Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

Home Genotype-RX Genotype-Pheno Genotype-Clinical HIVdb Program

References

Author Shafer (2003)
Title Comparison of four-drug regimens and pairs of sequential three-drug regimens as initial therapy for HIV-1 infection
Citation N Engl J Med
SelectedGene PR
SelectedType Clinical
NumIsolates 1261

Pages  1 
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1261 Clinical PR Isolates

SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
A384_0242 0242a None   L33I N37S, L63P, L89M, I93L  
A384_0243 0243a None    N37S, I62V, L63T, I64L, V77I, I93LI  
A384_0244 0244a None    T12S, L19Q, M36I, R41K, D60E, I62V, L63P  
A384_0245 0245a None    L63PL, I64LI, I72VE, V77I, I93L  
  0245b NFV 6   L63PL, I64LI, I72VE, V77I, I93L  
A384_0246 0246a None    T12S, I15V, L19I, K20R, M36I, N37K, R41N, H69K, L89M, I93L  
A384_0247 0247a None   A71T I15VI, R41K, Q61E, I62V, I72TI, V77IV, V82I, I93L  
A384_0248 0248a None    I13V, M36I, R41K, I62VI, L63PL, C67YC, H69K, L89M, F99LF  
A384_0250 0250a None    N37S, L63S, I64V  
A384_0251 0251a None    T12S, I15VI, L19I, M36I, R41K, L63TILP, H69K, L89ML, I93L  
A384_0253 0253a None    R41K, K70R  
A384_0255 0255a None    D60E, Q61E, I62V, L63P, T74K, V77I, I93L  
  0255b NFV 89  L10F D60E, Q61E, I62V, L63P, T74K, V77I, I93L  
  0255c NFV 89   N37SN, D60ED, Q61EQ, I62VI, L63PL, T74KT, V77IV, I93LI  
A384_0259 0259a None    T12KT, R41K, L63A  
A384_0261 0261a None    T12Q, L19Q, R57K, L63PA  
A384_0267 0267a None    I64VI, V77IV, I93L  
A384_0301 0301a None    I13V, R41KR, D60E, L63P, I72E  
A384_0302 0302a None    I15V, L19V L63X 
  0302b NFV 50 L90ML  I15V, L19V L63SX 
  0302c NFV 50   I15V, L19V, L63S  
A384_0303 0303a None    I13V, R41K, L63P, I64VI, H69Y, I72VI  
A384_0304 0304a None    T12AT, I15V, G16E, M36I, R41K, K43RK, L63QH, H69K, L89M, I93L  
A384_0305 0305a None    L19Q, N37C, I62V, I64V, I93L  
  0305b NFV 15   L19Q, N37C, I62V, I64V, I93L  
A384_0306 0306a None    I15V, N37S, R41K, L63P, C67Y  
A384_0307 0307a None   L10V T12I, I13V, Q18H, L63P  
A384_0308 0308a Unknown    K20R, L33V, L63Q, I64V  
  0308b Unknown    K20R, L33V, L63Q, I64V  
A384_0309 0309a None    N37S, I62V, L63S, V77I  
A384_0328 0328a None    M36VM, N37D, L63P, I93L  
A384_0606 0606a None    L63P, I64V  
A384_0608 0608a None  N88DN L10I T12ST, I13VI, I15VI, M36IM, N37TN, I64V, V77IV, I93LI  
  0608b NFV 172  L10I I13V, I15V, M36I, I64V, I93L D25ND 
A384_0621 0621a None    I15V, E35D, N37I, R41K  
A384_0623 0623a None    M36IM, I64V  
  0623b NFV 68   M36I, I64V  
A384_0625 0625a None    K14R, I15V, E35D, N37I, R41K, R57KR, I62VI  
A384_0963 0963a None    K43RK, D60E, L63P  
  0963b NFV, Unknown 17   K43RK, D60E, L63P  
A384_0964 0964a None    N37S, I62V, L63P, I64L, H69Q, V77I  
A384_0965 0965a None    I15V, M36I, I62V, L63S, H69Q  
A384_0966 0966a None    L19IL, R41K, L63P, I64L, K70R, V77I  
  0966b NFV 4 I84VX  L19IL, R41K, L63P, I64L, K70R, V77I  
A384_0968 0968a None   L10I I13V, E35DE, N37SN, D60E, Q61E, L63P, I64VI, I93L  
