<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Novitsky (2007)
Title The reverse transcriptase 67N 70R 215Y genotype is the predominant TAM pathway associated with virologic failure among HIV type 1C-infected adults treated with ZDV/ddI-containing HAART in Southern Africa.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 61
NumPts 23
Subtype C, CRF11_cpx

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0898 0898_0019 None None   V35T, E36A, T39E, S48E, K49R, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I329L  
  0898_7976 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215Y A98G, K103N, Y181C V35T, E36A, T39E, S48E, K49R, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, D218E, V245Q, K277R, E291D, V292I, I293V, I329L  
  0898_6451 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215Y A98G, K103N, Y181C V35T, E36A, T39E, S48E, K49R, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, D218E, V245Q, K277R, E291D, V292I, I293V, I329L  
1025 1025_0078 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123S, K166KR, K173A, D177E, E194D, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, R307RK, Q334QDEH  
  1025_0773 AZT, DDI NNRTI D67DN V106VA, Y181YC, F227FL V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, E194D, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, Q278QH, T286A, E291D, V292I, R307RK, Q334QE  
1072 1072_0105 None None   T27TS, V35T, E36A, T39DE, S48T, K122E, D123DG, K173AT, D177E, V179VA, T200TA, I202IV, E203ED, Q207AE, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, T286TA, E291D, V292I, I329IL  
  1072_1862 AZT, DDI NNRTI  K103N, Y181YC V35T, E36A, T39E, S48T, K101KQ, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K, H221HY, L228LR, V245Q, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I V60VG 
  1072_2326 AZT, DDI NNRTI  K103N, Y181YC, G190GA V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K, L228LR, V245Q, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
  1072_2794 AZT, DDI NNRTI D67DN, K70KR, T215TNSY A98AG, K103N, Y181YC, G190GA V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K, H221HY, L228LR, V245Q, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
  1072_8477 AZT, DDI NNRTI D67DN, K70KR, T215TNSY A98AG, K103N, Y181C, G190GA V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K, H221HY, L228LR, V245Q, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
1144 1144_0155 None None   V35T, T39E, S48T, V60VI, K122E, A158S, K173A, D177DE, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, Q278N, E291D, V292I, I293V, E297D  
  1144_0720 AZT, DDI NNRTI  K103N V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, A158S, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, Q278N, E291D, V292I, I293V, E297D Q182QH 
  1144_0794 AZT, DDI NNRTI  K103N V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, A158S, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, Q278N, E291D, V292I, I293V, E297D  
1194 1194_0201 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122KE, D123DGNS, P170S, K173T, G196E, T200A, I202V, Q207EK, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, K311KR  
  1194_0548 AZT, DDI NNRTI   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122KE, D123DGNS, E138EG, P170S, K173T, G196E, Q197QR, T200A, I202V, Q207EK, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, K311KR A299AG 
  1194_2114 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106VM V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, P170S, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, L310I  
  1194_2315 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106M V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, P170S, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, L310I  
  1194_2627 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106M V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, P170S, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, L310I  
  1194_2855 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106M V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, P170S, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, L310I  
1195 1195_0208 None None   K20KR, E28EK, K32KE, V35T, E36A, T39E, K122E, D123DN, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
  1195_1995 AZT, DDI NNRTI  K101KE, G190A K20KR, E28EK, K32KE, V35T, E36A, T39E, D86DN, K122E, D123DN, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K, D237DN, V245EQ, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
  1195_2127 AZT, DDI NNRTI D67DN, K70KR K101KE, G190A K20KR, E28K, K32KE, V35T, E36A, T39E, K102KR, K122E, D123DN, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K, D237DN, V245EQ, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
  1195_1467 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215TI, K219KE G190A K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, K122E, D123DN, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245EQ, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
  1195_1680 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215I, K219E G190A K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, K122E, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245E, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
1237 1237_0237 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174R, D177E, G196GV, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D324E  
  1237_2118 AZT, DDI NNRTI   V35T, E36EA, T39E, S48T, K122E, D123DG, K173A, Q174R, D177E, G196GV, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D324E  
1282 1282_0280 None None   V35T, T39E, S48T, K104KR, K122E, D123DN, K173A, D177E, I195IL, Q197K, T200A, Q207N, R211K, V245Q, P247T, D250E, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I, I293V, E297KT, I329L  
  1282_0525 AZT, DDI NNRTI   V35T, T39E, S48T, K104KR, K122E, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207N, R211K, V245Q, P247T, D250E, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, I329L  
1447 1447_0458 None None   P4S, V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, D177E, T200A, Q207X, R211RK, V245Q, A272S, K277R, T286AV, E291D, V292I, I293V, V317A  
