<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Santos (2006)
Title Characterization of a new circulating recombinant form comprising HIV-1 subtypes C and B in southern Brazil.
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 192
NumPts 192
Subtype B, C, CRF31_BC, F, B + C, D

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 192 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
005 005PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
006 006PR_RT AZT, 3TC, D4T EFV M41L, L74V, M184V, L210W A98G, L100I, K103N T39A, K122E, T200A  
012 012PR_RT AZT, 3TC None   K122E, D123S, E138A, T200A, R211K  
013 013PR_RT AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L  K122E, I142T, G196E, R211K  
014 014PR_RT AZT, DDC, D4T, 3TC, DDI EFV M41L, D67N, L74V, T215F, K219H A98G, L100I V60I, V90I, K103E, K122E, I135T, S162Y, D177E, D192E, I202V  
015 015PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, I135T, D177N, R211Q D185G 
017 017PR_RT DDC, AZT, D4T, 3TC EFV M41L, D67N, M184V, T215Y L100I, K103N K22R, T139K, V179I, Q207A, H208Y, R211K  
019 019PR_RT AZT, 3TC None   V179I, G196E, T200A, I202V, E204G, L210F  
020 020PR_RT AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, L210W  K20R, V60I, K82R, K122E, D123N, I135T, I178M, R211K  
021 021PR_RT None None   K20R, V35T, V60I, D123E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207A, R211K, F214L  
026 026PR_RT AZT, 3TC None   A98S, D121Y, K122E, I135T, D177E, T200A, Q207E  
028 028PR_RT AZT, 3TC, Unknown EFV, Unknown   R83K, G196E R172T 
036 036PR_RT AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T, Unknown NVP, Unknown, EFV   V35T, E36D, T39E, K122E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
042 042PR_RT AZT, 3TC None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, I142V, A158S, K173T, D177G, T200A, Q207G  
044 044PR_RT AZT, DDI, 3TC, D4T EFV M41L, D67N, L210W, T215Y, K219R  E44D, V106I, V118I, K122E, I135T, S162C, T200A, E203D, H208Y, R211K, K223T  
049 049PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I180V  
050 050PR_RT None None  V179D K122E, I202V, F214L  
051RT 051RT None None A62V, D67G, V75I, F116Y, Q151M, M184V, T215A L100I, K103N I31L, V35T, T39D, K43R, T58N, S68R, T69S, V111I, V118I, K122E, I135T, T139A, V189I, I202V, R211K, F214L R72K 
052 052PR_RT AZT, DDI, Unknown, 3TC Unknown   E40D, I50V, I135T, Q174L, R211K  
053 053PR_RT D4T, 3TC None T69D  K20R, K122E, I135T, S162C, K173N, Q197P, Q207E  
054RT 054RT None None V75M, M184V  K46R, D123E, S162C, K166R, D177N, T200A, L210S, F214L W71R 
055 055PR_RT DDC, AZT, Unknown, D4T, DDI, 3TC Unknown   P14L, D123E, I142V, D177E, T200A  
057RT 057RT None None M184V  D123E, S162C, K166R, D177N, T200A, L210S, F214L  
058RT 058RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K101R, K122E, D123S, T200A, Q207E, R211K  
059RT 059RT None None D67G, M184V  S68G, I135T, I142V, R172K, Q174H, R211K  
062 062PR_RT None None   K122E, D177E, T200A, F214L  
066RT 066RT None None V75M  D177E, I178M, T200A, R211K D110G 
069 069PR_RT None None   K11T, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K  
070RT 070RT None None   K101R, K122E, D123S, T200A, Q207E, R211K  
079 079PR_RT AZT, 3TC None   E6A, I135T, E169D, T200I, R211K, F214L  
088 088PR_RT None None   V21X, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135V, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
091 091PR_RT AZT, 3TC, Unknown Unknown   D123E, I135T, D177E, T200A, R211K  
092 092PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, I142T, A158S, K173A, T200A, Q207G, R211K  
094 094PR_RT D4T, 3TC, AZT None V75M, M184V  D123E, S162C, K166R, R172K  
097 097PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V118I, K122E, I135T, E138G, T200A, Q207E, R211K, F214L  
098 098PR_RT AZT, 3TC None M41L, D67N, K70R, V75M, L210W, T215Y, K219Q G190S T39A, V60I, K122P, I135T, D177E, I178M, Q207H, R211K P97S, H198R 
