Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

Home Genotype-RX Genotype-Pheno Genotype-Clinical HIVdb Program

References

Author Shafer (2003)
Title Comparison of four-drug regimens and pairs of sequential three-drug regimens as initial therapy for HIV-1 infection
Citation N Engl J Med
SelectedGene RT
SelectedType Clinical
NumIsolates 1261

Pages  1 
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1261 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A384_0242 0242a None None   D123ED, I142V, D177ED, G196E, R211QK, F214L  
A384_0243 0243a None None   S68GS, A98S, K166R, D177N, G196E, R211K, V245E  
A384_0244 0244a None None   A158S, I202V, Q207E, F214L, V245K  
A384_0245 0245a None None   A98S, K122P, D177E, I178ML, T200ST, Q207EQ, R211KR, F214LF, P243S I37VX 
  0245b D4T, DDI EFV   A98S, K122PA, D177E, I178ML, T200ST, Q207EQ, R211KR, P243S I37VX 
A384_0246 0246a None None   T39E, E40D, D121YH, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, V245Q  
A384_0247 0247a None None   A98SA, E169D, G196EG, I202V, E204D, R211KR I37VX 
A384_0248 0248a None None   D121HD, K122E, D123S, R172KR, Q174KE, D177E, I178MIL, Q207A, R211S, K238R, V245E K173MI 
A384_0250 0250a None None V118IV  R83K, D121HD, K122E, S162C, V179DV, G196E, R211G  
A384_0251 0251a None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173VA, D177E, I178MI, T200A, I202VI, Q207E, V245Q H96NH 
A384_0253 0253a None None D67N, K219Q  T39A, V60IV, D121H, K122E, I178L, V179I, Q207E, V245I  
A384_0255 0255a None None  V90I K173EK, I178MI, Q207E, R211K I37VX 
  0255b D4T, DDI, 3TC, AZT EFV M184V V90I, K103N I135L, I178M, Q207E, R211K  
  0255c D4T, DDI, 3TC, AZT EFV M184VIM V90IV, K101QK, K103NK K122EK, I135LI, R172KR, I178MI, Q207EQ, R211KR, F214LF I37VX, H208RH 
A384_0259 0259a None None   K64R, K122E, D123E, I135T, I178M, G196E, I244V  
A384_0261 0261a None None   T39AT, K122E, I135T, I142T, T165I, I178L, R211KR, F214L, V245E D121YCHR 
A384_0267 0267a None None   A98S, D123E, S162NS, R211G, V245EV  
A384_0301 0301a None None   D123N, I135T, I142V, K166R, D177E, Q197K, V245E  
A384_0302 0302a None None   K104RK, D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, V245M I37VX, T200RAGT 
  0302b AZT, 3TC, D4T, DDI EFV M184V  D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, T200R, V245M I37VX, G112VG, I167MI, Y183HY, L205ML 
  0302c AZT, 3TC, D4T, DDI EFV  K103N, Y188CY D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, T200R, L228RL, V245M I37VX 
A384_0303 0303a None None   V60I, K122E, I142V, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K, V245N  
A384_0304 0304a None None   T39E, S48T, K122E, D123SG, I142TI, A158SA, K166R, K173A, Q174KQ, D177E, V189IV, G196RK, T200A, I202V, Q207GE, R211K, V245Q  
A384_0305 0305a None None   K49R, V60I, R83K, I135T, R211KR  
  0305b AZT, 3TC None M184V  K49R, V60I, R83K, I135T, R211KR  
A384_0306 0306a None None   V60I, G196E, Q207G, R211K, V245KE  
A384_0307 0307a None None   K49R, K122E, I135T, E169D, I202V, R211K, V245M D110ND, V111LV 
