<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Toni (2007)
Title HIV-1 antiretroviral drug resistance in recently infected patients in Abidjan, Cote d'Ivoire: a 4-year survey, 2002-2006.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 87
NumPts 87
Subtype CRF02_AG, A, G, CRF06_cpx, CRF09_cpx

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
pci160 pci160 None None   K20R, V35T, E36D, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K  
pci161 pci161 None None   P4R, I5N, V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, K238KR, P243T, V245Q, D250E  
pci162 pci162 None None   I5M, V35T, V60I, K122E, D123T, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E204D, Q207G, R211K, F214FS, V241I, V245Q  
pci163 pci163 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I142IT, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, E248D  
pci164 pci164 None None   V35A, E36D, T39M, V90I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E P225PL, V245Y 
pci165 pci165 None None V75VI  E28EK, V35T, T39A, I135V, S162A, F171Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247A, E248D T27TK 
pci166 pci166 None None   I5N, V35T, E36D, V90I, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
pci167 pci167 None None   V35T, E36N, V60I, I135V, E138A, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245Q  
pci168 pci168 None None   I2N, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, K173L, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245E, N255H  
pci169 pci169 None None   V35T, E36D, T39A, K122E, I135V, I142V, S162A, Q174AEKT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
pci170 pci170 None None   E6N, K11T, V35T, K122E, D123N, I135T, I142V, S162Y, K173LS, V179I, I202V, Q207D, R211K, V245Q, S251G  
pci171 pci171 None None   I2N, I5N, V21I, V35T, E40A, K43N, K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
pci172 pci172 None None   E28EK, V35T, E36DN, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245M E29EK 
pci174 pci174 None None   K11E, T27S, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, K173S, P176PS, D177E, I178M, T200A, Q207A, V245Q G45GR, E89G, N136NK, L234LH 
pci175 pci175 None None K219KQ  K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, I142V, S162H, K173S, D177E, V179I, G196K, T200A, I202V, Q207A, L228LF, V245Q  
pci177 pci177 None None   V35T, I50V, V60I, K102KE, I135M, S162A, K173A, D177E, I178M, V189VI, T200A, Q207E, R211K, L228LF, V245Q, E248D P150PS, T216TI 
pci178 pci178 None None  V179E V35T, E40D, V60I, L100F, D121DN, K122PS, I135K, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, L210LF, V245Q  
pci179 pci179 None None   F124FL, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207A, R211K, P243A, V245Q P140PT, I142IN 
pci180 pci180 None None Y115YF  E6R, K20R, E28EK, V35T, I50IM, K66X, K122E, D123N, A158S, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203EA, L205F, Q207E, P243T, V245Q K30KE, N137NY 
pci181 pci181 None None   V35A, V60I, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, L228LF, E233EG, V245Q L210LP 
pci182 pci182 None None   K32N, V35T, E36A, K122E, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207E, V245Q N147NH 
pci183 pci183 None None   V35T, E36A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q D113DN, L149LP 
pci184 pci184 None None   V35T, K43KR, S117P, K122E, D123T, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, L210LF, V245Q, E248G P25PA, L26LV, P52L, E53K, G141GR 
pci185 pci185 None None   V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, K122E, I135V, E138A, S162A, K173I, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245Q Q145P 
pci186 pci186 None None   V35PT, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200AV, Q207KR, R211Q, K223KR K30KE, A33AP 
pci187 pci187 None None   V35T, E36D, P119S, D123E, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207G, R211Q, F214L, V245Q F124I 
pci188 pci188 None None   V35T, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
pci189 pci189 None None F116FY  V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, I135V, S162A, E169D, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
pci193 pci193 None None   V35I, E36D, T39A, K49R, V60I, F124L, R125RG, I132V, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, V179I, Q197K, T200A, Q207E, R211K, V245Q Q91QP, P140PQ 
pci194 pci194 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, L246V  
pci195 pci195 None None   V35T, E40X, K49R, I135AV, S162A, K173I, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243H K30KE 
pci196 pci196 None None   V21I, V35T, T39TA, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179VI, T200A, R211K  
pci197 pci197 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, D121H, K122E, I142V, K173S, D177E, Q207D  
pci198 pci198 None None  K101E, E138K V35T, E36D, I50M, I135V, S162A, K173T, Q174N, V179A, T200A, E203D, Q207R, R211E K30KE 
pci199 pci199 None None   V35T, T39M, D123E, I135V, S162A, F171Y, K173IT, Q174K, D177E, T200V, Q207N, R211K  
pci200 pci200 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, I135T, I142V, S162Y, K173T, Q174K, D177E, Q207A  
pci201 pci201 None None   T39A, D123N, I135T, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, F214L, V245Q, L246V, E248T  
pci202 pci202 None None   V35T, D123N, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211G K201E 
pci203 pci203 None None   V35T, E36D, K43KN, V60I, K64R, V90VI, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
pci204 pci204 None None   V21I, V35K, E36D, T39S, V60I, I142V, S162A, K173R, Q174T, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q  
