<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Han (2007)
Title Genotypic resistance mutations to antiretroviral drugs in treatment-naive HIV/AIDS patients living in Liaoning Province, China: Baseline prevalence and subtype-specific difference.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 72
NumPts 72
Subtype B, CRF01_AE, CRF07_BC, A, CRF08_BC, G, CRF06_cpx, C


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
JC06 04CNLN123 None None   K11R, S162C, T200V, R211K, A272P, K277R, Q278E, L283I I270F 
JC07 04CNLN124 None None   K11R, I135V, S162C, T200E, Q278E G213E 
JC09 04CNLN126 None None   K102Q, I135V, S162C, T200A, V245E, K277R, Q278E, L283I  
JC10 04CNLN127 None None   I135R, S162C, T200A, I202V, K277R, Q278E Q269R 
JC13 04CNLN130 None None   V106I, I135V, S162C, T200E, R211G, F214L, K275R, Q278E  
JC16 04CNLN133 None None   S68G, I135R, S162C, T200A, E203D, K277R, Q278E G285R 
JC18 04CNLN135 None None   K102Q, I135V, S162C, T200A, V245E, K277R, Q278E, L283I  
JC19 04CNLN136 None None   K101R, I135V, S162C, T200E, R211T, Q278E, L283I  
JC20 04CNLN137 None None   I135V, S162C, T200A, Q207H, R211K, Q278E  
JC23 04CNLN140 None None   K102R, I135V, S162C, Q174H, T200A, Q278E  
JC29 04CNLN146 None None   I135V, E138D, Q145H, S162C, T200E, K275R, Q278E, L282I, T286A  
JC30 04CNLN147 None None   E6D, R125G, I135L, S162C, T200A, L210M, K277R, Q278E  
LN01 00CNLN01 None None M184I  V35T, E36A, T39D, M41I, S48T, V60I, W88*, D121Y, K122E, G196R, W212*, V245Q, W266*, A272P, K277R, Q278R, R284K, T286A M16I, G51R, R78K, G99R, G112K, R143K, G155R, G231K, G273R, G285E 
LN03 00CNLN03 None None   V21I, V35T, V60I, V106I, Q174E, D177E, T200V, Q207K, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275R, V276I, K277R, T286A  
LN04 00CNLN04 None None T215S  V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I195M, V245Q, A272T, K277R, T286A  
LN05 00CNLN05 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN07 00CNLN07 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN08 00CNLN08 None None   I135V, S162C, T200A, K277R, Q278E, L283I  
LN10 00CNLN10 None None   S162C, T200A, A272S, K277R, Q278E  
LN12 00CNLN12 None None   V106I, I135V, S162C, T200A, Q207H, K277R, Q278E  
LN13 00CNLN13 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245T  
LN14 00CNLN14 None None  K103N K11N, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245T  
LN15 01CNLN15 None None   K11N, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245T, T286A  
LN16 00CNLN16 None None   K102Q, K104T, I135V, S162C, G196R, T200A, K277R, Q278E  
LN17 01CNLN17 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207E, R211K, D250E, A272P, K277R, K281R  
LN18 01CNLN18 None None   K11S, I135V, S162C, T200E, Q278E, T286A  
LN19 01CNLN19 None None   I5V, S162C, T200A, I202V, Q207E, A272P, K277R, Q278E, L283I  
LN21 01CNLN21 None None   E6D, E44K, K122E, I135V, S162C, T200A, Q207N, R211K, D237N, Q278E  
LN23 02CNLN23 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A  
LN24 02CNLN24 None None   I135V, S162C, T200A, R211K, Q278E  
LN26 02CNLN26 None None   V35I, K122E, S162C, T200E, Q207H, R211K, K277R, Q278E, L283I  
LN27 02CNLN27 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, D121H, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
LN30 02CNLN30 None None   E6D, D123E, I135V, S162C, D177E, T200A, K277R, Q278E  
LN32 02CNLN32 None None M41L  V35L, T39K, E40G, K43E, V60I, K122E, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q, E248D, L260V, A272P, K275R, T286A  
LN33 02CNLN33 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, V245E, A272P  
LN34 02CNLN34 None None   K20R, D121H, K122E, T200I, R211K, V245K  
LN35 02CNLN35 None None   K11R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A  
LN36 02CNLN36 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E Q269H 
LN37 02CNLN37 None None   V106I, I135V, S162C, T200A, Q278E, T286A  
LN38 02CNLN38 None None   K11R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A  
LN39 02CNLN39 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K103Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, K277R  
LN40 02CNLN40 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, K277R  
LN41 02CNLN41 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN42 02CNLN42 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN43 02CNLN43 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, T200A, V245Q, A272P, K277R  
LN44 02CNLN44 None None   D123E, I135V, S162C, T200E, Q207E, Q278E  
LN45 03CNLN45 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, V90I, D121H, K122E, D177E, L210F, V245Q, A272P, K277R  
LN46 03CNLN46 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, V179I, E204K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN47 03CNLN47 None None   E6D, T7P, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, V245E, K281R, T286A  
LN51 03CNLN51 None None A62V  V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69N, D123E, I135V, S162C, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
LN52 03CNLN52 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN53 03CNLN53 None None   K122E, I135T, K166R, D177E, F214L, V245M, V261I, A272P, V276I  
LN54 03CNLN54 None None   K101T, I135V, S162C, E169D, T200I, V245A, K277R, Q278E  
LN58 03CNLN58 None None   V106I, D123E, I135V, S162C, T200A, V276I, K277R, Q278E  
LN60 04CNLN60 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN61 04CNLN61 None None   E6D, K11T, V35I, T39K, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A  
LN62 04CNLN62 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, I274V, T286A  
LN63 04CNLN63 None None   I135V, S162C, T200A, V245K, K277R, Q278E, K287Q  
LN64 04CNLN64 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A G45R 
LN65 04CNLN65 None None   I135V, S162C, V189I, T200A, Q207R, K277R, Q278E  
LN66 04CNLN66 None None   E6D, K11T, V35I, K122E, D123S, I135T, I142L, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN67 04CNLN67 None None   K102M, I135V, S162C, I178M, T200A, Q278E  
LN69 04CNLN69 None None A62V  K11T, V35I, T39K, D123N, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, V276I, T286A  
LN71 04CNLN71 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN72 04CNLN72 None None   D123E, I135V, S162C, T200A, A272P, K277R, Q278E, L283I  
LN74 04CNLN74 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K103R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A  
LN76 04CNLN76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN77 04CNLN77 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K, T286A  
LN78 04CNLN78 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
LN79 04CNLN79 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN80 04CNLN80 None None   K122E, I135T, E169D, I202V, F214L, V261I, Q278H  
LN81 04CNLN81 None None   K173E, T200A, E204D, E248D, K277R, Q278E