Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Razafindratsimandresy (2007)
Title HIV type 1 diversity in the Seychelles.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 42
NumPts 42
Subtype A, C, B, CRF02_AG, D, CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1 1HIV-SEY None None K70KE  E6D, K11HR, K49KR, A98S, I135T, S162C, D177E, Q207AT, R211K  
10 10HIV-SEY None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123N, A158S, K173T, D177E, I178V, T200E, E204Q, Q207E, L210S, V245Q, E248D  
11 11HIV-SEY None None   K11R, V21I, V35T, T39A, E40D, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211RS, V245Q, E248D  
12 12HIV-SEY None None   K11Q, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248N T128TI 
13 13HIV-SEY None None   K11Q, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248N  
14 14HIV-SEY None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39G, E53D, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200K, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
15 15HIV-SEY None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, T139A, I178M, T200A, E204D, Q207E, R211K, V245K, D250E  
16 16HIV-SEY None None   I142V, S162C  
17 17HIV-SEY None None   E6K, K11N, V21I, V35T, K122E, D123N, K173AS, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
18 18HIV-SEY None None   V35T, K122E, D123N, A158S, S162SAGT, T165TI, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211DHN  
19 19HIV-SEY None None   V21I, V35T, K122E, D123NS, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N  
2 2HIV-SEY None None   K11Q, V21VI, V35T, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
20 20HIV-SEY None None   E6K, K11T, K20R, V21I, V35T, K122E, D123N, K173A, D177E, I202V, E204K, Q207A, R211S, V245Q, E248S  
21 21HIV-SEY None None   K11Q, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248N  
23 23HIV-SEY None None   V35I, E44D, R83K, V118I, D121Y, K122E, D123DE, I135T, T139A, R211K, F214L, D250E  
24 24HIV-SEY None None   V35T, K122E, D123N, S162SDGN, K166KQ, E169D, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N  
25 25HIV-SEY None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, D123N, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
26 26HIV-SEY None None   K32R, V35I, V60I, R83K, I142IV, P243H, V245E  
27 27HIV-SEY None None   K20R, K32R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, T165I, K173A, G196K, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
28 28HIV-SEY None None   V35T, V90I, I135V, S162A, F171FL, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, H208Y, R211K I180IT 
29 29HIV-SEY None None   V21I, V35T, K122E, D123N, A158S, T165I, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
3 3HIV-SEY None None   K32R, V35I, V60I, R83K  
30 30HIV-SEY None None   K20R, V35T, T39E, S48T, D123E, I159IV, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
31 31HIV-SEY None None   V35T, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K, V245Q  
32 32HIV-SEY None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123NS, I135T, S162A, T165I, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
33 33HIV-SEY None None   V35T, K49R, K122E, K173S, D177E, V179I, Q207ADNT, R211RS, V245M  
34 34HIV-SEY None None   V35I, K64R, I135IT, G196E, Q207E, V245T  
35 35HIV-SEY None None   V35I, K64R, D123DN, I135T, G196E, R199RK, Q207E, V245T R72RK, D185DN 
36 36HIV-SEY None None  A98G V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211T, F214L, V245Q, E248N  
37 37HIV-SEY None None  A98G V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211T, F214L, V245Q, E248N  
38 38HIV-SEY None None   V35T, T39K, K43R, S48T, K122E, D123S, I135V, S162C, K173A, D177E, T200A, V245M, D250E  
39 39HIV-SEY None None   V21I, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N  
4 4HIV-SEY None None   V35T, E36A, T39D, K43KR, S48T, V60I, K122E, D123DGNS, I142K, T165I, K166R, K173A, N175H, D177EG, I178IM, G196E, T200A, Q207A, R211K, V245K  
40 40HIV-SEY None None   V35T, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177E, V179VI, T200A, I202IV, Q207A, R211S, V245Q, E248D, D250E H96HP 
41 41HIV-SEY None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123NS, I135V, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211RAGT, V245M, D250E I159IT 
42 42HIV-SEY None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245K Q145R 
43 43HIV-SEY None None   M16V, V21I, V35T, E36ED, V60I, R83K, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
5 5HIV-SEY None None   E169K, K173E, R211RK, V245I  
6 6HIV-SEY None None   V21I, V35I, V60I, R83K, V245T  
7 7HIV-SEY None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123G, I142K, T165I, K166R, K173A, N175H, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211K, V245K  
8 8HIV-SEY None None   K20R, V35T, T39TA, E40ED, V60I, K104KR, K122E, D123N, I135IT, T165TI, K173LS, Q174K, D177E, V179VI, T200TI, Q207A, R211S, V245E, D250E  
9 9HIV-SEY None None  K103N V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, T165I, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E  

Database

Resources

Team