A384_0308 0308a AZT, D4T, 3TC, Unknown Unknown  V108I S48T, K122Q, T139A, I142T, S162A, D177G, V179I, R211K I37VX, H235YH 
  0308b AZT, D4T, 3TC, Unknown, DDI Unknown, EFV M184V K103N, V108I S48T, K122Q, I135L, T139A, I142T, S162A, D177G, V179I, R211K I37VX 
A384_0309 0309a None None   K104RK, I142V, R211K I37VX 
A384_0328 0328a None None   T39A, V60I, D123G, I132V, T200A, Q207E, R211K  
A384_0606 0606a None None   V35M, K49R, R83K, E169D, R211K, V245E, D250E, A288T E248T, K281QX 
A384_0608 0608a None None   V60IV, S162CS, D177ED, I178LI, I195LI, T200IT, R211TK, L228RL S48Q, I50VX, V245QX 
  0608b AZT, 3TC EFV   V60I, I135L, T200I, R211T R143KR 
A384_0621 0621a None None   K64R, I135R, E169D, D177E, G196RG, T200A, K201R, I202V, E204KE, R211K, F214L, V245T  
A384_0623 0623a None None   D123E, I142V, S162C, I195LI, G196E, T200I E194QHKN 
  0623b AZT, 3TC None V118IV, M184V, T215ST  V60IV, S68GS, R83KR, K102QK, K122EK, D123ED, I135TI, E138AE, S162C, G196EG, T200I E194ND 
A384_0625 0625a None None   I135R, E169D, D177E, T200A, K201R, I202V, R211K, F214L, V245T  
A384_0963 0963a None None T69N  K102QK, V106IV, I135VI, S162C, Q174H, D177ED, I202V, E203Q, R211K, V245QELV I37VX 
  0963b D4T, DDI, Unknown Unknown T69NT L100IL, Y188HY K102QK, V106IV, I135VI, S162C, Q174H, I202V, E203Q, R211K, V245QL I37VX 
A384_0964 0964a None None   D86E, K173E, I202V, R211K, V245EV T200GE 
A384_0965 0965a None None   R83K, K122E, I178M, R211K, V245E  
A384_0966 0966a None None V118I  D121C, K122E, S162CS, T165I, K173NK, Q174KQ, D177E, G196E, Q207E, F214L I37VX 
  0966b AZT, 3TC EFV V118I K103N D121C, K122E, D123ED, T165I, K173N, Q174KQ, D177E, G196E, Q207E, R211KR, F214L I37VX, I63KI 
A384_0968 0968a None None   I142T, I178L, Q207E, H208YH, R211KR, V245M  
A384_0969 0969a None None M41L, T215E  T39A, V60I, R83K, K122EK, V245E D123NDEK 
A384_0973 0973a None None   T39K, K43E, A98S, K122E, E169KE, K173A, Q174KQ, D177E, I178LI, T200A, Q207E, R211KR, V245Q  
  0973b D4T, DDI, Unknown, ABC EFV, Unknown, NVP   T39K, K43E, A98S, K122E, E169KE, K173A, Q174KQ, D177E, I178LI, T200A, Q207E, V245Q  
A384_0977 0977a None None   K122EK  
A384_0978 0978a None None   K122EK, D123ND, V189IV, V245M V111LV, G196Q 
A384_0983 0983a None None E44D  T39AT, V60I, D121H, K122E, D123S, I135TI, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211NK, F214LF  
  0983b AZT, 3TC None E44D, M184V  T39A, V60I, D121H, K122E, D123S, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K  
A384_1175 1175a None None   V60I, R83K, S162H, T200A, Q207E, A272P, K277R, T286A, E297K  
  1175b AZT, 3TC EFV  K103NK V60IV, R83K, S162H, T200A, Q207E, A272P  
A384_1205 1205a None None   A98S, V245I  
A384_1208 1208a None None  V90MIV R83K, S162C, G196E, Q197HQ, T200IT, Q207RQ, R211SR  
A384_1227 1227a None None   K173N, R211K  
A384_1381 1381a None None   V60I, R83K, K122EK, I135V, S162C, V245E  
A384_1382 1382a None None   K102RK, V179IV, T200AT, Q207E, R211K  