100 100PR_RT None None   S48E, D123E, D177E, T200I, R211K  
10019 10019 Unknown Unknown   T39E, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
101 101PR_RT AZT, Unknown, 3TC Unknown, EFV M184V K103N K122E, F214L  
102 102PR_RT None None  V179D K20R, K122E, I135T, I195L, G196E, T200A, F214L  
104 104PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K173T, T200A, Q207E, R211K  
107 107PR_RT None None   K122E, D123S, I135T, R172K, R211K, F214L  
108 108PR_RT None None   K20R, D121H, K122E, I135T, R211K, F214L  
110PA 110PA None None   V35T, E36A, T39D, S48E, D123S, K166R, D177E, I178V, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377L, V381I, K390R, K395R, E404D, V435I, V466S, D471E, H483Q, L491S, S519N, K530R, A534S, A554K  
112 112PR_RT D4T, DDI, Unknown, 3TC, AZT Unknown, EFV K219N  K20R, K122E, D123S, S162A, E169D, T200V, R211K  
113RT 113RT None None   V60I, D86N, V106I, I135T, E194K, F214L E42K 
114RT 114RT None None   T39D, K43R, S48T, K104N, K122E, D123S, I135T, Q197K, R211K, F214L  
118RT 118RT None None D67N, K70R, L74V, M184V, T215A, K219Q L100I, K103N T39A, V60I, V90I, K122E, I135L, S162H, K173A, Q174K, D177N, T200A, Q207E, W212R  
120 120PR_RT None None   S68G, K104R, K122E, I135T, S162C, T200A, R211K, E224A  
123RT 123RT None None   D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, R211N  
127 127 Unknown Unknown  K103N T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, D177E, T200I, R211K  
128 128PR_RT DDC, AZT, Unknown, 3TC, D4T Unknown   V35T, K122E  
137RT 137RT None None   K122E, I142T, K166R, F171Y, D177E, I178M, G196E, E204D, R211M, K223R D218H 
144 144PR_RT None None T215P  V35A, E40D, K49R, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211Q  
145RT 145RT None None   T39D, K43R, K49R, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
155 155 Unknown Unknown T215A, K219R  T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, I142M, A158S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207K, R211K, F214L, K220X, H221X D218A, E224S 
172 172 AZT, DDI None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, I135T, S162C, R211K  
187rt2 187rt2 Unknown Unknown   T39E, K43R, S48T, V60I, K104N, K122E, D123S, I135T, R211K F130L 
194 194 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  T39K, K43E, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, R211K  
205 205 AZT, DDI, 3TC, D4T None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123G, E138A, I142V, K173Q, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, K390R, E404D, V435A, L452M, V466I, S468T, D471E, H483Q, L484I, L491S, S519N, K530R, A534S, A554N  
9294 9294 Unknown Unknown   D123E, S162H, E169D, K173T, Q174K, T200K, Q207A, R211K, F214L  
9312 9312 Unknown Unknown D67N, K70R, T215Y  T39E, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K, D218E, K219T K220R, H221N 
9344 9344 Unknown Unknown   T39D, S48T, K173A, T200A, Q207E, R211K  
B091 B091 None None M41L, T215S  V21I, D123E, K166Q, E169D, I178L, Q207A, R211K, I244L, P247X, S251T L246Q 
B138 B138 AZT, 3TC, D4T, DDI None   K122E, I202V, R211K  
BR1 BR1 AZT, DDI, 3TC EFV   V35T, G45E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, I202V, R206K, Q207E, R211K S191T 
BR2 BR2 AZT, 3TC None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, A158S, K173A, T200A, Q207K, R211G  
BR48 BR48 AZT, 3TC NVP   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, D177G, T200A, Q207D, R211K  
BR49 BR49 DDC, AZT, 3TC, D4T None   I2V, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
BR50 BR50 D4T, 3TC None   V35T, E36A, T39D, K43E, S48T, K104R, K122A, D123N, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BR52 BR52 DDC, AZT, 3TC None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BR54 BR54 AZT, 3TC NVP   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, I135T, A158S, S162C, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BR55 BR55 AZT, DDI, 3TC, D4T None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, I142V, A158S, R172K, K173T, D177G, T200A, Q207G, R211K  
