21I, V35T, T39A, K43Q, K46Q, V60I, K102R, V106I, K122E, I135T, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, P217X Q222R 
CMYD-71 04CMYD-71 None None   V35T, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q207E, R211K, K220X, E224D  
CMYD-72 04CMYD-72 None None   P4S, K20R, V35T, E36D, T39N, V60I, K122Q, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D Q222T 
CMYD-73 04CMYD-73 None None   V35T, D123E, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E  
CMYD-77 04CMYD-77 None None   V35T, V60I, K104R, K122E, D123S, I135V, I142T, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, T215X, T216X, E224D  
CMYD-78 04CMYD-78 None None   V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, E224D  
CMYD-79 04CMYD-79 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, K101Q, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D  
CMYD-8 04CMYD-8 None None   V35T, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, F214L  
CMYD-80 04CMYD-80 None None   V35T, E36D, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, T215X, K220X, E224D  
CMYD-81 04CMYD-81 None None   P4S, V21I, V35T, E36D, T39K, V60I, K122Q, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, T215X, E224D  
CMYD-82 04CMYD-82 None None   V35T, E36D, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, E224D G15A 
CMYD-83 04CMYD-83 None None   E6K, V35T, E42K, E44K, G45E, R83K, K103R, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, D192N, T200A, R206K, Q207E, R211K  
CMYD-86 04CMYD-86 None None   V35T, E36D, T39L, K102R, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, K220X  
CMYD-89 04CMYD-89 None None   V35T, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, E224D K220N 
CMYD-9 04CMYD-9 None None   K11T, V35T, K122E, D123N, K173S, V179I, Q207A, R211K  
CMYD-90 04CMYD-90 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, S163T, K173T, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211T, E224D  
CMYD-92 04CMYD-92 None None   V35T, T39M, D123E, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211K  
CMYD-93 04CMYD-93 None None  Y181C V35T, T39E, S48E, D123E, I135V, K173A, D177E, I178L, T200E, I202V, Q207K, R211T, K220X, E224D  
CMYD-95 04CMYD-95 None None   V35T, V60I, K122A, D123S, I135V, S162A, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K, K220X  
CMYD-96 04CMYD-96 None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K104R, K122E, D123S, I135T, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178V, T200A, Q207A, R211K  

Database

Resources

Team