pci206 pci206 None None   V35T, V90I, I135V, S162A, T165I, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V241VI, V245Q K30KE 
pci207 pci207 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K102KQ, V118I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L K30KE 
pci208 pci208 None None   V35T, E36D, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211S, V245Q K13E 
pci209 pci209 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, K238X  
pci211 pci211 None None   V35T, E36D, V60I, I135IL, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
pci212 pci212 None None   V35T, E36D, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
pci213 pci213 None None   V35R, E36D, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211RT, P243S, V245Q  
pci214 pci214 None None   K20R, V35IT, E36D, E40ED, V60I, K102Q, I135V, E138A, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207D, R211K, P243T, V245Q  
pci215 pci215 None None   V35T, E36D, K64R, D86E, V90I, D121H, K122E, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207DE K30E 
pci218 pci218 None None   V35T, D123E, S162A, K173T, Q174T, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, K238R, P243T, V245Q K122L 
pci219 pci219 None None   V35T, E36D, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K W229WG 
pci220 pci220 None None   V35T, E40D, V60I, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K  
pci221 pci221 None None   V35T, E36D, T39R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174G, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211T, F214FL, P243T  
pci223 pci223 None None   V35T, E36D, V60I, K104R, D121Y, K122E, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214FS K30E, F116FL 
pci224 pci224 None None   K22N, E28G, V35T, E40D, V60I, K122E, I135V, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K K13R, M16W, D17M, K20G, E29G, K30G 
pci225 pci225 None None   V8G, V35T, E36D, K43R, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207AT, R211K K20N, Q23L 
pci227 pci227 None None   V35T, E36D, S48T, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E K30E 
pci228 pci228 None None   V35T, V60I, D123E, I135V, I159V, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, P243A  
pci229 pci229 None None  K103N V35T, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, E233X K30KE 
pci230 pci230 None None   V35T, K49KR, V60I, K122E, D123NS, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q K30E 
pci231 pci231 None None   V35K, V60I, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
pci232 pci232 None None   V35K, I135V, S162A, E169EQ, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243S  
pci233 pci233 None None   V35T, S134SC, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q K30KE 
pci234 pci234 None None   V35T, E36D, V60I, K122P, S162A, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K G15R, K30E 
pci235 pci235 None None   V35T, E36D, T39M, V90VI, K122E, D123NS, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E K30KE 
pci237 pci237 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, D123N, I142V, S162Y, D177E, V179I, Q207A  
pci238 pci238 None None   V35T, S68G, K122E, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
pci239 pci239 None None   V35T, E36D, V60I, K102R, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245E  
pci240 pci240 None None   V35T, E36D, E40D, V60I, I135V, S162A, K173N, D177E, T200E, Q207K, R211Q, V245K  
pci241 pci241 None None M41L K238N V35K, T39A, V60I, I135R, S162SC, K173MT, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K K30KE 
pci244 pci244 None None   V35K, E36D, T39A, I135V, I142T, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245Q  
pci245 pci245 None None   K11T, V35T, E36D, D121H, K122E, D123N, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D  
pci246 pci246 None None   K20R, V35T, E36D, T39TA, V60I, F87L, D123DE, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
pci247 pci247 None None   V35T, K49R, I50IV, V60I, K104R, D121H, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245Q  
pci250 pci250 None None   K20R, V35T, E36D, K82R, K122E, I135V, S162C, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207N, R211K  
pci251 pci251 None None   V35T, T39A, I135T, S162A, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L  
pci252 pci252 None None   I5X, V35T, T39A, E40D, D123E, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245S  
pci253 pci253 None None   V35T, T39A, E40D, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174N, N175H, D177E, T200A, Q207A, R211K, I244V, V245K, E248D  
pci254 pci254 None None   V35T, E36EA, V60I, S68G, D123E, I135IV, S162A, Q174T, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q E53K, N81K 
pci257 pci257 None None   V35T, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245E  
pci258 pci258 None None   V35T, E36D, T39S, K49R, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, V245Q  
pci259 pci259 None None   V21I, V35I, E36D, T39A, E40D, K122P, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E  
pci260 pci260 None None   V35T, E36D, T39S, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245L  
pci261 pci261 None None   V35T, S48E, K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
pci262 pci262 None None   V35T, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245K  
pci263 pci263 None None   K32R, V35IT, E40ED, V60I, V106I, A158S, Q174K, I178M, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
pci264 pci264 None None   V35T, T39E, K102R, I135V, E138A, S162T, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211K, V245N  

Database

Resources

Team