<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

Isolate Data

Patient Isolate Region Year Species Subtype Source Clone Method
NYU36 36MAPR03 Kenya 2003 HIV1 D Plasma MC

Treatment History
Order Regimen Weeks
1 3TC+ABC+DDI+RTI 26
2 AZT+DDI+EFV 57
3 D4T+DDI+EFV 21

RT Sequence
NRTIMajorDRMs NRTIMinorDRMs NNRTIMajorDRMs NNRTIMinorDRMs Polys UnusualMuts
T215F   K103N, G190A   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E  
>36MAPR03| 2 | codons 1-220 | clone 2
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 3 | codons 1-220 | clone 3
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 4 | codons 1-220 | clone 4
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 5 | codons 1-220 | clone 5
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 7 | codons 1-220 | clone 7
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVPDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 9 | codons 1-220 | clone 9
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEGQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETSGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 10 | codons 1-220 | clone 10
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 13 | codons 1-220 | clone 13
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETSGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| 18 | codons 1-220 | clone 18
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVGSDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK
>36MAPR03| codons 1-220
PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI
FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL
DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI
YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK

References
Author Title Citation
Lwembe, R Anti-retroviral drug resistance-associated mutations among non-subtype B HIV-1-infected Kenyan children with treatment failure. J Med Virol, 2007