A384_1383 1383a None None   R83K, D123E, I135T, G196E, T200KT P170SP 
  1383b D4T, DDI EFV   R83K, D123E, I135T, G196E, T200K  
A384_1384 1384a None None   K173N, F214L, V245E I37VX 
  1384b D4T, DDI None V118IV  K173N, Q174KQ, T200IT, F214L, V245E I37VX 
A384_1386 1386a None None   R83K, K122EK, D123E, D177E, R211KR  
A384_1387 1387a None None   G196EG, V245MV  
A384_1388 1388a None None   F171Y, D177E, R211K, V245Q D123A 
  1388b AZT, 3TC EFV  K103N F171Y, D177E, R211K, V245Q I37VX, D123A 
  1388c AZT, 3TC, D4T, DDI EFV   F171Y, D177E, R211K, V245Q I37VX, D123A 
A384_1389 1389a None None   R83KR, D123ED, K166IK, D177ED, T200AT, I202VI, R211KR, V245MV  
A384_1390 1390a None None   K122EK, I142VI, E169DE, Q174HQ, T200A, P243SP, I244V, V245KE  
A384_1391 1391a None None   V60I, K122E, F171YF, G196E, T200A, Q207RQ, V245E I37VX, D177NDEK 
  1391b AZT, 3TC None M184VM  V60I, K122EK, D177ED, G196E, T200A, Q207RQ, V245E I37VX 
A384_1392 1392a None None   R83K, I178M  
A384_1394 1394a None None   R83K, K122EK, S162Y, R211K K223IK 
A384_1396 1396a None None   R83K, I135T, T165I, I178L, G196E, R211G  
A384_1398 1398a None None   R83KR, D123E, D177ED, I178LI, R211K, V245M I37VX 
  1398b D4T, DDI EFV  K103N V35I, R83K, D123E, I178L, R211K  
  1398c D4T, DDI EFV  K103N, V108IV, P225HP R83K, D123E, I178L, R211K, H221YH, V245M I37VX 
  1398d D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K103N, P225HP R83K, D123E, I178L, R211K, H221YH, V245M  
  1398e D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K103N, P225HP R83K, D123E, I178L, R211K, V245M D113ND 
A384_1399 1399a None None  K103R I135T, E138A, I178M, G196E, R211K, F214L E224GE 
A384_1404 1404a None None   E79DE, R83K, T200A, R211K, V245I E40KE, S48PS 
A384_1406 1406a None None   A98S, D121H, K122E, D177E, Q207HQ, R211K  
  1406b D4T, DDI EFV  K101EK A98S, D121H, K122E, D177E, Q207HQ, R211K  
  1406c D4T, DDI, AZT, 3TC EFV M184V K101E, G190A A98S, D121H, K122E, E169AE, D177E, Q207H, R211K S134GS 
A384_1411 1411a None None   S68G, D123E, K166R, Q174H, G196E, T200A, V245MV  
A384_3098 3098a None None L210F  R83K, I135TI, E169D, G196E, T200VI  
A384_3519 3519a None None   V60IV, K166RK, D177E, T200A, I202V I37VX, K122S 
  3519b AZT, 3TC None M184V  V60I, D177E, T200A, I202V, Q207E I37VX 
A384_3521 3521a None None   A98S, K122EK, D123ND, I135T  
A384_3522 3522a None None   R83K, D123E, I135T, R211K I37VX 
  3522b D4T, DDI, 3TC EFV   R83K, D123E, I135T, R211K I37VX 
A384_3524 3524a None None L210F  V60I, A98S, K122E, D123N, D177E, R211K, V245K  
A384_3525 3525a None None   K122E, I135T, T200I, R211K  
A384_3526 3526a None None   I135T, K166R, K173EK, I178MI  
A384_3527 3527a None None   S68G, K166R, I178M, R211K I37VX, K223RK 
  3527b AZT, 3TC EFV  V90IV, K103N, V108IV S68G, K166R, I178M, T200IT, R211K I37VX 
A384_3530 3530a None None   S48T, K49RK, V60I, R83K, K122EK, D123E, T200AT, R211KR, P243H, V245E  
A384_8151 8151a None None   K49R, E53D, S162C, Q174H, I178M  

The Team

The Data