<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Carr (2005)
Title Outbreak of west African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 232
NumPts 232
Subtype A, CRF02_AG, B, A + CRF02_AG, CRF63_02A1, G

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 232 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0002BBY 0002BBY None None  V108I V35T, K49R, I50V, V60I, K122P, I135L, S162A, T165I, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
0005BBY 0005BBY None None   V21I, T27S, V35T, E36D, T39M, K49R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E  
0008BBY 0008BBY None None   V35T, E36D, T39L, A98S, K122Q, I135V, I142V, S162A, Q174G, D177E, T200A, Q207A, R211E  
0013BBY 0013BBY None None   V35T, K49R, K102E, K122E, I135V, E138A, S162A, K173T, Q174R, D177G, I178M, E194Q, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211S  
0014BBY 0014BBY None None  G190R V35T, E53D, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E E42K, D185N 
0015BBY 0015BBY None None   V35T, E36D, T39L, V90I, D123E, I135V, S162A, K166Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A  
0018ND 0018ND None None   V35T, E36A, K43Q, K49R, V60I, K102E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E K30R 
0074NY 0074NY None None   V35T, K49R, V60I, K104R, K122E, D123G, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207G, R211K  
0088BA 0088BA None None   V35T, E36D, T39L, K101Q, D121Y, K122E, I135V, E138A, S162A, F171FY, K173KT, Q174KN, D177E, T200A, I202V, Q207QE, R211KT  
0099BA 0099BA None None   V35T, K104R, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200E, E203Q, Q207E  
0119MA 0119MA None None   V35T, E36D, T39A, K122A, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174R, T200A, Q207E, F214L  
0126MA 0126MA None None   V35T, T39S, G45E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K  
0131NY 0131NY None None   V35T, T39A, K122E, D123G, I135V, S162A, M164I, K173M, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K  
0144ND 0144ND None None   V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, D123E, S162A, K173A, Q174E, D177K, T200A, Q207E, R211K  
0155BA 0155BA None None   V35T, V90I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174HN, P176S, D177E, I178M, T200A, Q207R, R211E  
0158ND 0158ND None None   V35T, T39A, E40D, D121H, K122E, D123E, I135IT, S162A, K173AV, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
0180MA 0180MA None None   V35T, V90I, K122E, S162A, K173S, D177E, V179I, E204D, Q207A, R211K  
0186BA 0186BA None None   K20R, V35T, E36D, T39L, K49R, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, R206K, Q207G, R211K  
0191ND 0191ND None None   V35T, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
0201BA 0201BA None None   P4S, E28G, V35T, T39L, D123E, I135V, S162A, K173AT, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207E  
0208NY 0208NY None None   V35T, V60I, K122E, D123N, I135V, I142V, S162A, D177E, I178L, E204K, Q207E, F214L  
0212MA 0212MA None None   V35T, T39S, K49R, K101Q, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
02UZ654 02UZ654 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ658 02UZ658 None None   P14E, V35T, E36N, D121Y, I135V, I142L, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K  
02UZ659 02UZ659 None None A62V  K11T, V35IR, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ660 02UZ660 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ661 02UZ661 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ663 02UZ663 None None   V35T, E36D, T39R, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S  
02UZ664 02UZ664 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ665 02UZ665 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
02UZ667 02UZ667 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, I135V, A158AS, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
0925MO 0925MO None None   E6K, V35T, E36D, K43R, V60I, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207E, R211K, F214L K13R 
1188NG 1188NG None None   V35T, T39A, K102Q, K104R, K122E, D123G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1232NG 1232NG None None   V35T, E36D, K122E, D123S, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1237NG 1237NG None None  V108I I5V, V35T, T39A, D123S, I135V, I142V, S162A, K173V, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
1370NG 1370NG None None   V35T, E36D, K102R, S162A, K173S, D177E, V179I, Q207A  
1475MV 1475MV None None   I5V, V35T, E40A, K46Q, K104R, K122E, D123G, I135V, S162A, K173T, Q174A, D177E, Q207E  
1511MV 1511MV None None   V35T, T39L, V60I, K104R, I135T, E138A, I142V, S162A, K173I, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L  
1569MV 1569MV None None   E6N, V35T, K43R, K122E, D123N, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
1669LE 1669LE None None   V21I, V35T, T39S, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E  
1677LE 1677LE None None   E6A, V35T, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K  
1901LE 1901LE None None   V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174K, I178M, T200A, Q207E, R211K  
1970LE 1970LE None None   V35T, T39S, D123E, I135T, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
2103ND 2103ND None None   I31R, V35T, E36D, K43R, K104R, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207N  
2172SA 2172SA None None   V35T, K104R, K122E, D123G, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E  
2188SA 2188SA None None   V35T, E40D, K104R, K122E, D123S, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
2307SA 2307SA None None   E6K, V35T, K104R, K122E, D123NT, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
2324SA 2324SA None None   V35T, T39M, D86E, K122A, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, E194N, T200A, Q207E  