A384_0969 0969a None    L33VL, E35D, R41KR, I64V  
A384_0973 0973a None    I15V, L19M, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M, I93L  
  0973b Unknown, RTV, IDV 5   I15V, L19TIM, M36I, R41K, H69K, K70RK, V82I, L89M, I93L  
A384_0977 0977a None   A71TA N37D, R57K, L63P, H69YH, I72TI, V77IV  
A384_0978 0978a None    I15VI, L63T, V77IV, I93L  
A384_0983 0983a None   L10VL I13V, K14RK, I15VI, E35D, M36I, R41K, R57KR, H69K, L89M R8PR 
  0983b NFV 43  L10V I13V, K20T, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M, I93M  
A384_1175 1175a None    E35D, L63P, K70R  
  1175b NFV 109   W6LW, E35D, L63P, H69QH, K70R T4AT, L5PL, Q7RQ 
A384_1205 1205a None   L10I I13V, K20RK, D60E, I64V, V77I, I85VI  
A384_1208 1208a None    N37TA, I64V, I93L  
A384_1227 1227a None    L63P, I72E, V77I K70I 
A384_1381 1381a None    L19I, R57KR  
A384_1382 1382a None    I15VI, L63PA  
A384_1383 1383a None    M36L, N37K, R41K, I64V  
  1383b NFV 167   M36L, N37K, R41K, I64V W6RW 
A384_1384 1384a None   M46T N37D, R41K, K55RK, I64V, V77IV, I93L  
  1384b NFV 80  M46T N37DN, R41K, K55RK, I64V, V77IV, I93L  
A384_1386 1386a None    I13V, M36IM, N37D, K43RK, L63P  
A384_1387 1387a None    N37D, L63T  
A384_1388 1388a None    T12AT, K14RK, I15VI, L63P, H69Q, V77I  
  1388b None   A71TA T12AT, L63P, H69Q, V77I N98I 
  1388c NFV 34  A71TA T12A, L63P, H69Q, V77I  
A384_1389 1389a None    E35DE, M36IM, N37DN, R57KR, L63VA, I64MI  
A384_1390 1390a None    L63PL, K70R, V77I  
A384_1391 1391a None    L63P, C67S  
  1391b NFV 79   L63SP, C67SC  
A384_1392 1392a None    I15V, R57K  
A384_1394 1394a None    I15V, L19V, K70R  
A384_1396 1396a None   L10VF L19I, R41KR, D60E, I62V, L63P, K70RK, I72T, P79S  
A384_1398 1398a None    D60ED, Q61EQ, L63PA, I64LI, I72VI, V77IV  
  1398b None    D60E, Q61E, L63P, I64L, V77I  
  1398c None    D60E, Q61E, L63P, I64L, V77I G17VG 
  1398d NFV 12   D60E, Q61E, L63P, I64L, I72VI, V77IV  
  1398e NFV 22   D60E, Q61E, L63P, I64L, V77I  
A384_1399 1399a None    I15V, G16EG, R41K, R57K, D60E, I64V, I72V, I93L L63TN 
A384_1404 1404a None    I13V, E35D, L63P, I64M  
A384_1406 1406a None    N37DN, R41KR, L63P, V77I, I93L  
  1406b None    N37DN, R41KR, R57KR, L63P, V77I, I93L  
  1406c NFV 20   R57K, L63P, V77IV, I93L  
A384_1411 1411a None    I13V, N37S, L63P  
A384_3098 3098a None    E35D, L63P  
A384_3519 3519a None    I13V, E35DE, N37YCNS, L63P  
  3519b NFV 19  A71TA I13V, N37S, L63P, V77I  
A384_3521 3521a None    I13VI, L19Q, M36I, D60E, L63TP, I64V K14T 
A384_3522 3522a None    T12E, K70R, I72M, V77I  
  3522b NFV 62 I84VI  T12E, N37TS, K70R, I72M, V77IV L63SFLP 
A384_3524 3524a None   A71T I15V, N37S, L63P, V77I W42Y 
A384_3525 3525a None    K14R, I15V, E35D, N37S, R41K, R57KR, L63PL, I64V  
A384_3526 3526a None    I13V, R41K, L63P, K70R  
A384_3527 3527a None    M36I, N37SN, R41K, K70R  
  3527b None    M36I, N37SN, R41K, K70R  
A384_3530 3530a None    T12E, L19TI, M36I, L63PL  
A384_8151 8151a None    I13V, N37D, L63P, C67S  

The Team

The Data