Isolate Data
| Patient | Isolate | Region | Year | Species | Subtype | Source | Clone Method |
| NYU36 | 36MMAY02 | Kenya | 2002 | HIV1 | D | Plasma | MC |
Treatment History
| Order | Regimen | Weeks |
| 1 | 3TC+ABC+DDI+RTI | 26 |
| 2 | AZT+DDI+EFV | 30 |
RT Sequence
| NRTIMajorDRMs | NRTIMinorDRMs | NNRTIMajorDRMs | NNRTIMinorDRMs | Polys | UnusualMuts |
| K103N | V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E |
| >36MMAY02| 1 | codons 1-220 | clone 1 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRAKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 2 | codons 1-220 | clone 2 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTPDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLGVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRAKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 3 | codons 1-220 | clone 3 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELYKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 4 | codons 1-220 | clone 4 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTILDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYVDDLYVGSDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MMAY02| 5 | codons 1-220 | clone 5 PISPIEAVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTPDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSMNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYVDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 6 | codons 1-220 | clone 6 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 10 | codons 1-220 | clone 10 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTEMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWKKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLGVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 11 | codons 1-220 | clone 11 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSNRWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRAKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 14 | codons 1-220 | clone 14 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGNPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSMNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| 15 | codons 1-220 | clone 15 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTEMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK >36MMAY02| codons 1-220 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEMVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRIKIEELREHLLRWGFTTPDKK |
References
| Author | Title | Citation |
| Lwembe, R | Anti-retroviral drug resistance-associated mutations among non-subtype B HIV-1-infected Kenyan children with treatment failure. | J Med Virol, 2007 |