2327SA 2327SA None None   V35T, T39M, V60I, K104R, K122E, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211A  
2348SA 2348SA None None   V35T, T39A, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200E, E203Q, Q207E  
2358LE 2358LE None None   V35I, T39TS, D123DE, I135T, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
2378LE 2378LE None None   E6K, V35T, E40D, K43R, K104R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
2387LE 2387LE None None   E6K, V35T, E36D, E40D, K102Q, K104R, K122E, S162A, K173R, Q174K, D177E, I178L, V179G, T200A, Q207E E233K 
2391LE 2391LE None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
2404LE 2404LE None None   V35T, E36D, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207E  
2476LE 2476LE None None   V35T, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E  
2602ND 2602ND None None   K20R, V35T, E36D, T39A, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207K R72K 
2660ND 2660ND None None   V35T, E36D, T39L, K122T, I135V, E138A, S162A, F171Y, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
2685ND 2685ND None None   V35T, E36D, T39L, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211M  
2693ND 2693ND None None   V35T, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174K, P176S, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
2772YI 2772YI None None   V35T, E36D, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174A, D177E, T200A, Q207N, R211K  
2873YI 2873YI None None   E6D, K11N, V35T, E36D, K49R, K104R, D121Y, K122E, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
2888HA 2888HA None None   V35T, E36D, V60I, K122E, D123G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
2908HA 2908HA None None   V35T, T39S, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, G196R, T200A, Q207E, R211K  
2983HA 2983HA None None   V35T, E36D, T39L, I135V, Y144F, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
3056HA 3056HA None None   P4H, V35T, E36D, K43R, K104R, K122E, D123S, S162A, P170S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
3060HA 3060HA None None   V35T, K102Q, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E K122S 
3066HA 3066HA None None   V35T, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
3085HA 3085HA None None   V35T, E36A, V60I, K104R, K122E, D123N, I135T, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L  
3103MN 3103MN None None   V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E K13KR 
3106MN 3106MN None None   P9S, V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E  
3153MN 3153MN None None   V35T, K122E, D123G, S162A, K173T, Q174K, D177E, D192N, Q207A, R211K  
3177MN 3177MN None None   V35T, E36D, T39S, A98S, I135V, S162A, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
3217MN 3217MN None None   E6D, K11N, K20R, V35T, E36D, K49R, V60I, D121H, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
3228MN 3228MN None None   P4S, V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
3314NJ 3314NJ None None   E6D, K20R, V35I, I135L, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K Q174M 
3411NJ 3411NJ None None   V35T, E36D, K49R, I135V, S162A, K173T, D177E, I195L, Q197K, T200A, Q207E, R211Q I132T 
3428NJ 3428NJ None None   V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E  
3436NJ 3436NJ None None   E28K, K32Q, V35T, E36D, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E P14R 
3447NJ 3447NJ None None   V35T, E36D, K122E, D123G, I135V, S162A, R172RK, K173T, Q174EK, D177E, V179I, I180IL, T200A, Q207G, R211K  
3467NJ 3467NJ None None   V35T, E36D, T39I, I135V, S162A, K173T, D177E, I195L, Q197K, T200A, Q207E, R211Q  
3484NJ 3484NJ None None   E28K, V35T, T39A, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
4020HAN 4020HAN None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K49R, K104R, I135V, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211T G45R, R72K 
4047HAN 4047HAN None None   V35T, T39A, K122E, A158S, S162A, K173R, Q174K, N175Y, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K  
4048STN 4048STN None None   V35T, T39A, K49R, K122R, A158S, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
4077STN 4077STN None None   V35T, T39M, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E  
4080HAN 4080HAN None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K104R, I135V, S162A, K173V, Q174D, D177E, T200A, Q207K, R211T  
4082STN 4082STN None None   V35K, E36D, T39S, V60I, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E  
4119STN 4119STN None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
4131STN 4131STN None None   P4S, V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
4165STN 4165STN None None   V35T, K43Q, K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200E, E203Q, Q207E, R211K  
4171STN 4171STN None None   K20R, K32R, V35T, E36D, E40D, K43R, V60I, K104R, K122E, D123G, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K  
4185HAN 4185HAN None None   V35R, E36D, T39S, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
4212HAN 4212HAN None None   V35T, T39M, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E  
4217STN 4217STN None None   V35T, K104R, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211Q  
4286STN 4286STN None None   E6N, V35T, E40D, K104R, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211Q  
4410HAL 4410HAL None None   V35T, T39A, V60I, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E  
4411HAL 4411HAL None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
4419HAL 4419HAL None None   E6K, V35T, E36D, K43R, K104R, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
4420HAL 4420HAL None None   V35T, K64R, S105A, K122E, D123G, I135V, I142V, S162A, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K