BR56 BR56 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI None   I50L, K101R, K122E, D123S, T200A, Q207E, R211K G51A 
BR57 BR57 3TC, D4T, AZT EFV   I50L, K101R, K122E, D123S, T200A, Q207E, R211K  
BR58 BR58 DDC, AZT, 3TC, D4T None   K20N, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123S, I135V, S162C, R172K, K173A, D177E  
BR59 BR59 AZT, Unknown Unknown   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, I135T, I142V, R211K  
BR60 BR60 D4T, DDI None D67N, K70R, T215Y, K219Q A98G V35T, T39L, V60I, I135T, I142V, S162Y, K173T, Q174K, T200A, Q207E, F214L  
BR61 BR61 3TC, D4T None   V35A, T39A, S48T, K122E, D123S, I135V, I142M, A158S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
C073 C073 Unknown Unknown   V35T, E36A, T39D, K122E, D123S, T128X, I135R, S156X, S162C, K173A, T200A, Q207E, R211K  
C125 C125 Unknown Unknown M184I, T215P K101E, G190A V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T D186G, P217~, D218S, L246E 
c135 c135 Unknown Unknown M184V K103S, G190A V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, I135T, E169A, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q  
cd172 cd172 None None D67N, K70R, T215F  K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
FB103 FB103 AZT, DDI, D4T, 3TC None D67N, K70R, K219Q  E6D, V35M, D123E, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211K  
FB109 FB109 AZT, DDI, 3TC, D4T None V75I, F77L, T215A  T58S, R83K, K122E, I178L, T200A, Q207E, R211Q, V245Q K173P, D192G, K201Q, E233A 
PA072 PA072 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, G335D, R356K, G359T, K366R, T377M, V381I, K388R, K390R, E404D, V435A, L452M, V466I, S468P, D471E, H483Q, L491S, S515L, S519N, K530R, A534S, A554N  
PA110 PA110 None None   V35T, E36A, T39D, S48E, D123S, K166R, D177E, I178V, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377L, V381I, K390R, K395R, E404D, V435I, V466S, D471E, H483Q, L491S, S519N, K530R, A534S, A554K  
PA124 PA124 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K102Q, K122E, D123S, S162C, D177DE, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A, G335D, R356K, G359T, A360V, K366R, T377Q, K390R, E404D, V435A, V466I, D471E, H483Q, L491S, S519N, K527N, K530R, A534S, A554S  
PA130 PA130 None None  K103N V35T, E36A, T39AD, S48T, V60I, K122E, D123S, R211K, V245Q, A272P, E291D, I293V, E328D, G335D, R356K, G359T, K366R, T377L, K390R, E404D, V435A, L452K, V466S, V467I, S468P, D471E, H483Q, L491P, S519N, K530R, A534S, A554N  
PA212 PA212 None None   K20R, I142T  
PA222 PA222 None None   K32R, I47L, D177E, R211K, K238Q  
PA225 PA225 None None M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219Q  K20R, V35I, T39E, K122E, I135T, G196E, Q197K, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245T  
PA227 PA227 None None M184V  K20R, I135T, Q174H, R211K  
PA237 PA237 None None M41L, D67N, M184V, L210W, T215S K103N, V108I K20R, K43E, E44A, K49R, K122E, I135T  
PA342 PA342 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC EFV M184V K103N, V108I V35T, D123E, I142V, Q207A, V245Q W71R 
PA343 PA343 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC EFV M41L, M184V, L210W, T215Y  K20R, V35R, K101Q, K122E, I135T, I202V, R211K, V245M  
PA365 PA365 DDC, AZT, DDI, D4T, 3TC None   K122E, I135T, S162C, F214L Q91K 
res037 res037 Unknown Unknown   T27P, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, S68X, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200X, Q207E, R211K, V245Q, K263E  
res079 res079 Unknown Unknown M41L, D67N, T69D, L210W, T215Y, K219N K103KN, V106VM, Y181C, G190A E28A, V35T, T39E, E44D, A98S, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, H208Y, R211K, L228H, K238R, V245Q