Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

Home Genotype-RX Genotype-Pheno Genotype-Clinical HIVdb Program

References

Author Kuritzkes (2004)
Title Rate of Thymidine analogue resistance mutation accumulation with Zidovudine- or Stavudine-based regimens
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedType Clinical
NumIsolates 407

Pages  1 
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 407 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KDR_pat10 A0009 None None   V60I, R83K K46TX, E53QX, D192HD 
KDR_pat13 A0010 None None   I135TR, K173E, R211K, I244VI  
  A0011 AZT, 3TC None M184V  I135T, K173E, R211K  
KDR_pat15 A0012 None None   S68G, I135T, T139AT, V179T, G196E  
  A0013 AZT, 3TC None M184V  S68G, I135T, V179T, G196E  
KDR_pat18 A0014 None None M41RM  K104R, D123E, S162A, V179I, T200E, I202V  
  A0015 AZT, 3TC None M184V  K104R, D123E, I135L, S162A, V179IV, T200E, I202VI D113ND, K166NK 
  A0016 AZT, 3TC None M184V  K104R, D123E, I135L, S162A, V179I, T200E, I202V K166NK 
KDR_pat24 A0017 None None K70RK  I50VI, V60I, S68GS, R83K, I135TR, I178L, G196E  
  A0018 D4T, 3TC None K70RK, M184V  I50VI, V60I, S68GS, R83K, K102RK, I135T, I178L, G196E  
  A0019 D4T, 3TC None K70RK, M184V  I50VI, V60I, R83K, K102RK, I135T, I178L, G196E E44G, N137K 
  A0020 D4T, 3TC None K70R, M184V  I50VI, V60I, R83K, K102RK, I135T, I178L, G196E  
  A0021 D4T, 3TC None K70R, M184V  I50VI, V60I, R83K, K102RK, I135T, I178L, G196E  
KDR_pat29 A0022 None None   R83K, D123E, V179I, G196E, T200A, I202V  
  A0023 AZT, 3TC None M184V  R83K, D123E, V179I, G196E, T200A, I202V  
  A0024 AZT, 3TC None M41LM, M184V  R83K, D123E, I135TI, K166RK, V179I, G196E, T200A, I202V  
  A0025 AZT, 3TC None M41LM, M184V  R83K, D123E, K166RK, V179I, G196E, T200A, I202V  
KDR_pat30 A0026 None None   I142V, K166R, T200A, Q207E  
  A0027 AZT, 3TC None   I142V, K166R, T200A, Q207E  
KDR_pat31 A0028 None None L210F  K102R, D123E, E169D, G196E, R211KR  
  A0029 D4T None L210F  K102R, D123E, E169D, G196E, R211KR  
  A0030 D4T, 3TC None K70RK, M184V, L210FL  K102R, D123E, E169D, G196E  
  A0031 D4T, 3TC None K70R, M184V, L210FL  K102R, D123E, E169D, G196E  
  A0032 D4T, 3TC None K70R, M184V, L210F  K102R, D123E, E169D, G196E, R211KR  
KDR_pat32 A0033 None None   Q174KQ, I178MI, R211QE Q207X 
  A0034 D4T None   Q174KQ, I178MI, R211E Q207X 
  A0035 D4T, 3TC None M184V  Q174K, I178MI, R211QE Q207X 
KDR_pat36 A0036 None None   R83K, R211KR  
  A0037 D4T None   R83K  
KDR_pat38 A0038 None None   P176S, T200A, R211K  
  A0039 AZT, 3TC None M184V  I135LI, P176S, T200A, R211K  
  A0040 AZT, 3TC None M41LM, K70RK, M184V, T215YNST  I135LI, P176S, T200A, R211K  
  A0042 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  P176S, T200A, R211K  
  A0041 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  P176S, T200A, R211K  
KDR_pat40 A0043 None None V118I  R83KR, K122P, I135R, K166R, D177E, T200A, I202VI, E204DE, R211K, F214L  
  A0044 AZT, 3TC None V118I, M184V  R83KR, K102RK, K122P, D123ND, I135R, K166R, D177E, G196EG, T200A, I202VI, E204DE, R211K, F214L  
KDR_pat41 A0045 3TC, D4T None M184V  K49R, I135V, S162C, T200A, R211G  
KDR_pat42 A0046 None None   R83KR, K102QK, S162A, E203DE, R211KR, F214LF  
  A0047 3TC, D4T None M184V  R83K, K102Q, S162A, R211KR  
KDR_pat43 A0048 None None   T39A, S48E, I135V, T200I  
  A0049 3TC, D4T None M184V  T39A, I135V, T200I S48G 
KDR_pat5 A0001 None None   R83K, D123E, D177ED, T200I D113YX, K223TX 
  A0002 AZT, 3TC None M184V  R83K, D123E, T200I K223IK 
KDR_pat50 A0051 AZT, 3TC None M184VIM  K122EK, F171YF, F214LF  