  1447_2037 AZT, DDI NNRTI T215Y K103N P4S, V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, V90I, K122E, D123G, I135M, S162C, D177E, V189I, T200A, R211K, V245Q, A272S, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, V317A  
1467 1467_0493 None None   P4S, T27S, V35T, T39E, S48T, K122E, D123NS, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
  1467_1383 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106VM, Y181YC P4S, T27S, E28K, V35T, T39E, S48T, I50V, K122E, D123S, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
  1467_1415 AZT, DDI NNRTI  K103N, V106VM, Y181YC T27S, E28K, V35T, T39E, S48T, I50V, K122E, D123S, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
  1467_1693 AZT, DDI NNRTI T215Y K103N, Y181C P4S, T27S, E28K, V35T, T39E, S48T, I50V, K122E, D123S, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, H221HY, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
1497 1497_0550 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, W88WC, K122E, D123DGNS, A158AS, K166KR, K173A, Q174QR, D177E, V179VI, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272S, K277R, E291D, V292I, I293IV, I329L  
  1497_1965 AZT, DDI NNRTI T215Y V106M, G190A K32R, V35T, E36A, T39E, S48T, W88C, K122E, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V, I329L  
  1497_2975 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215Y V106M, G190A K32KR, V35T, E36EA, T39E, S48T, W88C, K122E, T139TR, K173A, Q174R, D177E, E194EG, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V, I329L Y146Y* 
1599 1599_0566 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, F87L, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, V179I, Q197K, T200E, Q207K, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
  1599_2995 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215F, K219KE K101E, K103N E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, E138G, K173A, Q197K, T200E, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
1604 1604_0753 None None   V35I, E36EA, T39E, S48T, K122E, D123G, I135AT, K173A, Q174K, D177E, Q197H, I202V, Q207DEG, R211Q, V245HQ, A272P, T286A, E291D, V292VI, I293V  
  1604_5370 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215FY K103N, V106M V35I, T39E, S48T, K102KR, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174K, D177E, Q197H, K201R, I202V, Q207A, R211Q, V245Q, A272P, T286A, E291D, I293V  
1617 1617_9067 AZT, DDI NNRTI  Y181C V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, K173T, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, D250E, K277R, E291D, V292I, I293V  
1624 1624_0829 None None   K22R, V35T, E36A, T39E, K122E, D123NS, T139TA, I142IATV, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
  1624_2400 AZT, DDI NNRTI  V106M, Y188YH, F227FL V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135IL, I142T, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K, T240TP, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
  1624_7985 AZT, DDI NNRTI L74V, T215Y V106M, Y188H, M230L V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I142T, K173A, D177E, I178M, V179VI, T200A, E204K, Q207D, R211K, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
  1624_3549 AZT, DDI NNRTI D67DGNS, K70R, T215Y V106M, Y188L V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135IL, I142T, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
  1624_0542 AZT, DDI NNRTI D67N, K70R, T215Y V106M, Y188L V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I142T, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
1646 1646_3858 AZT, DDI NNRTI  V179D P4S, V35T, E36A, T39E, S48ST, K103KR, K122E, D123S, E138A, K173A, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, L228LH, V245E, A272P, K277R, A288T, E291D, V292I, I293V, H315F  
1708 1708_5064 AZT, DDI NNRTI T215Y K103N, G190A V35T, E36A, T39E, S48T, V90I, K122E, D123S, K173T, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
1891 1891_1827 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, S251DN, T286A, E291D, V292I, I293V, K311KR  
  1891_0851 AZT, DDI NNRTI D67DN, K70KR, T215TNSY E138K, V179DG, G190E V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V  
1898 1898_1854 None None   V35T, E36A, T39E, S48E, K173KINT, Q174QKR, D177DE, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317VA  
  1898_4401 AZT, DDI NNRTI K65R V106M, Y181C, G190A V35T, T39E, S48E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, S322A  
2051 2051_2459 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121E, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, G196V, T200A, Q207E, V245E, E248V, D250E, A272P, K277R, T286TA, A288AS, E291D, I293V  
  2051_6489 AZT, DDI NNRTI   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, G196V, T200A, Q207E, V245E, E248V, D250E, A272P, K277R, T286TA, A288AS, E291D, I293V  
2131 2131_4154 AZT, DDI NNRTI  K103KN, V106VM, Y181YC, G190GA P4S, T27S, V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, D123DG, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211K, L228LR, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293IV  
2146 2146_1455 None None   V35T, E36A, T39E, E40ED, S48T, D121H, K122E, E169EK, K173A, Q174QK, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293IV  
  2146_5408 AZT, DDI NNRTI T215Y K103N, V108I V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, I135M, E169K, K173A, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
2314 2314_2906 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, K49R, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200AE, I202V, E204D, Q207QH, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272S, K281KR, E291D, V292I, I293V, P294PT, I329L  
  2314_5524 AZT, DDI NNRTI  V106A I5V, E6D, K11T, V35T, K49R, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272S, E291D, V292I, I293V, E297T, S322T, I329V  
  2314_4328 AZT, DDI NNRTI M184V V106A, F227FL I5IV, E6D, K11T, V35T, K49R, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272S, E291D, V292I, I293V, E297T, S322T, I329V  

Database

Resources

Team