Isolate Data
| Patient | Isolate | Region | Year | Species | Subtype | Source | Clone Method |
| NYU36 | 36MAPR03 | Kenya | 2003 | HIV1 | D | Plasma | MC |
Treatment History
| Order | Regimen | Weeks |
| 1 | 3TC+ABC+DDI+RTI | 26 |
| 2 | AZT+DDI+EFV | 57 |
| 3 | D4T+DDI+EFV | 21 |
RT Sequence
| NRTIMajorDRMs | NRTIMinorDRMs | NNRTIMajorDRMs | NNRTIMinorDRMs | Polys | UnusualMuts |
| T215F | K103N, G190A | V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200R, Q207E |
| >36MAPR03| 2 | codons 1-220 | clone 2 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 3 | codons 1-220 | clone 3 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 4 | codons 1-220 | clone 4 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 5 | codons 1-220 | clone 5 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 7 | codons 1-220 | clone 7 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVPDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 9 | codons 1-220 | clone 9 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEGQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETSGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 10 | codons 1-220 | clone 10 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 13 | codons 1-220 | clone 13 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETSGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| 18 | codons 1-220 | clone 18 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSTNNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVGSDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK >36MAPR03| codons 1-220 PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALTEICTDMEKEGKISRIGPENPYNTPI FAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKNKSVTVLDVGDAYFSVPL DEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSMTKILEPFRKQNPEIVI YQYMDDLYVASDLEIGQHRRKIEELREHLLRWGFFTPDKK |
References
| Author | Title | Citation |
| Lwembe, R | Anti-retroviral drug resistance-associated mutations among non-subtype B HIV-1-infected Kenyan children with treatment failure. | J Med Virol, 2007 |