Isolate Data
| Patient | Isolate | Region | Year | Species | Subtype | Source | Clone Method |
| NYU36 | 36MAUG04 | Kenya | 2004 | HIV1 | D | Plasma | MC |
Treatment History
| Order | Regimen | Weeks |
| 1 | 3TC+ABC+DDI+RTI | 26 |
| 2 | AZT+DDI+EFV | 57 |
| 3 | D4T+DDI+EFV | 91 |
RT Sequence
| NRTIMajorDRMs | NRTIMinorDRMs | NNRTIMajorDRMs | NNRTIMinorDRMs | Polys | UnusualMuts |
| T215F | K103N, G190A | V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, T200R, Q207E |
| >36MAUG04| 3 | codons 1-220 | clone 3 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTELEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSIKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 4 | codons 1-220 | clone 4 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTRILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 6 | codons 1-220 | clone 6 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVVFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 9 | codons 1-220 | clone 9 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 11 | codons 1-220 | clone 11 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQDSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 13 | codons 1-220 | clone 13 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNRGTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 14 | codons 1-220 | clone 14 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTYWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQDSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAUG04| 15 | codons 1-220 | clone 15 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTEMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQDSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRRGFFTPDKK >36MAUG04| codons 1-220 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK |
References
| Author | Title | Citation |
| Lwembe, R | Anti-retroviral drug resistance-associated mutations among non-subtype B HIV-1-infected Kenyan children with treatment failure. | J Med Virol, 2007 |