KDR_pat51 A0052 None None   I135TI, R211K E40VX 
  A0053 D4T, 3TC None M184V  I135T, R211K  
  A0054 D4T, 3TC None M184V  I135T, R211K  
KDR_pat52 A0055 None None   K102Q, K122EK, D123ED, I159V, I202V  
  A0056 AZT, 3TC None M41L, M184V  K102Q, K122EK, D123ED, I159VI, I202V V148GV 
KDR_pat55 A0057 None None   D177ND, R211QK  
  A0058 AZT, 3TC None M184V  D177ND, R211QK  
  A0059 AZT, 3TC None M41L, M184V  I135VI, Q207RHQ, R211QK  
  A0060 AZT, 3TC None M41LIM, M184V  Q207HQ, R211K Q242KX 
KDR_pat56 A0061 None None M41L, L210W, T215S  K122E, T200A, Q207E, R211K  
  A0062 D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215S  K122E, T200A, Q207E, R211K  
  A0063 D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215S  K122E, T200A, Q207E, R211K  
  A0064 D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K122E, I135TI, T200A, Q207E, R211K  
  A0065 D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K122E, I135TI, T200A, E204K, Q207E, R211K  
KDR_pat57 A0066 None None   R83K, D123E, I178M, R211K  
  A0067 AZT, 3TC None M184V  R83K, D123E, I178MI, R211K K101TK 
KDR_pat60 A0068 None None   I135VI, A158S, R211K  
  A0069 D4T, 3TC None M184V  I135V, A158S, R211K  
  A0070 D4T, 3TC None D67ND, K70R, M184V  I135V, A158S, R211K  
KDR_pat62 A0071 None None  V90I, K101QK K102QK, I142V, K166RK, E169DE, R211K  
  A0072 AZT, 3TC None M184V V90I K102Q, I135TI, I142V, E169D, R211K  
  A0073 AZT, 3TC None M184V V90I K102Q, I142V, S162NS, K166RK, E169DE, R211K  
  A0074 AZT, 3TC None M184V V90I K102Q, I142V, S162NS, K166RK, E169DE, R211K  
  A0075 AZT, 3TC None M184V V90I K102Q, I142V, S162NS, K166RK, E169DE, R211K  
KDR_pat63 A0076 None None   V60IV, R83K, D123ED, S162GACS, Q207E  
  A0077 AZT, 3TC None M184V  R83K, D123ED, S162TAGS, Q207E  
KDR_pat69 A0078 None None   R83KR, V106IV, S162C, D177ED, R211K  
  A0079 3TC, D4T None M184V  I142V, S162C, R211K  
KDR_pat7 A0003 D4T None   S48T, K122E, P243T  
  A0004 D4T, 3TC None M184V  S48T, K122E, P243T  
  A0005 D4T, 3TC None K70RK, M184V  S48T, K122E, I135MI, P243T  
  A0006 D4T, 3TC None M184V  S48T, K122E, I135M, P243T  
KDR_pat72 A0080 None None   K49R, K122E, I142V, T165I, E169D, Q174KQ, I178LI, T200A, I202V, Q207ED, R211K  
  A0081 D4T None M41IM, Q151M  K49R, K122E, I142V, T165I, E169D, Q174K, I178L, T200A, I202V, Q207D, R211K  
  A0082 D4T, 3TC None   K49R, K122E, I142V, T165I, E169D, Q174KQ, I178LI, T200A, I202V, Q207ED, R211K  
KDR_pat73 A0083 None None M41IM  I135T, I202V, Q207E, R211K  
  A0084 AZT, 3TC None M184V  I135T, I202V, Q207E, R211K  
  A0085 AZT, 3TC None   I135T, I202V, Q207E, R211K  
  A0087 AZT, 3TC None M184V  I135T, I142VI, I202V, Q207E, R211K V241LV 
  A0086 AZT, 3TC None M184V  I135T, I202V, Q207E, R211K  
KDR_pat77 A0088 None None  K103R K122EK, T139IT, I142MI, R211K, F214L  
  A0089 D4T, 3TC None K70RK K103R K122EK, T139IT, R211K, F214L K223RK 
  A0090 D4T, 3TC None K70R, M184V K103R R211K, F214L  
KDR_pat80 A0091 None None   V60I, R83K, S162H, K166R, R211K  
  A0092 3TC, D4T None M184V V90IV V60I, R83K, S162H, K166R, R211K  
KDR_pat82 A0093 None None   R211KR, F214L  
  A0094 D4T None   R211KR, F214L  
  A0095 D4T, 3TC None   R211KR, F214L  
KDR_pat84 A0096 None None   I142V, S162C K223IK 
  A0097 AZT, 3TC None M184V  I142V, S162C K223IK 
  A0098 AZT, 3TC None M184V  I142V, S162CS K223IK 
KDR_pat88 A0099 None None   I135VI, D177ED, I178M, R211K  
  A0100 AZT, 3TC None M184V  D177ED, I178M, R211K  
KDR_pat9 A0007 None None   V60I, R83K, I135V, S162C Y232*Y, V241LX 
  A0008 3TC, D4T None   V60I, R83K, I135V, S162YC, I178LI  

The Team

The Data